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PUBMED高级检索技巧

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发表于 2015-6-12 15:03:10 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
在以上两章我们已经掌握了如何运用初级检索法达到检索文献的目的。不过在我们所要检索的问题相对较为复杂的时候,仅仅靠初级检索就远远达不到需求了。为了使得我们的检索更为准确,高效,我们可以充分利用PubMed所提供的高级检索功能。
在你进入PubMed首页之后,在检索框的下方,有PubMed所提供的五个重要的功能按钮,即Limits按钮, Preview/Index按钮, History按钮, Clipboard按钮,及Details按钮。如果你能够充分的利用好这几个功能按钮,那你的检索则很有可能事半功倍。

首先,让我们来简单的了解一下这几个按钮的主要功能。
1. Limits 按钮
当你单击Limits按钮后,你可以看到如下界面。(fig1)




在这里可以进行以下设定:
• 将搜索范围设定在一个特定的域。
• 将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。
• 也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型(如综述)。
• 设定只搜索包含摘要的文献。
• 设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。
• 设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库(如Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目)。
例如 在All Fields域选择下拉菜单里,你可以把搜索词限定在一个特定的域,缺省设置是所有的域;打开下拉菜单就可以选择所需的域名了。又如"Only items with abstracts"指只检索那些有文摘的记录(1975年前出版的文章的记录中没有文摘)
2.Preview/Index 按钮
在按下Preview/Index按钮之后,我们可以进行的设定有:
• 在显示条目之前显示所查到的文献数。
• 随时通过增加查询单词来修改查询方案。
• 在特定的搜索域中向方案里加入查询词。
• 从Index中查看并选择词语来修改查询方案。
• 在你修改查询时查看方案。
Preview(预览) 使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。使用时,在输入框中键入搜索词,然后单击Preview,PubMed返回的信息是条目的数量。
Index(索引) 使用此功能,可以从特定域中选择以索引的单词,并把他们加入查询方案之中;可以查看某一个特定搜索域中词语列表;也可以使用布尔运算符来建立一个查询方案。
3.History 按钮
History (历史记录)历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果,只有当你运行了一次查询之后,History中才有内容。History屏幕将会显示:你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。Preview显示的是历史记录中最近的三条记录,而使用History可以看到最近100次的查询结果。一旦查询数量超过100,PubMed会将最早的查询除去,加进最新的一次查询。如果两次查询内容相同,PubMed会将头一次的去除。
4.Clipboard 按钮
剪贴板可以帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目,然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。将条目左边的复选框选中,单击"Add to clipboard"就可以将其加入剪切板中。当点击 Clear History可以将History中的所有内容清除。
剪切板中最大的储存数是500条。而放在剪切板中的内容如果在一小时内没有任何操作,将会自动消失。
5.Details 按钮
Details是用于帮助你查看PubMed的检索策略。即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了那些词,并使用了什么样的检索规则和检索语法。此外,使用Details键可以对检索策略进行编辑,然后再一次检索。在PubMed Query框内显示的是PubMed实际使用的检索策略和语法。该框下有四个区域:Result区显示检索结果的记录总数,点击这个数字,可回到检索结果显示屏;Translation区显示检索词转换的详细情况;Database区显示检索的数据库;User Query 区显示用户键入的检索词或检索式。
要对检索策略进行编辑可直接点击PubMed Query框中的检索策略,将其增加、删除或修改后点击Search键。

除了以上五个主要功能键以外,利用PubMed提供的其他一些功能,如MeSH 等,也可以在很大一部分程度上提高我们的检索效率。在以后的若干章里,我们将会以详尽的笔墨来系统的剖析这些功能用法。
通过对PubMed的进一步认识,我们可以在初级检索的基


PubMed完全攻略(五)
作者:佚名 整理时间:2005-08-19

第五章 PUBMED高级检索技巧实例  
在我们对如何运用PubMed进行较为复杂的检索有了初步的了解后,我们来看几个应用性的实例。

例一 现在让我们来查找一下有关于"锌对于儿童成长的作用"的文献。
步骤一,我们先来对这一话题进行初步的检索。我们确定了它的关键字应为"Zinc Infant Growth",把它输入查询框,按GO键进行检索。共有492篇相关文献。显然如果我们对这些文献一一打开逐项阅读,将是一项非常繁复的工作。这时我们就需要用高级检索的方法来减少工作量。
步骤二,如果我们所要检索的文献要求是反映比较新的动态进展,那么我们可以点击功能键Limits按钮.在其中的Publication Date的输入框内输入FROM"2000 01 01" TO"2002 01 01".("Entrez Date"指录入系统的日期;"Publication Date"指出版日期)
步骤三,如果我们进一步要求文章是用英文发表,且PubMed可以显示出Abstract的,我们可以依照上面的方法类推,在Languages下拉菜单内选择English,选中"Only items with abstracts"前的方框。然后点击GO键,开始检索。共有61篇,在当前页内显示出最新的20篇。(fig1)




其实,如果我们一开始就很明确所要检索的Limits限制,以上三步其实可以合成一步完成。在此仅仅是为了方便说明问题,我们将其分开描述。

例二 还是查找有关于"锌对于儿童成长的作用"的文献。
如果当我们进行了很多检索(包括上述的例一检索)之后,我们发现在以前的检索步骤中还有想要翻看的检索的历史,首先我们可以点击Preview/Index按钮。这时屏幕上将会显示出我们检索过的内容。(fig2)使用History可以看到最近100次的查询结果,而Preview显示的是历史记录中最近的三条记录。





其次,输入我们想要看的以前那次检索过的检索字,如"Zinc Infant Growth",点击Preview按键,屏幕上则会显示出以前检索过"Zinc Infant Growth"的记录。
如果我们要进一步修改查询方案,可以在检索框内加入另外的单词,如"iron"等,点击Preview。依此方法我们可以继续加入另外的词语,点击Preview直到你希望得到的内容。使用这种功能可以帮助你看到以前的搜索方案与查询结果的数量。

以上的两个简单实例,说明了如何应用PubMed所提供的强大功能按钮来提高我们的检索效率。其实在实际应用中还有很多技巧有待于我们去探索,希望笔者的介绍能起到抛砖引玉的作用,帮助你在PubMed的海洋里自在地畅游。
第六章 谈MeSH Browser(医学主题词浏览器)

何为MeSH?
MeSH其实是Medical Subject Headings的缩略词,即医学主题词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定,浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词,其中论述文献中心的主题词称主要主题词(major topic headings),论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。
那么为什么要使用医学主题词呢?
我们先来看个比喻,如果有人问你感冒了吗?你会不会回答"没有啦,我只是有点着凉发烧而已"呢?当然不会,因为你知道感冒就是着凉发烧。但一个检索系统,如果你不告诉它的话,它就有可能不知道这一点。在期刊中,对于同一个概念往往可能有不同的描述形式,如Tumor和Neoplasm都是指肿瘤。当一个查询者希望查阅肿瘤和diet(饮食)相关的文献时,他可能会输入Tumor,也可能输入Neoplasm作为关键字,但其实这两者之间是没有区别的。一个愚蠢的检索系统可能就认识不到这点,而像PubMed这样的"智能化"检索系统就能够准确的意识到这点,从而不会造成检索结果的遗漏。
如何使用
如果你希望使用医学主题词进行检索,可以从PubMed首页上点击PubMed Services下方的MeSH Browser即可进入以下界面。


举例说明,如果你想要检索Neoplasms和bone的相关文献,首先在MeSH Browser的检索框内输入检索词Neoplasms,然后点击Browse按钮,系统显示其定义及在树状等级结构中的位置,如下图。



如果需要的话,你可以选择Detailed display,如同所示:



在这里,检索系统将显示详细的内容,可选择特定的副主题词,也可进行主要主题词或单个主题词检索,其选项如下:
(1)Add the search to the following subheadings:点击副主题词前的方框,表示选中该副主题词,可连续选择多个词,它们之间的逻辑关系为OR。
(2)Restrict Search to Major Topic headings only:若将检出结果限定在主要主题词(Major Topic Heading)则可提高查准率。
(3)Do Not Explode this term:系统要检索某一主题词时,会自动扩展检索(Explode),即将该主题词的下位词一并检出。如果只需检索单个主题词,可点击此按钮。
完成上述选项后,点击"Add"按钮,稍后在下一屏Current Query的方框中将显示所选的主题词。
然后,我们再在MeSH浏览器内输入bone, 按检索按钮,系统会告诉你bone不是一个主题词,但它会自动将其转换成主题词Bone and Bones, 同样,其下方也会显示出其定义及在树状等级结构中的位置。你一样可以选择Detailed display以便进行更为精细的选择,选择完成后,点击"Add"按钮,则进入下面的界面。这时,你只需点击PubMed Search按钮即开始检索,查询出用这两个主题词为关键字以及所选择的相应逻辑关系的文献检索结果。


总而言之,主题词检索法虽然稍嫌繁琐,但其检索结果的准确性高,遗漏率低,是最佳的检索方法,一旦熟练掌握,将使得我们的检索工作事半功倍。
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