2019-nCoV最新文献实时更新

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中国武汉市最近发生的一系列肺炎病例是由新型β冠状病毒，2019年新型冠状病毒（2019-nCoV）引起的。 但是对于患者的流行病学，临床，实验室和放射学特征以及治疗和临床结局，不是很清楚。中国病毒学论坛旗下微信号病毒学界将近期2019-nCoV最新研究进展进行汇总，供大家参考。

2020年1月24日，北京中日友好医院曹彬及北京协和医学院王建伟共同通讯在国际顶级医学期刊Lancet 在线发表题为“Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China”的研究论文，该研究表明发病时的常见症状为发烧，咳嗽和肌痛或疲劳。全部患者均患有肺炎，胸部CT检查发现异常。并发症包括急性呼吸窘迫综合征，急性心脏损伤和继发感染。13例（32％）患者被送入ICU，六例（15％）死亡。与非ICU患者相比，ICU患者的血浆IL2，IL7，IL10，GSCF，IP10，MCP1，MIP1A和TNFα更高。总而言之，2019-nCoV感染引起严重的呼吸系统疾病，类似于严重的急性呼吸系统综合症冠状病毒，并与入ICU和高死亡率相关。该研究认为对起源，流行病学，人类传播的持续时间以及疾病的临床范围的认识方面的重大差距需要通过未来的研究来弥补。

香港大学Kwok-Yung Yuen团队在国际顶级医学期刊Lancet 在线发表题为“A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster”的研究论文，该研究首次发现了人传人的证据。
2020年1月24日，王辰院士及高福院士等人发表题为“A novel coronavirus outbreak of global health concern”的点评文章，系统总结了武汉肺炎的进展情况，同时指出许多重要问题尚未得到解答，包括其起源，程度和在人类中传播的持续时间，感染其他动物宿主的能力以及人类感染的范围和发病机理。

2020年1月25日，世界顶级医学杂志新英格兰医学杂志NEJM 发表研究论文“A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019”，该研究由中国疾控中心领衔，作者还来自北京地坛医院、武汉金银坛医院、湖北疾控中心、中国科学院生物安全大科学研究中心、山东第一医科大学。该文通讯作者为高福、武桂珍和谭文杰。该研究通过对肺炎患者的样本进行全基因组测序发现了一种从未见过的乙型冠状病毒属（betacoronavirus）病毒。该病毒从感染者气道上皮细胞中分离出，随后将其命名为2019-nCoV，这种病毒归属于Sarbe病毒亚属，正冠状病毒亚科，但形成了另外一簇的进化分枝。2019-nCoV与MERS-CoV和SARS-CoV都不同，它成为可以感染人类的冠状病毒科中的第七个成员。对该病毒的加强监控和进一步的研究正在进行中（由中国国家重点研发项目和国家传染病防治重大专项资助）。同时，NEJM 同期发表题为“Another Decade, Another Coronavirus”的社论文章；此外，NEJM 同期还发表题为“A Novel Coronavirus Emerging in China — Key Questions for Impact Assessment”的观点文章。
伦敦卫生与热带医学学院David L Heymann发表题为“Data sharing and outbreaks: best practice exemplified”点评文章
柳叶刀编辑部发表题为“Emerging understandings of 2019-nCoV”的文章
昆士兰大学Deanna Anderlini，美国科罗拉多大学奥罗拉分校Matthew Wynia，
维滕/赫德柯克大学Diethard Tauschel连发3篇表题为“Cultivating awareness of the Holocaust in medicine”的通讯文章，共同聚焦武汉肺炎。

2020年1月24日，Elisabeth Mahase在BMJ 在线发表题为“China coronavirus: what do we know so far?”的文章，系统回答了最新肺炎的问题；

2020年1月23日，JAMA 发表题为“Coronavirus Infections—More Than Just the Common Cold”的观点文章，系统总结了最新的武汉肺炎的进展。

1月25日，生物预印本网站BioRxiv更新4篇关于武汉新型冠状病毒的研究论文，医学预印本平台medRxiv也在24日更新一篇，共同分析了新型肺炎的流行病学特征和该病毒的全基因组特征。
模拟中国2019年新型冠状病毒疫情流行趋势 西安交通大学及南京医科大学等机构研究人员，及时评估了处于初始阶段的中国新型冠状病毒（2019-nCov）疫情，结果显示2019-nCov的传播能力与SARS和MERS相当，但致死率较低。
数学模型表明，2019- nCov在中国可能导致8042例（区间为4199-11884）感染和898例（区间为368- 1429）死亡，对应的致死率为11.02%（区间为9.26%-12.78%）。这低于SARS的14%到15%和MERS的34.4%，表明2019-nCov可能是冠状病毒家族中毒性较小的毒株。然而，研究人员承认，在疫情的早期阶段，由于许多感染病例尚未发展到关键阶段，死亡病例可能未得到充分报告。
2019- nCov的基本繁殖数量（R0）是病毒最初可传播性的一个指标，在2019年12月12日开始流行时，估计为4.71，但到2020年1月22日，其有效繁殖数量（Re）下降到2.08。如果继续下降趋势，假设疫情不再复发，则在疫情开始后3个月内（77天），Re将下降到1以下，说明疫情将在3个月内逐渐消失。与SARS和MERS相比，2019-nCov的R0与SARS相似。研究人员还认为，快速诊断并保证病例及时隔离，以及综合干预措施，将对2019-nCov疫情未来趋势产生重大影响。然而，中国正面临春运高峰，并且疫情已蔓延至境外，有必要进一步研究其潜在的时空传播模式和批准新的干预策略。
相关论文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.23.916726
武汉爆发冠状病毒疫情：加强监测对预防新地点的持续传播至关重要 截至2020年1月24日，源自中国武汉的新冠状病毒肺炎爆发已造成830例确诊病例，包括26例死亡。该病毒（2019-nCoV）已在中国其他地区和其他国家传播，包括韩国、泰国、日本和美国。
幸运的是，还没有证据表明在中国以外的地方出现了持续的人际传播。在这里，英国牛津大学研究人员评估了，2019-nCoV到达其他国家时，可能出现的持续传播风险。研究人员使用47名受感染患者从症状出现到住院治疗的时间数据，估计了输入病例之后出现持续人际传播的概率。结果显示，2019-nCoV与SARS冠状病毒具有类似的传播能力，输入病例之后出现持续人际传播的概率为0.37。然而，如果通过严密的监测，可使从症状出现到住院的平均时间减半，这样一来输入性病例导致持续传播的概率仅为0.005。这强调了世界各国当前病毒监测工作的重要性，以确保正在发生的疫情不会成为大规模的全球流行病。
相关论文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.24.919159
从SARS-CoV到武汉2019-nCoV：历史会重演吗?
中国正在发生的大规模肺炎疫情是由2019-nCoV引起的，这是一种新型冠状病毒，与SARS疫情中的SARS- Cov高度相似。由于仍处于早期阶段，暴发的原因和后果在很大程度上仍不清楚。
由于新病毒的许多方面与2003年的SARS相似，SARS疫情爆发的知识、模式和教训对于应对2019-nCoV暴发是宝贵的资源。利用SARS疫情暴发早期的流行病学调查和分析，中山大学和美国波士顿大学等机构研究人员，评估和比较了这两次暴发的特征，并预测了当前2019-nCoV爆发的可能结果。数据显示，与SARS-CoV一样，2019-nCoV具有较高的人际传播能力，医护人员和家庭成员是高危人群。由于早期爆发阶段恰逢中国春运高峰，因此防控病毒传播是一个挑战。在这种情况下，2019-nCoV超级传播者的出现和活动轨迹难以确定。利用迄今报告的病例数据，研究人员建立了logistic模型，预测了2019-nCoV病例的累计和每日计数。结果显示，2019-nCoV累计病例数约为SARS总病例数的2-3倍，峰值预计在2月上旬或中旬到来。在应对方面，应该限制或禁止区域性迁移，以防止超级传播者的出现和移动，同时迫切需要在全国范围内加强监控并采取有效措施来控制这种流行病。
相关论文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.24.919241
新型冠状病毒的全基因组特征 不断出现的感染性疾病，包括SARS、MERS、Zika以及高致病性流感，对于公众健康构成严重威胁。这些新型病毒出现的时间、地点和方式仍然很大程度上未知。复旦大学张永振等人研究了来自武汉海鲜市场的7名患病人员。研究人员从一名病患身上收集了支气管肺泡灌洗液，利用测序技术鉴定出了该新型RNA病毒WHCV。病毒全基因组分析显示，该病毒与SARS病毒非常接近（89.1%的核苷酸相似性）。SARS病毒样本来自蝙蝠，并有基因重组历史。
相关论文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.24.919183
MedRxiv：新型冠状病毒2019-nCoV：流行病学参数的早期估计和流行病学预测
2019年12月，一种新型冠状病毒（2019- nCov）被认为出现在中国武汉的人群中。自那时以来，武汉的确诊病例数量迅速增加，中国其他城市和国家也出现了确诊病例（截至2020年1月23日）。
英国兰卡斯特大学、美国佛罗里达大学等机构研究人员开发了一个传播模型，评估关键的流行病学措施，并预测疫情的可能进程，以及进出武汉的旅行限制的潜在影响。结果显示，至1月20号，武汉市约有3500名感染病例（预测区间3050-4017）；从2020年初到21日，预计总感染人数约为11000余例（预测区间9217-14245）。如果不加防控，到2020年2月4日，预计2019 n-CoV感染例数为191529（区间为132751-273649）。研究人员还估算了2019-nCoV病毒人际传播能力，认为其比SARS和MERS病毒要高，但在疫情早期与SARS的相近。而且，作者认为，进出武汉的交通管制不太可能有效地阻止全国范围内疫情的传播，即使有效地减少99%的交通，至2月4日武汉之外的疫情也只能降低24.9%。研究还表明，与其他突发性冠状病毒相比，2019-nCoV的基本繁殖数量更高，这意味着遏制或控制这种病原体可能会更加困难。不过，研究人员表示，由于模型基于OAG交通分析数据库信息，不包括铁路和公路运输，因此可能低估了当地的连通性，也没有考虑随机效应，因此可能低估了限制旅行措施的潜力。
相关论文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.23.20018549
中国科学院上海药物研究所和上海科技大学联合研究团队发现一批可能对新型肺炎有治疗作用的老药和中药

饶子和/杨海涛团队快速表达了2019-nCoV水解酶（Mpro）并获得了高分辨率晶体结构，在此基础上，联合小组综合利用虚拟筛选和酶学测试相结合的策略，重点针对已上市药物以及自建的“高成药性化合物数据库”和“药用植物来源化合物成分数据库”进行了药物筛选，迅速发现了30种可能对2019-nCoV有治疗作用的药物、活性天然产物和中药，建议在2019-nCoV感染肺炎患者临床治疗中予以考虑和关注。研究团队后续将继续深入开展针对性的抗2019-nCoV活性测试，为临床研究和治疗提供更加直接的指导。
候选药物包括蛋白酶抑制剂茚地那韦（Indinavir）、沙奎那韦（Saquinavir）、洛匹那韦（Lopinavir）、卡非佐米（Carfilzomib）、利托那韦（ritonavir）等12种抗HIV药物，2种抗呼吸道合胞病毒药物，1种抗人巨噬病毒药物，1种抗精神分裂症药物，1种免疫抑制剂以及2种其他类药物；研究发现含有“二苯乙烯”结构的孟鲁司特以及植物药活性成分虎杖苷和脱氧土大黄苷与Mpro结合较好，可能对病毒有抑制作用；在前期抗SARS研究及计算机模拟基础上发现老药肉桂硫胺、环孢菌素A可能对2019-nCoV有效，其中肉桂硫胺是上世纪70年代用于抗精神分裂症的药物，对冠状病毒3CL水解酶具有抑制作用，免疫抑制剂环孢菌素A可以阻止病毒的核衣壳蛋白与人的环孢亲和素A相互结合，已有研究表明联用干扰素和环孢菌素A能显著抑制冠状病毒在人类支气管和肺部复制及造成的组织损伤。研究还发现，虎杖、山豆根等中药材中可能含有抗2019-nCoV有效成分。
应急攻关团队已经完成了肉桂硫胺等公斤级合成工艺，制剂工作正在进行；环孢菌素A的胶囊制剂制备工艺也已经完成；其它部分药物的合成工艺探索也已完成。欢迎相关企业和研究机构与攻关团队合作，共同抗击2019-nCoV。
上科大和上海药物所联合研究团队预先公布新型肺炎冠状病毒3CL水解酶高分辨率晶体结构

继上海科技大学免疫化学研究所和中国科学院上海药物研究所抗2019-nCoV冠状病毒感染联合应急攻关团队公布30个可能的抗2019-nCoV冠状病毒老药和中药后，联合攻关团队及时公布由上海科技大学饶子和/杨海涛课题组测定的2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶体结构，以便有更多的科技工作者、特别是从事药物研发的科技人员使用。

晶体结构的坐标可到PDB蛋白质结构数据库(Protein Data Bank, PDB)下载(PDB ID: 6LU7）。饶子和院士和蒋华良院士强调，希望大家一起努力，研发出更多更好的抗新型肺炎药物

新型冠状病毒国家科技资源服务系统正式启动

为做好新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控和科研工作支撑，由国家微生物科学数据中心和国家病原微生物资源库联合建设，中国疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、中国科学院微生物研究所、中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室等单位共同建设的新型冠状病毒国家科技资源服务系统(http://nmdc.cn/#/nCoV)（以下简称服务系统）于今日正式启动。

该服务系统启动后，发布了由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所成功分离的我国第一株病毒毒种信息及其电镜照片、新型冠状病毒核酸检测引物和探针序列等国内首次发布的重要权威信息。同时，服务系统整合了全球冠状病毒基因及基因组大数据，建立了全球冠状病毒资源大数据平台。
服务系统启动后，将随着新型冠状病毒科研工作的进展，及时动态发布新型冠状病毒相关科技资源和科学数据的权威信息，为新型冠状病毒科学研究提供重要支撑，并为应对当前新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控提供科技资源专题服务。同时，将进一步完善冠状病毒大数据平台，整合病原体的基因型与表型信息，以期实现传染病的早期预警和预防，为国家生物安全提供数据保障。该服务系统获得国家科技资源共享服务平台、艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项（2018ZX10734404、2018ZX10101004）、中国科学院地球大数据先导A类专项（XDA19050301）、中国科学院战略生物资源计划（KFJ-BRP）、科技部重点研发计划项目新型冠状病毒感染的肺炎疫情应急（2020YFC0840800、2020YFC0840900）等项目支持。本期编辑：Tony

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Drug treatment options for the 2019-new coronavirus (2019- nCoV)

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A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019

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A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019

hantavirus

学习了，很好的创意