口腔微生物组研究新进展

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-在最近于伦敦召开的第96届国际牙科学研究协会年度会议上，来自多所研究机构的研究者们合作完成的一项研究得到了展示，其题目为“Exploring the Microbial Dark Matter of the Human Mouth”。

通过16S rRNA测序技术，我们对微生物多样性的理解又加深了很多。然而，最近宏基因组学的发展又大幅扩展了此前通过传统16S rRNA测序得到的微生物种群范围。其中大部分新发现的微生物都属于单一类群，即“潜在门类辐射（Candidate Phyla Radiation，CPR）”。在这项研究中，作者等人研究了口腔中CPR细菌的多样性，并且希望能够培养其中的代表菌种。



为了富集其中的Saccharibacteria（TM7），坐着等人利用一系列手段，包括克隆杂交（CH）富集技术，液体培养技术，以及与人唾液样本进行体外共培养等。之后通过Q-PCR，FISH以及16S rRNA测序的技术对其富集程度进行检测。

结果显示，CH富集方法能够得到Saccharibacteria，但在经过几代的培养之后便会丢失。液体共培养方法能够得到较高水平的Saccharibacteria。两种方法的结合能够提高其产量。

通过结合CH以及最低限度生物膜清除浓度对于培养Saccharibacteria具有明显的效果。通过对CPR细菌进行培养能够方便我们理解它们的生活周期以及代谢方式等特征，以及在口腔健康以及疾病发生过程中的作用。

Exploring the microbial dark matter of the human mouth