南京农大长江学者团队CEll子刊发表冠状病毒重组与进化成果 - 中国病毒学论坛|我们一直在坚持！

2016年3月21日，南京农业大学动物医学院以第一完成单位联合中国科学院微生物研究所,国家疾控中心等多家研究机构，在国际最顶级生物学期刊CELL杂志的子刊《Trends in Microbiology》(2014影响因子9.186)发表了题为“Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses”的论文。该文章第一作者和通讯作者为南京农业大学动物医学院长江学者周继勇团队的粟硕教授，共同通讯作者为中国科学院青年传染病专家毕玉海副研究员和中国科学院高福院士。

Figure 1. Global Distribution of Human Coronaviruses. (A) Green, blue, brown, and purple represent the global distribution of the NL63, HKU1, OC43, and 229E human coronaviruses,respectively. (B) Red and yellow represent the global distribution of MERS-CoV and SARS-CoV, respectively.

冠状病毒（CoV）感染主要引起呼吸系统（鸡传染性支气管炎病毒、犬冠状病毒）和消化系统疾病（猪传染性胃肠炎病毒、牛腹泻病毒、犬冠状病毒、猫冠状病毒等）。人的冠状病毒感染同样以呼吸系统疾病和消化道疾病为主要特征，但疾病发生程度有很大差异。到目前为止，主要感染人的冠状病毒有6种：229E、OC43、NL63、 HKU1、非典型肺炎病毒SARS-CoV和中东呼吸热综合征病毒（MERS-CoV）。其中SRAS-CoV在2003年引起了8273人感染，其中775人死于该疾病。MERS-CoV是2014年又一次爆发，截止到2015年12月31日，该病毒引起1621人感染，584人死亡，成为对人威胁和危害性极大的疾病之一。

文章利用大数据序列分析手段，用最新的生物信息学分析方法从流行病学调查、发病机理、进化和重组情况等方面对不同的冠状病毒进行了比较分析。随后，用大数据网络监测和分析病毒序列并预测潜在威胁的动物源性重组冠状病毒，最后作者也提出未来待解决的冠状病毒频发重组可能感染人的防控问题，该文章对于目前冠状病毒流行病学的研究和防控具有重要的指导和参考意义。

Human coronaviruses (HCoVs) were first described in the 1960s for patients with the common cold. Since then, more HCoVs have been discovered, including those that cause severe acute respiratory syndrome (SARS) and Middle East respiratory syndrome (MERS), two pathogens that, upon infection, can cause fatal respiratory disease in humans. It was recently discovered that dromedary camels in Saudi Arabia harbor three different HCoV species, including a dominant MERS HCoV lineage that was responsible for the outbreaks in the Middle East and South Korea during 2015. In this review we aim to compare and contrast the different HCoVs with regard to epidemiology and pathogenesis, in addition to the virus evolution and recombination events which have, on occasion, resulted in outbreaks amongst humans.