求助PEDV全基因组序列分析

hello

测序得到一株PEDV的全基因组序列，28kb，求怎样分析才能在毕业论文里面凑点字数。除了画进化树还有什么么？着急，求高手帮忙！多谢！

ipsvirus

从功能看看
首先，你分离的PEDV毒株有什么特点？复制更强？毒性更强？
其次，根据分离毒株的特性，推测相关功能关联基因，再与正常毒株序列比对观察结果，如ORF3截断了，还是哪个关键氨基酸突变了
最后，如有时间可以做一些功能实验，没时间了的话就根据一些文献来推测突变功能，应该可以写很多