求助！病毒全基因序列的测定问题

heartsound

无法分离到病毒，临床样本量又不多的情况下，该怎么去测定RNA病毒的全基因组序列？想用随机引物进行逆转录后，慢慢测序。

看了些资料，oligo（DT）引物对于具有3’端Poly(A+)尾的病毒很好，也能合成较长的cDNA。

对于没有Poly(A)的病毒，只能用随机引物了。但是随机引物似乎对短片段的合成比较好，如果下一步进行全基因组测定，特异引物PCR得到的产物能有多长呢？

有没有对随机引物使用比较有经验的童鞋帮助一下。样本有限，不敢浪费

cloudwin

支持。。。

obnew

现在有大规模基因测序技术，可以找北京诺禾致源科技股份有限公司

序道

sunshine 发表于 2016-8-29 09:05
同意楼上说的，宏基因组测序会好很多，现在费用不知道国内如何，在美国的联邦实验室测的话一个样品两百美金 ...

在国内，华大比较专业，生物信息分析比较高，一个样能达到两万

sunshine

同意楼上说的，宏基因组测序会好很多，现在费用不知道国内如何，在美国的联邦实验室测的话一个样品两百美金。若去公司测就贵了。

序道

如果你样本比较多和经费有那么一些的话，做病毒宏基因组学是比较好的。样品这么少，如果你要是知道那是哪种病毒的话，设计简并引物效果会比较好，如果不知道，用随机引物扩增效果不是太好，SISPA方法还可以