一、ELISA检测人杯状病毒
采用IDEIA™ Norovirus试剂盒(DakoCytomation公司),仅限于检测人杯状病毒中的诺如病毒(属)GⅠ和GⅡ型。
(一)检测前准备工作
1.粪便标本处理:加入1ml样品稀释液(sample diluent)至1.5ml EP管中,加入0.1g固体粪便标本或0.1ml液体粪便标本,置于漩涡震荡器混匀,室温静置10min,室温下≥5000rpm离心5min。
2.阴性对照:将1ml样品稀释液(sample diluent)加至标记好的小瓶中作为阴性对照。
3.阳性对照:1ml对照稀释液(control diluent)溶解阳性对照,使用前混匀。
4.洗液的配制:1倍体积的洗液浓缩液,加9倍体积的去离子H2O。当天用当天配。
(二)标本检测
1. 将需要数量的微孔板置于微孔板架上。
2. 每孔加入100µl 10%便悬液或阴性对照或阳性对照(每次检测均需加一个阳性对照和一个阴性对照),20~30℃静置60±5min。
3. 每孔加入2滴(或100µl)酶结合物(conjugate),用枪头轻柔混匀。
4. 每孔加入350µl洗液,洗5次,在卫生纸上拍干。
5. 每孔加入2滴(或100µl)底物液(Substrate),20~30℃静置30min。待蓝色显现后迅速观察颜色。
6. 每孔加入2滴(或100µl)终止液(Stop solution),充分混匀。
7. 读取OD450值,打印输出或记录OD值。结果必须在加入终止液后30min内读取。
(三) 检测结果的判定:
1. 阴性对照:肉眼观察无色或OD450值<0.15。
2. 临界值:OD450值=阴性对照OD450值+0.10。
3. 阳性对照:肉眼观察呈现独特的蓝色或OD450值>0.50。
4. 标本:肉眼观察蓝色比阴性对照颜色深判定为阳性,肉眼观察无色判定为阴性;或者OD450值大于临界值判定为阳性,小于临界值判定为阴性,OD450值在临界值±0.01范围内判定为可疑,应重复检测。
(四)注意事项:
1.打开后的96微孔板应置于可封口的有干燥剂的口袋中贮存于2~8℃,打开后6周内用完。
2.终止液中含0.3mol/L硫酸,避免接触到皮肤和粘膜。如果终止液接触到这些部位立即用水冲洗。
3.未用完的阳性对照可在2~8℃贮存1个月,长期贮存应分装存于-20℃。
4.底物液避光保存,不要使用已经变蓝的底物液。
5.避免污染。
二、人杯状病毒RT-PCR检测
可以同时检测出人杯状病毒中诺如病毒(属)和扎如病毒(属)。
(一)病毒RNA提取:
1.提取前的准备工作:
(1) 将1ml Buffer AVL加入装有低压冻干的Carrier RNA中,彻底溶解Carrier RNA后,将溶有Carrier RNA的Buffer AVL转入至Buffer AVL瓶中,彻底混匀。分装贮存于2~8℃。如果在2~8℃时,Buffer AVL/Carrier RNA溶液形成沉淀,可在80℃重新溶解,注意加热的时间不能超过5min,用前冷却至室温。Buffer AVL/ Carrier RNA溶液不能加热超过6次。
(2) 加入合适比例的96~100%的酒精至Buffer AW1中,19ml的Buffer AW1加入酒精25ml。
(3) 加入合适比例的96~100%的酒精至Buffer AW2中,13ml的Buffer AW2加入酒精30ml。
2.病毒RNA的提取:
(1) 在1.5ml EP管中加入560µl 已加入Carrier RNA的Buffer AVL。
(2) 将140µl 10%便悬液加入至EP管中的Buffer AVL中,vortex混匀15sec。
(3) 室温(15~25℃)孵育10min。
(4) 将1.5ml EP管轻微离心,以去除管内的液滴。
(5) 在管内加入560µl 96~100%的酒精,vortex混匀15sec。混匀后,将1.5ml EP管轻微离心,以去除管内的液滴。
(6) 小心的将630µl步骤5中的溶液加入至已放入至2ml收集管中的QIAamp离心柱中,注意不要弄湿柱子边缘。盖上盖子,8000rmp离心1min。将QIAamp离心柱放置至另一干净的2ml收集管中,弃去包含有滤过液的收集管。
(7) 小心打开QIAamp离心柱的盖子,重复步骤6。
(8) 小心打开QIAamp离心柱的盖子,加入500µl Buffer AW1。盖上盖子,8000rmp离心1min。将QIAamp离心柱放置至另一干净的2ml收集管中,弃去包含有滤过液的收集管。
(9) 小心打开QIAamp离心柱的盖子,加入500µlBuffer AW2。盖上盖子,14,000rmp离心3min。弃去收集管中的滤过液,14,000rmp离心空柱子1min。
(10)将QIAamp离心柱放置入干净的1.5ml离心管中。弃去包含有滤过液的收集管。小心打开QIAamp离心柱的盖子,加入60µl Buffer AVE至离心柱中,盖上盖子,室温孵育1min。8000rmp离心1min。(2×40µl的Buffer AVE洗脱两次,能增加产量。)病毒RNA进行反转录,或贮存于-20℃或-70℃备用。
(二)人杯状病毒ssRNA的反转录:
在0.2mlEP管中配制如下逆转录体系。
引物 | 位置 | 方向 | 核酸序列(5’–3’) |
289H | 4865-4886 | - | TGACGATTTCATCATCACCATC |
289I | 4865-4886 | - | TGACGATTTCATCATCCCCGTC |
290H | 4568-4590 | + | GATTACTCCAGGTGGGACTCCAC |
290I | 4568-4590 | + | GATTACTCCAGGTGGGACTCAAC |
290J | 4568-4590 | + | GATTACTCCAGGTGGGATTCAAC |
290K | 4568-4590 | + | GATTACTCCAGGTGGGATTCCAC |
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