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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
1 V) [; z4 m7 ]. e% i" N. ]" \
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
7 `7 u' m/ g7 @3 F) t$ `' h0 ?( P2 ]
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
$ N+ A! T9 c/ @' d% O) p6 y6 z& K+ l
——正式开始——

) _/ b; u) N% v; U; O* v  c; f" y. {" p
1. 折线图
7 [3 V# E7 N1 A2 I1 t1 [8 E! n, w
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
- K- |# l1 F# d0 L+ G
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
- C0 _% U/ T. O9 m8 U+ y
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
7 y& Y2 ~( j; S  a4 I
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
5 G" Q. F( `% l8 I# i: X: Y9 M
* o6 E* F( y$ {1 f

4 P2 o$ h) o6 ?" }
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

. S" c% {) x) k. f( y
( n6 c5 o5 r8 T  Q0 d" T- e
5 Y( V$ L; r" U" J# V0 m
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

( N  r2 t# Q8 i4 `

8 _( A. w( e9 ^3 `; s
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
& ^8 T; p) a4 y
# w3 x/ \! m  Z

! u6 J4 ]3 ]* v2 U/ \. Q$ [+ M
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

, C% I6 Q# C' Z$ ^! V8 p

* x" z2 Y& K1 X, N6 n" `) f
9 z" Q6 m* B/ i% P3 F( N
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

# O4 |: Z7 V( F
( A1 ~: X6 ?4 _0 g3 o& f% _0 J

+ Y; M/ O* B% ?9 s$ T' K
  在Data栏中输入数据
3 V  E/ H& }6 r5 i9 X

$ c2 n0 p/ D+ _: e. B' N7 d

: B9 B8 t: r3 S3 }; J
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
& x' K3 l% `4 e' p( S( H
% ]4 K/ J6 L, ?% R; t% F7 b

1 j5 f6 N( v1 W' o" C$ S% o9 ^" L. q
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
" {& b7 W: D' x
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
/ B& p9 ?0 G9 }8 X3 U
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
" Q9 C1 }" Z# {0 f/ Q
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
+ k4 y! \  ]4 g
8 j  b! I( Q/ S: N: L  b- d* L. _7 S

+ W. e2 W3 k8 p# C; l" E
在data栏中粘贴数据,如下图

% o6 q) O' N% k( Q% `

4 {- B% z: ]  c4 Z0 |  j

. i$ I, z5 E3 L5 }6 U7 D1 I$ i3 S
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

$ y! I$ b9 i; C' T
7 [8 Q9 k' m* c
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

9 @* i0 k  Q. \* @5 K
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

2 B* O3 y5 f8 |, a& J, u& H, [8 [
1 l; a: j" F4 m( U, x

* N3 K/ T" i' ~
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

7 f/ ]6 f) g. ?# D% m( q  j  f

1 z' h3 @5 K+ D! {- ~/ h0 R
2 T1 e: h8 J3 x/ h2 G/ `$ K5 g
  将数据粘贴进去
6 M1 h0 s0 c2 X* a$ N
* z4 y( H# l9 W* I5 q' N& G# A

: e4 Q$ r; X" G) V; D  Y6 R2 }
  软件即时生成的图如下图所示:
$ X6 q6 C. G2 K5 l2 p0 E% @5 o
4 [! S7 F  w8 C4 j2 P5 L7 G

, H/ e3 B, T$ L$ g) \
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

  H# M% d# i% A1 |8 L4 X' t: R
2. 柱状图

9 x& H( h, V! o* t/ L& k9 r( `; _
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

' h. q  Y8 N7 u; |# m5 q
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

9 g5 |6 T2 ?* u% w: Y
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

- ~* Z  j: w3 u  _1 E# |) U3 n& _
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
' F) r5 P4 y  g5 x( u5 m5 Y
" w+ l3 ^7 d- m" U* N) q

" ^9 t+ U6 F) s
在Data分栏中输入以下数据

$ N# t: N+ q" u/ u' A
4 f5 N4 q- F+ |6 ^" q
1 Z2 B5 V4 f% e% O, P; Y
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
; d* s3 @$ d# @  s* ]7 @
2 h* U- f% x" W9 j5 ]  {( c
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

! r+ h( V. _% j* i
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
0 z0 `: ~+ ~( q9 \9 ?1 L
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

& S3 n9 X" U9 q# n8 A: ?

& f9 Y# J* r/ J. M+ k+ V$ Q) ~
+ D* u# ^5 N  g7 v8 b+ W! |. _) R
  在Data分栏中输入以下数据
' D6 Q6 \9 o' S( b
  p: X9 Q: l1 V7 b( l

. g+ u! ?3 ~: n2 j5 C# u0 @
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
) t3 Q% \; `* A# ~. J+ l- l
( [! p  B" \  X& i" o7 _
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

. Q9 A& b8 I) ^( T
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
, E3 R& h9 N# k" ?+ f
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
. H: n! d' G! Y7 c1 b; N# D

0 `8 \# M0 h0 ]! B/ l: Q

& `' n1 Y( y* T
  软件及时生成柱状图,如下图

. \/ Z3 x% }* n$ k* |3 p  \. Q* _0 {

' I4 j) B. v* O4 r5 N; j
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

3 E4 y# E: N( `, J; x# c+ _2 U! [
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
% `+ M+ v6 s' h" E' J  p
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
( d/ G9 i+ M' w5 G/ q9 D
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

% |. a0 b6 n* n% f: R  V

% l* [1 D) e) h* @' _
& V: L" ^- v" u8 Z, w9 u4 ?2 {: z
在data栏中输入数据
) }9 g/ ^- r( G) q# T: d
) U& K" L2 e: b9 K& z# O

8 w' h' @( b' ?  _  k
软件即时生成的图如下图

3 R; y/ T" J. _! p" I* R
# S2 C0 [  c" _% ~

; v3 Q! d# b  V, @* `4 |
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
% Z6 @) F' v1 Q
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

! l$ J5 Z( p! O( O2 S  K3 z. B) e
3. 组合和导出图片
0 W* f0 }5 }  ~8 A+ `
点击layout栏,出现下图所示界面

) Z/ R! H# T! j- U' k: A
1 H. `3 U- @! H& T8 U# P* d
/ ^4 G: Q5 {1 {3 r3 R
; J0 q* G. c: g5 ~
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

( K+ A9 H# a5 k6 c0 O5 N# m

" r5 c/ x( h: U
3 j5 V1 ]0 b) g: [. d6 c
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

2 E9 Z) c; n) s1 \3 k

. X, n: E4 F, m7 o. q
) h8 ]+ i7 z3 B
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
& r, N# K: e% J* j. T/ }
& Q* x1 ^& N, B, }- b

$ F" p: B# h5 p8 Z( p
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

* |$ u/ @' H5 p1 B

' d& N, C6 t. q" {7 z' |  |: S
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12% H) e6 i( O- ?- H
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

; e& h" r8 K8 y0 h9 {刚好微信圈有这个,就转过来了。

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病毒学院小学生

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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