如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图
来源:医学生学术您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
——正式开始——
1. 折线图
折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
Time (days)OA
0.0.9420.8460.6910.515
4.0.7170.8360.6530.483
24.0.4080.3670.3420.231
48.0.4510.4090.3350.196
打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExFJZzP7frL4CL6Uws4cGM4I41EAuBhDvlPHtnwbpXyyhnGo8T8sCibcw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExhRRDUicmyZCKu9pftTxl4oJ0G1he8EicI9xtzw1HH0dbZ1CSlZoaPpicw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKEx4UDFrpoMYahEEGrZdlA7jaqkicSIupAdCHBibxsmSofg8jhYeZCZajLA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExBAiakpE7Wy46toUKVib2jvsQAExI9re3cehOaadVawz2IuLXKmsExHTA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExNKVkbibDWeOZZ9WDQ2V792d1vfgz0kBx3WoG6cP43kHFUVXU7beTib6A/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExGTwv5H8CqxvMokNU2tHlfvzJNlEuVy0OqwrTvSSqKqWRXGwlAUaUHg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
在Data栏中输入数据
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExAYbTsHx6o5PFUQylWkVD9TOicMu7ALYQopic4sX7JGpHavgWfPE7MmGg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExWJ4WQtCu5j2PbKP2vb2a0hgQ9Rxvz9sxFzzY71AKsg6HBVx4UH4SJQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
Table3
Time (days)OA
MeanSD
0.1.0000.17
4.1.7250.21
24.2.1330.41
48.1.8590.56
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExJu9ZSkuwfQcWPLwbWt4ia7LyicHPnEaAZt3bWAIAKMbRWCeSC0ZQeQibA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
在data栏中粘贴数据,如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExwgHrbdms2XEFNUDLrmicQNTtxO8hZakODbhoiafJnG9g6t673MAicUmCw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExYM6XuNLuohIHesbYDjEf4gnh0kLia6shHARyJH9YKic2RdhdDXE7q5rg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExVMeauJRm02IvkaMRUFnWib8YE4vZvkzdeDZ9Qr5s8fetkF18ibt2rqLA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKEx8iaBD9icUxGvr5VFX1MvFeMoUTJsUCnCW62hIBZVcbOj2Mzhf4uBDRcw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
将数据粘贴进去
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExScjz2nRlrwhll2FPYic39NbX7RIyYMqlnyqtsYNwSF0kWK1aaxkalTQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件即时生成的图如下图所示:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExyMYJus9F9KoBRgOFprBL9UFxNYibZ8CLFE2SDH3q5ul3TGAictYCE7wQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
2. 柱状图
柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
Table 5
Control AControl B
Sample10.9420.717
Sample20.8460.836
Sample30.6910.653
Sample40.5150.483
选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExcE9z2rUvicM1r3xACMVO87ic2gUX2HEzeia2LFWCLZ1Dr63K7oib1oIDEg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
在Data分栏中输入以下数据
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExQY94JtEIUAFVHWZ5y1ut1muChNytHMJ4I0RK46qBTetlhksaWIAgLA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExM15KGtFLpoko3BUiaL1Km46j8Hib6kBFYLxevRU9zPrRmh3Zq8vEo1mA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
Table 6
Group AGroup B
Control0.9420.8460.6910.515,0.7170.8360.6530.483
Treated0.4080.3670.3420.2310.4510.4090.3350.196
这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKEx7ibWY5enzTLibVcn54JLMib96Nrf4lEwRSf4QmS2QgtdPUDlEpf2rVHSg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
在Data分栏中输入以下数据
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExMjVoGYXLeAJHP6h1AjKRZcgaBWrZOsiaO4ricn93pSgyJPaHKLLyHryw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExiaozk3BvlbgIrH20DUd4icjicaR2cqlSt0SiabGl1Hgu7dtWP0BF8stKhQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
Table 7
ControlMeanSD
A1.000 0.17
B1.7250.21
C2.1330.41
D1.8590.56
仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExVOeGUlapvfmJKZictWEfltNkhGkJWN8mZ0jibAIUYVFMT1CjicRqgTLYA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件及时生成柱状图,如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExCZ6qT8kQITErupIPAgNZuoaianrxiaL7rvxgK2P6wQiclygg6tiaicETp3Q/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
ControlTreated
A1.0000.173.6040.31
B1.7250.212.5340.43
C2.1330.413.3810.74
D1.8590.563.9130.93
操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExJdln8VXArNpFYWKnWfUEjQSrFhDb2O9IicBux86o38Oic0uW4Y4c3Lnw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
在data栏中输入数据
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExSicW9pbkTBueUyWxyWz608JLlnXnBRUprzUCicKIBAggibMnC0PDydJXg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
软件即时生成的图如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExmLSibibMX7LpDFrJrxqdyrODulynTzymUhIBoE2mDFr0bBvkiaQQNuubA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
3. 组合和导出图片
点击layout栏,出现下图所示界面
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExDQoSUEXXFFneIazD39YlialKtIOLxLPcOBPNrQNT26fwBrhASkg0JCQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExr39UNn8x7RFnWBByIHlwyypZosyrS9l9yU4OiaRUb7lQlMZ2lia2jNtA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExfzqcCicFxAburlw4ZV6Xuc2Q0Dfdu2C9OUhooOkOoL9CXKfBehQPkUQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExxbASibkwf16qhuQhDelUg0zLxxRfNdjCyYZX9y6vu1u4PoPn5xbf1ow/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExiby2KO3YK5L2fGtopWkXwT1qpcRHNgK5vhn4VKgeuhuJnzFzJsrcI3g/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExYVibo4fgowgYOX1iclJ2wH0AVaaxagpiciaVSlXwRFtQvIAE9PxBzCG1rA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。 满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!:lol
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下 :) walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
刚好微信圈有这个,就转过来了。 很棒的软件啊!表示喜欢!
页:
[1]