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全基因组关联分析和HLA区的精细定位研究确定了多种普通感染的易感位点

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发表于 2017-10-6 22:18:37 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
感染性疾病对我们的健康有深远的影响,但是,普通感染性疾病基因的研究已经落后于其他重大复杂的疾病。特别地,只有少数全基因组关联研究(GWASes )已应用于低死亡率的普通感染性疾病和疫苗可预防感染性疾病。例如,先前有研究将人类白细胞抗原上的变异与带状疱疹及亚洲人感染慢性乙肝的风险联系起来。
研究者用从超过200,000的23andme公司的有欧洲祖先的志愿者有关感染史的调查问卷得到的数据,进行了23种常见感染和感染相关程序的全基因组关联研究。他们检测到59个全基因组显著的关联,一些例子中,他们的结果重复了先前的全基因组关联研究结果。研究者进一步估算和测试了人类白细胞抗原(HLA)经典的等位基因和氨基酸多态性,来仔细分析多种普通感染时独立的HLA信号。研究者的精细定位研究明确了欧洲人群中新的HLA的关联,且表明特异的氨基酸多态性在抗原结合裂隙的关键作用。通过将多种感染一起研究,研究者发现病毒导致的感染疾病,变异多出现于HLA区的Ⅰ类分子上,而细菌导致的,变异多出现于Ⅱ类分子上。当然,也有显著的例外,如导致足底疣的HPV感染。
综上,该研究揭示了特异氨基酸多态性在抗原结合裂隙的关键作用,也细致分析了应对普通感染时宿主基因的结构,有助于启发新的诊断方法、疗法及预防方法,也为感染和自动免疫混乱之间的关系提供了新的思路。
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