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标题: [转移贴]分子模拟软件－SYBYL安装 [打印本页]

作者: cao1976 时间: 2015-6-10 12:49
标题: [转移贴]分子模拟软件－SYBYL安装
原始贴见http://biosky.haotui.com/thread-6354-1-7.html

虚拟机安装的经验，想试的可以试试，我重复成功才放出来的：
A.安装：
用虚拟机--可移动设备把iso文件挂到linux的 /mnt/cdrom/ 。cd 回根目录/，运行/mnt/cdrom/install.sh进行安装，最好前3个CD的全部安装。

B.我是用root建目录/tripos和/usr/local/flexlm/licenses,改权限为普通用户读写，sybyl7.3安装在/tripos/sybyl 。安装完，复制CD1的crack文件夹到/tripos，进入carck文件夹，复制license.dat到/usr/local/flexlm/licenses/，用文本编辑器打开license.dat，另存到/tripo/AdminTools10.8/tables/,名字为license_file的文本文件。

C.每次reset进入系统普通用户后，终端下进入/tripos/AdminTools10.8/bin/linux，运行./lmgrd triposlm ，如果最后一行出现(lmgrd) triposlm using TCP-port 12345 就没问题了，每次reset只要运行一次./lmgrd triposlm 或者在注销时保存当前设置，以后就不用运行这个命令了。运行/tripos/sybyl/bin/linux/sybyl ，就可以进去sybyl7.3的gui 。

安装完的出现license找不到的说明tables下没有license_file这个文件，出现CPU等提示的，说明licenses下没有license.dat这个文件或有了文件没有运行./lmgrd triposlm 。安装好的直接从步骤B开始试。

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RHEL4U2WS直接安装（非虚拟机）SYBYL7.3

假设sybyl7.3的4个cd在/tmp/sybyl73/里面
打开第一个终端
$su
password
#mkdir -p /biosoft/tripos
#chmod -R 777 /biosoft/tripos/
#mkdir -p /usr/local/flexlm/licenses/
#chmod -R 777 /usr/local/flexlm/licenses/
#mount -t iso9660 -o loop /tmp/sybyl73/Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD1.iso /media/cdrecorder/
#cp /media/cdrecorder/crack/license.dat /biosoft/tripos/
此时开第二个终端,目的是在普通用户下安装sybyl7.3
$/media/cdrecorder/install.sh
安装目录选/biosoft/tripos/sybyl/
license文件选择/biosoft/tripos/里面的,不选/media/cdrecorder/crack/里面的是因为后面的做法影响接下来的umount.
浏览器选/usr/bon/mozilla
提示换cd2时候,在第一个终端里:
#umount /media/cdrecorder/
#mount -t iso9660 -o loop /tmp/sybyl73/Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD2.iso /media/cdrecorder/
提示换cd3时候,在第一个终端里:
#umount /media/cdrecorder/
#mount -t iso9660 -o loop /tmp/sybyl73/Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD3.iso /media/cdrecorder/
提示换cd4时候,在第一个终端里:
#umount /media/cdrecorder/
#mount -t iso9660 -o loop /tmp/sybyl73/Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD4.iso /media/cdrecorder/
安装完毕后,在在第一个终端里:
#umount /media/cdrecorder/
#ls /biosoft/tripos/AdminTools10.8/tables/(确认里面存在license_file与否,如果没有,用文本编辑器打开后面说到的license.dat,然后另存为license_file)
#cp /biosoft/tripos/license.dat /usr/local/flexlm/licenses/
#cd /biosoft/tripos/AdminTools10.8/bin/linux/
#./lmgrd triposlm
#/biosoft/tripos/sybyl/bin/linux/sybyl

注消是选择"保存当前设置",下次可以用"运行应用程序"--下箭头下拉选择/biosoft/tripos/sybyl/bin/linux/sybyl--"带文件运行",同时选择"在终端里运行"以后用"运行应用程序"运行sybyl就很方便了.

只有标记部分
此时开第二个终端,目的是在普通用户下安装sybyl7.3
$/media/cdrecorder/install.sh
安装目录选/biosoft/tripos/sybyl/
license文件选择/biosoft/tripos/里面的,不选/media/cdrecorder/crack/里面的是因为后面的做法影响接下来的umount.
浏览器选/usr/bon/mozilla
在第二个终端运行,目的是安装sybyl.

太长名字的在终端输入麻烦，有个技巧，在输入前面一到几个字符后，可以点击tab键来补充到出现该目录里相似文件名出现差异的地方为止，比如Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD1.iso ，在输入T点tab键会补充到Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD，接着打1，变为Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD1，再点tab，就成Tripos.Sybyl.v7.3.UNiX.ISO-TBE-CD1.iso了，这样输入就又快又很少出错。

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