新的检测可以发现处于高感染风险患者体内的不明病原体
在《癌症、生物及治疗》杂志上，该大学佩雷尔曼医学院耳鼻咽喉系教授、副主任，该研究的领导者Erle Robertson博士和他的同事们应用所谓病理切片（Pathochip）的检测方法对复发性急性髓性白血病（AML）患者的组织样本进行检测。该患者是一名因为癌症接受化疗的中年男性，众所周知，化疗会削弱了免疫系统功能，增加了感染的易感性。结果，该患者发生了一种未知的真菌感染。
这种情况并非罕见；根据疾病预防控制中心（CDC）报告，每年在美国大约有60,000名癌症患者因白细胞计数过低而住院，其中每14名患者当中就有1名患者死亡。
不言而喻，快速识别感染原因是快速有效地治疗这些患者的关键所在。但是还存在一个主要的问题，那就是目前，医生对某些病原体缺乏有效识别技术。
其中一种病原菌是一种被称为根毛霉的罕见真菌，这是人类难治性真菌感染接合菌病的一个病因。这种真菌种类得花很长时间在实验室培养，有些根本就不能培养，这使得对患者的诊断极具挑战性。
然而，在他们的研究中，Robertson和他的同事们揭示了他们是如何应用病理切片（Pathochip）确定他们研究对象所患“未知”真菌感染的病因——根毛霉的种类。
病理切片（Pathochip）在将近24小时内检测出真菌感染的病因
研究人员介绍，病理切片（Pathochip）作为一种基因芯片技术能够检测出可能存在成千上万种病原体的人体组织样本。
该技术包含60,000个探头，可以同时检测所有已知病毒，以及各种细菌、真菌、寄生虫和原生动物。
“我们研究进行了很多测试来看看我们能否在实验室里识别病原体，只是为了看看病理切片（Pathochip）识别多种有机体的功效，我们能够识别所有接受测试的传染性病原体，”Robertson说。“但是，这是第一次，我们实实在在的在一名患者的样本里确定一种致病菌。”
利用病理切片（Pathochip）测试来自复发性急性髓性白血病（AML）患者的保存组织样本，研究人员能够在短短24个小时内就确定是两种根毛霉当中的一个种类造成患者的真菌感染。
对研究结果进行评论时，作者说道：
“这份报告强调了病理切片（Pathochip）作为在物种水平上确定微生物种类的诊断工具的价值，特别是对那些很难在大多数临床实验室中得以确定的种类。
它也将有助于医生获得关于患者感染状况的关键印象以便于做出相关治疗策略计划。”
病理切片（Pathochip）“填补了新一代测序方法的空白”
研究人员指出，还有其他的方法——比如新一代测序方法——能够识别未知病原体，但是这种技术也具有一些局限性。
例如，Robertson说，在进行新一代测序的情况下，需要在组织样本中存在高水平核酸以俚语确定病原体，且使用这种方法分析组织更为耗时。
“我们认为这项技术[病理切片（Pathochip）]在某些方面填补了新一代测序技术的空白，甚至能够进行更为精细的微调，因为我们检测各种不同样本的试剂或生物个体方面具有更高的灵敏度，无论是非生物或是生物，”Robertson说。“比如，我们可以识别土壤、植物组织、动物组织或人体组织中的样本。”
病理切片（Pathochip承诺将致力于临床应用，研究团队说，还需要进行更多的研究才能达到这个阶段的要求。“这将需要进行更为大量的研究，才能获得批准在医院临床一线的最终应用，”Robertson补充说。
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