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标题: 如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图 [打印本页]
作者: 满清帝国    时间: 2015-5-13 08:52
标题: 如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图
来源：医学生学术

; I. f, c' `* F3 L1 ^' u
　　您还在为做统计图头痛不已吗？还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗？有没有什么解决的办法呢？
+ q6 R* M7 [4 ]4 e. w
　　小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图，所以今天总结了几种常用统计图的做法，教您轻松快速地做出漂亮的统计图，您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
; ]5 e. U( e& \  s) l8 u/ \. W
——正式开始——
9 L$ @( e' i' b  O
1. 折线图
2 w. ^; Y' I/ n5 A! X* l( v8 R
　　折线图最为统计图中很常见的一类图，它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据，因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值，所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图（XY graphs）。如下文实例。
3 f/ Q  m5 ~( \( A8 [+ V  L
1.1 根据Table1的1组原始数据（4个样本在4个时间点分别测得的OA值）做折线图
; S5 G: t. K+ D
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
  e1 T) P; g' n* i4 ~: ~4 Q! I
　　打开Graphpad prism 5软件，选择XY图（XY graphs），折线图图标，因为是原始数据，需要软件帮你计算均值和误差，因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少，这边的样本数是4，因此我们把样本数设为4，如下图：
5 h! m' {" X! z3 Y( O0 Y. X, ^4 e' I

* B; W  k3 Z0 B! J" ^

' T" \( L1 X& R/ a' `: e
　　在Data分栏中将数据粘贴进去，如下图
$ ~( a4 W3 M# e( K8 v9 R9 U

, J3 r6 d) G* q9 A

4 M1 b' {7 t1 b( J
　　软件就会自动帮你算出均值和误差值，并做好折线图，把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后，如下图一幅漂亮的折线图就做好了，简单吧?
& _9 W' s; O5 f! m1 Z- f
- ]0 F2 |' c* A$ \# l
1.2 根据Table2的原始数据（治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值）做折线图

( [4 u! S8 E: w7 `

) a1 X3 C- I! F  G2 K
9 \8 a% x* y) T& o3 }* q
　　打开insert 菜单的New Data Table功能，加入一张新的数据表，见下图

( G, ~1 K$ ~! T$ I+ q

- S3 S$ s9 P1 j# M

" g; d, L% q7 ?  w
　　仍然选择XY图（XY graphs），告诉软件样本数是4

0 u& q6 [! t1 h/ X

' h4 {/ L- H, N. @

& e# ^% t6 r. {+ m! r3 B$ c0 i
　　在Data栏中输入数据
( A. G$ w$ U% W+ k

8 d. q0 |: d6 Y; I7 X, A
% w1 ]6 z" Y6 O7 O
　　软件已经自动帮你把图做好了，稍微美化后得下图：

# W+ j/ h7 T; e! I* G
- q0 o& _) `' q/ o# L: ]8 l
% F" k: ?+ A% X- |
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
: i* n  N) T9 {& }. F; H  K
　　如果你的数据是用其他软件（excel,origin,etc..）已经处理过的，Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作，你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了，比如你想用Table3的1组数据做折线图
# k0 Q! ~/ E# L$ P
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
/ n$ w! b( m# z8 B6 V4 z( J4 X# Z
新建一个数据表，仍然选择XY图（XY graphs），告诉软件你输入的是计算好的值，见下图

1 l) u# R* @$ _# _
: k9 ?6 E: K3 U, K! O5 W$ @! c
( d: D, ]2 E. h) n/ a
在data栏中粘贴数据，如下图
6 z: C7 Z) r+ Z4 _) A! f

# g" N2 k& A9 `! S- L* r

( k- @9 P& [0 c" c. s  J
　　打开Graphs栏目下的Data3，看到软件已经做好了图，稍微调整一下字体的大小，就可以得出下图所示的折线图了：

, e6 r/ [8 h# n+ G+ M3 b# n( ?6 W
' s( [: g) Y- ^$ ?* Y6 O0 z, U
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
# {9 \1 c$ D2 L, O  @& I
　　如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图，步骤和1.3的一样。

. U- e1 _: S# Z0 F) d; i/ D  i

/ p0 E; R- i2 s9 g2 _+ @

) J, y9 z7 @2 l1 o; l, K6 Y
　　仍然选择XY图（XY graphs），告诉软件你输入的是计算好的值，见下图：

# a2 O  @; C' K) ^3 `5 F
0 {7 b( @3 g: ]4 l2 i* [
1 s: r) [2 H6 V7 X6 t
　　将数据粘贴进去
1 I9 q+ R6 l  s/ x* E

/ ~6 {# n* m$ W6 o) J

! {! @$ q& @  s" p
　　软件即时生成的图如下图所示：

: P' F3 I) ^1 M5 R2 L! O4 M6 L
4 Y6 p! U& Z# |  W8 O! S; k! R8 _
( S$ L, X$ E, e
折线图的处理讲完了，简单吧，让我们来看看柱状图怎么做
9 g  l; s6 Y' @' {5 j
2. 柱状图

( D4 f# U: y- A. {- M& E) C
　　柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异，和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值，因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同，见下文的实例
1 a2 |' \# H5 O
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
  Y* U) {/ `2 B2 w+ c  [; ?
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
8 A) h: P/ p  b# f
　　选择Column graphs栏，因为该栏默认输入的都是原始数据，因此没有输入样本数的地方，只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
0 k& p. b7 i, ]+ i* [+ y$ u

$ T4 Y8 ?2 g, ^: U8 A, Z  n
, r, V+ o5 J9 H9 t; j: T
在Data分栏中输入以下数据
* G, D0 V# D8 H: ~/ v# y

$ a6 g) f, u) Y

# R4 Y- s/ y$ P) }
软件就会自动帮你算出均值和误差值，并做好柱状图，见下图：
/ a& _1 e% Y5 H  V

( c. ]0 N+ c5 ~$ _& z
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
' f6 u- U; p1 N( ~" K
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

! @- O9 N! t$ u' I
　　这次因为涉及到两组数据比较，所以我们选择grouped栏，图表类型选择柱状图，因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据，因此有输入样本数的地方，这边的样本数是4，因此我们相应地设置样本为4，见下图：
, m7 Q; q, S& O" H" x' H/ H
4 [! p+ w6 K5 @, {/ [! }
+ P; U% y# q: [& ?
　　在Data分栏中输入以下数据
) D& {4 \" l. f! d; v1 \+ b4 z
; M: O* H# u/ V' Y# c
  c, n" i. m3 b# D  I! }8 A8 q
　　软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图，如下图。

% @- T# c5 I3 a5 l7 @
3 G  N7 a8 o' ~& r
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad，现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

* k2 V' A; W& n4 s5 |
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
! j& i8 L8 H$ M$ s
　　仍然选择Grouped栏，告诉软件你输入的值是已经计算好的，如下图

1 f9 U* R6 _$ {3 }! W1 x

1 n& C( X- R6 S4 E
; h6 N1 ^# Q1 X- V# P% f$ V
　　软件及时生成柱状图，如下图
) X1 O* l8 u' g3 J
' L& H+ r* f9 J
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
7 z' K' U, Z9 K2 L: S
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

: X# J+ }9 K" ~9 H" ?: A' W3 a% S
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
( Q6 b( h  ^8 W% e% ]
　　操作步骤和2.3一样，只需多输入一组数据，仍然选择Grouped栏，告诉软件你输入的值是已经计算好的，如下图
/ z; s! [, f  h) U
8 m7 D- V% M8 W# F# G

2 n4 [3 J6 X" m; n0 _7 ]2 V9 T
在data栏中输入数据
8 {! u) D4 O. y, b2 j

# S9 z: T& h. f% i

* U- F' N  W) l( v$ ^# d
软件即时生成的图如下图
2 `8 i7 O  @3 F4 P# e: A; y

% c  w- i$ d; F- \- v8 d

# X1 L7 g% g' T0 [; |
折线图和柱状图的处理都讲完了，在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律：
: h6 Y, j4 k9 E+ E2 }9 L" R
一、折线图，散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图，箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏，处理加工过的数据一般选择group栏。

0 T2 x. J5 S1 f
3. 组合和导出图片
  I: O) {4 Q$ B5 o. u, e- b2 ^, ]
点击layout栏，出现下图所示界面
, d8 l- \$ }7 S0 d' D. x' F1 L5 x

0 X$ c( @1 `) ~) r

% Q' e: @7 |' M4 W8 s9 o
* ]( R, f9 X1 }5 t0 ^  \
　　根据你的图片的数量，选择合适的布局，下图选择的是6张图分成3排排列
: z; ]; v( J9 g. w" q
4 Y! E6 P* v! U& P" I

* ]7 ~. L9 F& E  f; ?
　　将做好的图片拖到对应的方格中，用添加文章工具加入图片编号，完成后如下图所示

. d  m1 Y6 P9 a4 w( R* g2 @

/ l8 u4 J* b9 s

" P7 e, n9 |9 O2 b9 m- m9 ^
　　然后导出图片：点击File目录下的Export，出现下图所示的界面，选择好符合相关SCI杂志要求的格式，分辨率和宽度，如下图
; `3 a* [# }: G. C
. ]7 A$ P  r- e( ^
$ p0 l) b* X* F/ b
　　点击ok，一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了，见下图
! n8 t4 w: }9 @# w3 i, f1 r

( w" x0 C* l4 Q: b3 a7 ^# I: D
作者: 满清帝国    时间: 2015-5-13 08:55
补充，对于样本量少于5的Groups图，不建议做柱状图，而应该做散点图。
作者: walkundersky    时间: 2015-5-13 09:12
满清兄有心了，前几天刚聊到这个软件，就分享出教程了！
2 t6 m9 P+ y5 t5 g$ |  x. y6 U' h) O/ y
$ B# x; k5 R: k8 j( _4 ^
比起SAS、SPSS来说，这个GraphPad Prism易学易用，建议微信号推广一下         
作者: 满清帝国    时间: 2015-5-13 09:25
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12& V- ]( o5 L/ N& l. u
满清兄有心了，前几天刚聊到这个软件，就分享出教程了！

% w  {) c. g4 n, z8 z  |刚好微信圈有这个，就转过来了。
作者: qupanke    时间: 2015-5-13 17:01
很棒的软件啊！表示喜欢！



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