rojjer 发表于 2015-10-12 20:23:23

新型检测技术面世:能检测几乎所有已知病毒

[导读] 来自圣路易斯华盛顿大学的研究人员已经开发出了一种新的测试技术,能够检测几乎所有已知的能够感染人类和动物的病毒。这一测试有助于医生诊断感染,不管他们有没有相关的线索。


来自圣路易斯华盛顿大学的研究人员已经开发出了一种新的测试技术,能够检测几乎所有已知的能够感染人类和动物的病毒。这一测试有助于医生诊断感染,不管他们有没有相关的线索。

  据了解,这项被命名为 ViroCap 的测试的准确性仍然需要进行临床试验,可能还需要几年的时间才能使用在患者身上。不过,这项正在开发的技术已经提供给医疗服务提供者和相关的研究人员。

  到目前为止,我们已经发现了成千上万种能够导致人类和动物疾病的病毒,这使得医生在进行诊断的时候越来越困难,有时候还需要进行一系列不同的测试。现在,可用的测试不够敏感,只能检测出一些被怀疑是导致病人疾病的疑似病毒,并不能检测一些低水平的病毒。

  ViroCap 跟其他测试方式不同的是,医生们并不需要知道他们要寻找的是什么,儿科教授 Gregory Storch 表示,当一种疾病爆发的病原体还不可知或者经过标准试验之后也难以发现的时候,这项新的测试技术就会显得特别有用。

  这一测试的研究团队将最终的研究成果发表在了 2015 年 9 月 22 日的《基因组研究》上,对于他们的这项研究,Gregory Storch 教授和他的同事们对 ViroCap 检验的 14 例患者的大便、血液以及鼻腔分泌物进行了评估。

  标准测试只能在 10 名患者中监测到病毒,并且没能检测出 B 型流感病毒和疱疹病毒等常见的病毒。而新型的 ViroCap 测试技术则在剩下的 4 名患者中发现了在早期的基因组测序测试中错过的病毒。

  儿科讲师 Todd Wylie 表示:“这项测试非常非常敏感,它甚至可以监测到与基因密切相关的病毒变异株。”目前,病毒的轻微遗传变异往往不能用当前的可用测试进行详细的区分,同时还会让医生检测所有变种病毒的能力复杂化。

  在另外一组八例因为不明原因而发热的儿童患者中,标准测试监测到了 11 种病毒,而 ViroCap 成功发现了另外的 7 种病毒,其中包括一种通常是无害的但是可以导致部分人严重感染的呼吸道病毒。在这两组患者中检测到的病毒数量从 21 种增加到了 32 种,或者说数量飙升了 52%。

  研究人员在研究报告中写道:“我们已经穿件了一个目标序列的捕获面板,旨在收集感染脊椎动物宿主的 DNA 和 RNA 病毒的核酸,ViroCap 能够大幅提高宏基因组测序(MSS),并且已经应用于可言和临床效用。”
(仪器信息网)

晚风hit 发表于 2015-10-13 09:12:19

如此规模的基因分析如果想商用估计有待于超级计算机的变革
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