【转移贴】标准遗传算法子对蛋白质2D折叠模拟的影响

hantavirus

原帖于chinachao发表于 2009-10-18 09:35
李绍新1，张延娇2 (广东医学院1．物理学教研室；2．生理科学实验室，广东湛江524023)
摘要：目的改进标准遗传算法以提高蛋白质结构的预测效率。方法在标准遗传算法的基础上引入蒙特卡罗局
部优化策略、克隆体过滤策略、多胎竞争选择策略等，在均匀变异的基础上，引人一系列结构突变箅子。利用改进的遗传
算法对标准蛋白质序列进行二维折叠模拟。结果与其他算法相比，利用改进的遗传算法搜索到了HP60和HP64序列
能量更低的构型。结论引入的遗传策略和突变算子增强了遗传算法的寻优能力。改进的遗传算法是个极具潜力的蛋
白质结构预测方法。，
关键词：遗传算法；2D折叠模拟；HP模型