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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

4 f8 H+ t! v: q8 P# T
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

) L; v4 ]0 S+ _3 ~* g
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
/ }  F2 W# W$ j* _) f  b
——正式开始——
9 O4 s; j: \+ C; s! \7 X+ p
1. 折线图
% W1 Y6 a0 n4 C  f# d0 g* A
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
' r# A; R& b7 }. ?, e1 R
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
! M! J2 W/ z% ^# B
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
6 G/ x' T6 Q+ j* f# a: @0 C7 K
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

. Z. y" _, J4 z% j% c. v1 I
  Y" ^" B* V2 k/ g) i4 @
  s; g8 ]4 L. W& X! _: Q- S
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
; J3 w! _  e: R& W. o' E
& F, V& _  M6 l5 m
/ {7 b1 l) d& \( U& A
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
$ T4 `" S2 i8 i: v) y1 Y

0 M7 s, D9 x8 B% F, W, ?; F4 }! R; p
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
( h  }2 L, I( h0 a, @- I1 o% Q. ?( u

$ t% K8 k$ o6 k5 p6 N+ F3 P, v
  Y  W" J: e4 I* h
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
* X% A+ F! ~6 B  S
9 _8 _; }. J3 F& }8 B

4 i7 j3 @+ m7 n; K$ |  M+ H1 }
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
+ o+ ^& t" F8 F: R' P- F" [8 c

' K7 e- [4 B+ Y# z8 O

  K* P' k  }+ s
  在Data栏中输入数据
; V6 A0 H) g: s$ r" F

& @1 m: z7 P! y# \+ d) f

; p# k" l: t" k9 @8 \4 ?
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

. h, p. K- u% V8 u1 f4 `# s3 M

) I$ K: ?$ O/ C2 ^) o
7 E4 l# d1 c9 P* D8 z/ X
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
" @1 P6 {  Q( K( T& S
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

. J5 @) B4 H# t3 [
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
1 u, C# g% R; r3 p
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
: m9 W$ j0 M! p, g+ J

3 }' \, H6 O) a1 ^3 `0 r
4 y8 J9 h7 G3 X. ?2 B. t" `( t
在data栏中粘贴数据,如下图
  [3 ?5 r# i+ Q: [, P

/ |; |0 l& ?3 I# v4 P- M5 z3 a2 W
# F4 |8 K" M; i( p5 J. r3 G" B
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

$ ^  Y: L5 y6 F0 [
* q' X; A- Z9 P1 {) W( a8 p7 Z
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
# m# ]& j6 i' a  ^, n
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
# u2 a+ A/ E! o$ `5 ]- `$ W8 h, B

& \) m2 i2 W* c; l
* X6 {: T7 n3 C. t8 Q& J
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
: f- w1 [) n# d7 C0 ^1 Y

' m) K: @5 s8 Y; F( {/ X1 \- X
$ V) x" \( f' J3 p
  将数据粘贴进去

# |) Z- c! r9 {6 w. I
! z5 H3 n/ t1 j8 }

! N: e7 N5 }/ u1 ]
  软件即时生成的图如下图所示:

4 Y! ?, o! t$ g, ~
1 U9 v1 B1 i1 `
7 X& h/ v& r0 N4 d9 g& A+ H
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

  i  A+ u7 Q# U& W
2. 柱状图
% z9 |! U$ Z- }; h) ]' B
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

0 d2 Z7 |2 |3 d6 {7 J- O
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
& H- `$ g* R1 ]" \- k( v
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

0 F# p& x- ]4 L# b( _9 H
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
" h0 x% b& C& N8 O
! H+ I; S5 Q2 p3 b

, L8 h3 T+ v+ Z0 r; h* ^
在Data分栏中输入以下数据
- i+ E3 b2 E8 O+ X$ @

; O* U7 c, B/ v, H6 p
; C! d# d, q& W  W4 r* c# X+ x/ w
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
( o' H* r+ i  e  E  ?
4 m8 X6 t7 _% `8 ^6 H" M
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
/ ?' `( n" ]/ n' o; S5 T, {
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
- V0 H% I7 r$ O& m
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
6 Q' U  V. p: B4 D% \

  R. U- f% \5 `: I! A

5 r* G' L9 n. S2 y
  在Data分栏中输入以下数据

' F/ l. k) ?) @
5 }  V% e, T8 s, y+ U/ I. T

! U. Q' D3 u7 X, T
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

. A$ O0 ~: h8 h$ L

9 s2 M9 R: c- W0 q' m# k
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

/ h$ _' C: p! X4 D! v7 u
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
6 o. z. q( {5 {4 [4 I3 ~
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
( P6 C* ~# A8 {

' u( e& K: H7 u9 k1 i$ b+ O9 @
& |  m+ a$ Q) F* s. o6 w& Z
  软件及时生成柱状图,如下图
  |, ~/ I  ]7 u+ h3 N+ _, n/ ^( R
. z# d4 A, y  D
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

2 \( }! p! t2 {; T3 d, Y' r1 T# [" S
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
* v" _$ y3 H$ n8 O0 i1 w* Z. \
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
" N: _8 B# i& U
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
! Q+ k; k  ^- e+ i* A/ M! g8 S5 }
( [% f* q# }) T8 S0 G

2 s8 r  N) ]8 {6 L( \: R
在data栏中输入数据

: u4 ?. G, a5 N# l/ d1 u4 l

  T$ p8 ?. c- s$ D2 Q
$ `7 K" I% D2 a  B
软件即时生成的图如下图
% ?% H( {" U* _7 l4 c7 V# F

& D7 A8 h/ i1 ?' l; Z
: T. C1 b9 h9 Z  }) d
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

7 d- }' e6 c+ ]
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

: h& s5 t- j4 O
3. 组合和导出图片

( [% U8 g: V; [2 k6 a
点击layout栏,出现下图所示界面
, Q6 H) m1 l) x& g! g  O. d

& J4 ~3 A- I; @

( q# `" P: y7 @* E0 ^0 \3 p

8 w* {( y, E6 B' Y/ o
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
8 v7 a9 W) D# u( k( }5 a# c
* d) [; c/ V/ o: M" ]

7 z6 R6 M1 r5 m. F
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

$ n: z- m0 r, ~8 y
3 u$ Q: J1 J$ v! q

7 R  i7 v/ s0 x8 `( d2 L
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
( v; i0 ]/ x. v/ R9 v! b
2 A/ ?( x2 |: l" l5 u- j: a" d3 A

' s/ Q$ l+ y# g7 n* ]/ b
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

+ ~0 w, |/ O) v; O7 w

- ~  a7 J& C! x- y+ \
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
  t6 ?% W( x( C! q/ D" d1 {5 t
1 l$ |8 o2 B3 a& U- O* r2 l' X( X* M) D  b
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12" B; |9 r/ \6 S/ ^4 `" y) T
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

; F! ]0 Y  j" i" Z0 z6 v; }9 T! S刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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