农科院揭示我国北方动物狂犬病病毒遗传进化新动向

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日前，中国农业科学院特产研究所特种动物病原与免疫创新团队对我国北方及东北亚部分地区动物狂犬病病毒(RABV)的分子进化最新研究发现，曾一度主要在南方流行的China-I谱系病毒已开始向北扩散至中国的最北端，多个谱系的RABV毒株在此交汇、混合流行，增加了疫情流行的复杂性和控制难度。相关研究成果发表在世界知名期刊《感染、遗传与进化(Infection Genetic and evolution)》杂志2015年第3期上。
近年来，狂犬病在韩国、蒙古国及我国北方省份发病数激增，疫情呈现蔓延扩散趋势，成为狂犬病区域流行的一个重要特征。该所创新团队与相关单位开展合作研究，在中国北方地区收集了包括犬、黇鹿、梅花鹿、蓝狐、草原狐、骆驼、牛、貉子等在内的多份狂犬病病料，对病毒的全部或部分基因进行了序列测定。研究发现，我国北方地区RABV流行毒株包括犬源和野生动物源2类，犬源毒株包括China-I、China-Ⅱ谱系毒株，而野生动物源毒株类型主要为草原型(Steppe-type)和类北极(Arctic-like)型。
通过对东北亚地区Arctic-like 谱系病毒的分子进化研究发现，其最近的共同祖先可追溯到1757-1904年期间，而目前我国北方流行的Arctic-like毒株在进化上属于Arctic-like 1b (AL-1b)亚群，该群病毒来源最早可追溯到20世纪60年代。进化上，我国北方的RABV分离株与俄罗斯远东流行毒株亲缘关系最近，与韩国和蒙古国分离株亲缘关系相对较远，进一步分析表明，我国北方Arctic-like狂犬病病毒可能从俄罗斯由貉子携带，经哈巴罗夫斯克(伯力)传入我国。对病毒的N蛋白和G蛋白基因分析发现，该谱系病毒目前受到自然选择的影响，但这两个基因没有重组的痕迹。
此外，创新团队对内蒙古黇鹿分离株IMDRV-13的系统研究发现，该毒株在乳鼠和成年鼠上均有强致病性，全基因组分析显示该株病毒属于犬狂犬病毒China-I谱系。值得注意的是，该毒株糖蛋白G上抗原位点Ⅲ的一个突变I338T导致该位置增加了一个N-糖基化位点，对病毒的致病力和宿主适应性可能具有潜在的影响。

图1. 狂犬病毒黇鹿分离株IMDRV-13在1日龄乳鼠颅脑连续传代的存活曲线及死亡时间分析

图2. 基于106株北极相关谱系狂犬病毒株N基因序列的最大分支可信树
原文链接：
Characterization of a virulent dog-originated rabies [url=http://www.bio1000.com/zhuanti/product/201308/442060.html]virus affecting more than twenty fallow deer (Dama dama) in Inner Mongolia, China[/url]
原文摘要：
Rabies has emerged as a serious problem in the most recent years in northern China. A rabies virus (RABV) isolate, IMDRV-13, was recovered from brain samples of dog-bitten rabid fallow deer (Dama dama) in a farm in Hohhot, Inner Mongolia. We tested the susceptibility of mouse neuroblastoma (MNA) cells and BSR cells as well as that of adult mice to IMDRV-13. The isolate was found to be a virulent isolate with an equivalent pathogenicity index (0.12) and a slight lower neurotropism index (1.07) compared with those of challenge virus standard, CVS-24, which was 0.13 and 1.23, respectively. The complete genome of IMDRV-13 was determined subsequently and found to be 11,924 nucleotides (nt) in length with the same genomic organization as other RABVs. Phylogenetic tree based on complete genome sequences of 43 RABV isolates and strains indicated that IMDRV-13, along with other two isolates in Inner Mongolia, CNM1101C and CNM1104D, clustered within the dog-associated China I clade, which is also the dominant linkage in the current rabies epidemic in China. In addition, sequence analysis of the glycoprotein G identified an amino acid substitution (I338→T338) unique to the IMDRV-13 within antigenic sites III (330-338), this mutation also leads to an additional potential N-glycosylation site (N336), which may represent a useful model to study relationship of N-glycosylation in G protein and specific properties such as pathogenicity or host adaption of RABV.
DOI:10.1016/j.meegid.2014.12.024