专题讨论植物RNA病毒
植物RNA病毒
植物dsRNA病毒主要有呼肠弧病毒科(Reoviridae)的植物呼肠孤病毒属(Phytoreovirus)如伤瘤病毒(Wound tumor virus，WTV)和水稻矮缩病毒(Rice dwarf virus，RDV)；斐济病毒属(Fijivirus)如甘蔗斐济病病毒(Sugarcane Fiji disease virus)；水稻病毒属(Oryzavirus)如水稻草丛矮化病毒(Rice ragged stunt virus)。另外双组分双链 RNA球状真菌病毒科(Partitiviridae)的两个属病毒成员也感染植物，一个是a潜隐病毒属(Alphacryptovirus)，其代表成员为白三叶草潜隐病毒1(White clover virus 1)，另一个是β潜隐病毒属(Betacryptvirus)，其代表成员为白三叶草潜隐病毒2。下面以植物呼肠弧病毒为例来介绍植物dsRNA病毒的转录和复制的基本特点。
植物dsRNA病毒
1.植物呼肠孤病毒的基因组及其编码产物
伤瘤病毒(WTV)、水稻矮缩病毒(RDV)和水稻瘦矮病毒(Rice gall dwarf virus，RGDV)是植物呼肠孤病毒属的3个病毒成员，它们通过叶蝉传播，侵染禾本科植物。植物呼肠孤病毒属各成员的病毒粒子均为二十面体对称结构，含有双层外壳蛋白，无包膜和糖蛋白突起。就RDV而言，其完整的RDV病毒粒子直径为 70nm，内壳直径为 53nm，外壳厚度为 17nm(T＝13)，内衣壳厚度是7nm，病毒粒子有260个壳粒，每个壳粒由三聚体构成，因而共有780个蛋白亚基。
植物呼肠孤病毒基因组包含12个dsRNA节段，根据它们在聚丙烯酷胺凝胶电泳过程中的迁移率(由慢到快)，依次被称为S1一S12。其中RDV除别 外，其他的dsRNA节段仅编码合成一种多肽(如下表) http://imga1.haotui.com/userdirs/2/a/biosky/attachments/month_0905/20090512_6b88ddc33a8417e770907qQUUH6zBb1m.gif
每个dsRNA节段的5‘端和3’端都有特异的末端重复序列，其序列为 5’GGU(C)……UGAU3’。植物呼肠孤病毒的末端重复序列可能与病毒的复制、转录、翻译和组装过程有关。
根据对RDV编码的蛋白质及其功能进行分析，发现S1节段的ORF位于正链的第36-4367位核苷酸，编码1444个氨基酸的P1蛋白，P1蛋白具有RNA依赖性RNA聚合酶(RNA dependent RNA ploymerase，RDRP)活性份节段编码P2蛋白，它是一种外壳蛋白，由1116个氨基酸构成，S4 ORF在第64－2247位核昔酸之间，编码约为 727个氨基酸的 P4蛋白，在 P4蛋白中存在有一个锌指结构和一个结合GTP的基序，RDV引起水稻植株矮化与P4蛋白的作用有关。SS节段的ORF长度为1260个核苷酸，它编码420个氨基酸的外壳蛋白，有人认为这种外壳蛋白决定了RDV侵染植物的严重程度 。
2. 植物呼肠孤病毒的转录与复制
在RDV病毒粒子中，携带有病毒基因组复制所需的病毒复制酶和甲基化酶。其病毒复制往往因脱壳而激活。首先在病毒核心以负链为模板进行全保留转录，合成+ssRNA(mRNA)，这一过程由病毒核心内的 RNA聚合酶和甲基化酶共同催化，随之所合成的+ssRNA(mRNA)离开病毒核心，但 dsRNA不离开核心，然后转录产物+ssRNA作为mRNA指导合成病毒复制所需的多肽或蛋白质。+ssRNA也可以作为模板合成负链 RNA，由二者互补结合重新产生子代病毒基因组，并经过组装进一步形成子代病毒粒子。
转自http://biosky.haotui.com/viewthread.php?tid=9423&extra=page%3D1%26amp%3Borderby%3Dviews
作者：jbclinnic
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