hello 发表于 2017-4-4 20:21:52

求助PEDV全基因组序列分析

测序得到一株PEDV的全基因组序列,28kb,求怎样分析才能在毕业论文里面凑点字数。除了画进化树还有什么么?着急,求高手帮忙!多谢!

ipsvirus 发表于 2017-4-5 11:18:27

从功能看看
首先,你分离的PEDV毒株有什么特点?复制更强?毒性更强?
其次,根据分离毒株的特性,推测相关功能关联基因,再与正常毒株序列比对观察结果,如ORF3截断了,还是哪个关键氨基酸突变了
最后,如有时间可以做一些功能实验,没时间了的话就根据一些文献来推测突变功能,应该可以写很多
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