新型基因组平台建立全新HIV目标
【新型基因组平台揭示了新的HIV目标】来自斯坦福大学的研究人员开发了首次高通量、基于基因组的成像方法来研究蛋白质的稳定性。该方法已被用于鉴定HIV降解以增强其感染过程的几种未知的人类蛋白质。该平台被称为全球阵列蛋白稳定性分析(GAPSA),能够识别驱动细胞中蛋白质的破坏的电路,并且具有广泛的应用,以鉴定用于诸如阿尔茨海默病、癌症、自身免疫性疾病和感染性疾病的全新治疗目标。这项研究今天发表在《细胞报告》中。研究人员表示:“我们已经使用GAPSA来发现HIV-1辅助蛋白Vpu靶向的宿主蛋白,这是病毒复制的关键,我们选择VPU作为测试用例,因为尽管已知一些VPU目标,但我们怀疑有更多的VPU目标。事实上,GAPSA能够确定几种具有抗病毒活性的宿主蛋白,这些蛋白没有与HIV相关报道。”
VPU是针对先天免疫反应的HIV的武器,是身体对病原体的第一道防线。VPU触发了防止HIV感染的宿主蛋白的降解,从而帮助病毒克服感染和复制的障碍。
“在这项研究中,我们筛选了一组433个干扰素刺激基因(ISG),针对感染,针对VPU激活的基因,建立更全面的HIV细胞目标列表。鉴定VPU靶蛋白可为寻找阻断相互作用、潜在地保留宿主抗病毒蛋白和限制HIV感染的新药物创造机会。重要的是,该系统同样适用于其它逃避免疫系统的传染病,如埃博拉、流感等。”
“根据我们的知识,Gaspan是第一个以细胞为基础的阵列平台,用来筛选蛋白质的构建和周转。除了提供细胞工作原理的关键知识外,还可以应用该技术来鉴定特异性靶向致病蛋白的蛋白降解物,这可以为多种疾病提供新的治疗机会。
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