[讨论交流] 一个下载植物病毒序列的快速方法。

donggua

今天刚刚发现这个论坛，发现真的不错，里面有好好东西，可惜现在自己才是新手，所以先给大家点见面礼吧。那么多好书我没有，不过对序列分析，还有一些软件还是有的，如果大家需要可以告诉我。好啦，说说正题吧，

我想大家搞植物病毒的有时要进行一些序列分析，这是少不了的，现在不论搞什么病毒，都要涉及到分子方面的，当然而然的就会要用到病毒的序列。当然每个人都知道NCBI，DDBJ，EBI三个大的数据库里面都很全，大家想要的都能找到。可是问题来了，如果我们想把某个病毒的某个基因所有的分离物下载下来，这可是一个费时费力的工作了，要弄好久而且会累坏双眼。现在告诉你一个好的地方，http://www.dpvweb.net，一个很好的网站（description of plant virus），打开这个网页后，在网页内容顶端会有note这个按钮，鼠标移到这个地方会有一个下拉菜单，选择genera，再选择下一级菜单genera，点击，找到你要下载的病毒所属的属名，点击打开，在content里面选择curated sequences,点击，会显示所有的这个属内的所有的病毒种，你会发现在每个分离物前面都有一个方框，这是你找到你想要下载的病毒，找到你想下载的病毒分离物，只需点击前面的方框即可，选完后，将滚动条滚动到最底端或最顶端，点击get features of selected sequences，然后会进入另一个网页，问你你要下载那个基因，要DNA还是PROTEIN，选择后点击get fasta feature,好啦现在你想要的所有的都出来啦，是fasta格式的。只需复制到文本文档里面即可。


可以见下图（已制作成pdf

http://biosky.haotui.com/attachm ... 78&t=1437278766