关于H3 numbering和H1 numbering的问题

bestar

我最近在看H5N1，经常在文献中某一位氨基酸位点，以H3 numbering，或者H1 numbering。我不知道这是怎么处理的？如果我知道H1的HA的抗原位点或者受体识别位点，那么能不能知道H5的HA的抗原位点或受体识别位点？希望大家帮帮忙，谢谢http://biosky.haotui.com/thread-23457-1-2.html
作者yanfengchen

bestar

1 、 HA0编码：
以M为编码起点，即ORF翻译的整个蛋白序列，这种方式比较少见。

2 、 HA1编码：
以HA1序列为编码，即首先去掉信号肽然后再编码位置。

3 、 H3编码(H3 numbering)：
以H3亚型的编码表示，即多个亚型的序列一起比对，然后去掉信号肽， 最后都以H3亚型的位置编码。


部分信号肽长度
H1:17     H2:15  H3:21  H5:16  H6:16  H7:18  H8:17   H9:18   
              H10: 17    H11:16   H12:17

cloud发表于 2011-7-10