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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

, I% q$ z( ^3 Q& t3 f3 ?7 G) V
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
; }# R* N& e4 R; v7 ^2 o' \* p1 H
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

/ K1 H" s% j7 n* t9 r. m. H7 ^/ @
——正式开始——

# ]& _% u- e& P
1. 折线图
& J9 I4 ~2 U% O
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

3 T% a6 R  X# A
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
0 Z" _+ I. X7 m
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
7 S) k: f, ]) t  A  q& L) y' ~
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

: K' }' y7 `) W

8 i0 y' D- o2 D( y1 _! D, }0 {

- K3 l* y3 \# M5 X" A/ }7 T7 w
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

' M% ^# c: y$ [: S
: s+ j" `0 l! y2 o! F
) z& V$ O! a& q, W
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
; p" y( ]+ ~* c6 D: e

! @+ I, u5 m9 ], M6 E
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
0 a3 L2 h% r! M0 A+ a. A) {$ d

; e; ^. Q& x* ~' G2 }; p/ W  Q8 u/ V
8 r" P) C9 v6 {8 i+ J0 C
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

/ q  @2 Y' f/ U3 A* Y; y

1 Q: G. T8 v* w1 b" |; ]  j5 ?! E! \
3 o, p# f- b4 z  d2 [
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

# v% \8 M" A1 I: e4 A! S5 H
2 h% f6 p. B; Z$ I* z/ X- k% s( f

) I  ?+ J" Z' ^/ s. y; {
  在Data栏中输入数据
9 L* L) g( E, o
, \6 ~/ |5 G% Q8 P7 Q$ ?% u

& l0 O: o9 C4 P2 T3 X  B' I7 o1 Z9 S
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
$ Z) L, W5 K. O2 f0 g

- k- u0 j. ^9 V) c* ]

5 L  A7 a% |, _+ [' H
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

; c: x& U0 M0 R- R# Y) K7 c
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

; ], r+ a7 w( @$ J" j6 n8 ]# I
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
& ^  l$ v- H0 ?) g# {
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
5 @! z5 q- s5 v+ _% I! E$ ~3 V

, m' V5 i3 ]" ^

3 h4 k6 V9 E$ A5 _: b
在data栏中粘贴数据,如下图

$ U( f. o, j; G% W2 _  {) m

- K6 W3 n: E# `8 I/ z4 W% a6 S
" w6 t" `7 p$ P
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
0 l4 h7 G+ ]4 k

. }2 y, y- |6 }5 v: t  q3 f8 J9 h
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
" M) p2 a4 x4 t% W; R7 Q  J
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
+ R, ~8 j( f, U' X, G0 P
( H( Y& r8 h' x% W
$ k, `! \" ^5 P  r8 h
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

" S: i7 f" F" s& F

! X. p% a' `9 I, Q9 @; K: p9 \

6 i0 P" w7 ?& B( ]: C& {! N' D
  将数据粘贴进去
2 M) R6 g2 `9 b  @9 n8 p, ^
( m2 Z8 V4 Q0 i0 a# u4 G3 g7 @1 x

. ^4 t5 R7 w  A$ Y& p
  软件即时生成的图如下图所示:
9 l- ?6 Z1 q3 t3 B6 v0 ~

) p  S( e. H$ c" h

( t. \' u' c% s+ w3 J2 T/ \
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

8 y, B8 N8 S1 d# N9 s) H
2. 柱状图
+ n+ q' G* w4 V4 ^8 k8 K* Z7 c2 R: D
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
( o7 H! ~2 T2 m
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
- i2 N4 K# E/ Q8 b3 W( o
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
7 T! A& G  x$ R. z; K7 b8 h0 m
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
  w0 b  D2 D! [, F9 r6 L( [. K8 m6 c

1 o* Q  H  Q2 ^- a; W: B5 k- [
  Z. O: n4 W. j5 r# v1 `4 g7 m
在Data分栏中输入以下数据

) s! V4 ]  Q: T$ o0 @  j7 w7 d0 V7 X+ ?! s

7 M9 A- K+ P0 \! C

8 C$ H& I; b# O, {9 [3 D
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

7 m- a9 H) I" ~3 `+ f) ]8 X/ l
) w9 s' Q  j8 V8 `. N
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
2 x' ]7 [, s+ d6 Z. O* n
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
5 y, K% ^5 a8 f; Z+ a3 M: b; q
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
6 Z6 N; T0 C  v& d7 E4 }( o8 T# X

. I- m- Y4 K" h' U1 t: _( S; l
# H! G8 v& h" W+ I0 K
  在Data分栏中输入以下数据
) L9 V) O% p6 J7 F6 q
* e3 n8 W1 q4 G0 U2 }
, R" I, n; e; d$ H' t4 z; |' X
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

+ X, ]# V# x. s# O8 s( ~" u
& F2 c+ O, B; [$ c& n9 Y; x3 H
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

7 i" o/ d4 n; Q  r, U" X) A" R( N
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
( N0 |' K# ^+ R- c/ b$ t$ O
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
) H* r2 X, H& C8 |  d( [

) L  X  v* V5 Z+ J

7 v/ c' q# d3 b! L/ H
  软件及时生成柱状图,如下图

" R( ?. P3 O3 p" t$ e* p
9 ?0 u# x( D. z  @5 B0 f) x# L# v
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
: H) [. d$ K+ K" a) f2 }
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

& m3 F( \3 f% m% d+ f4 r
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

$ o: p, `2 t0 ?( E7 t
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
3 u' ?, d. i' N! u- o$ s7 p, C4 f
$ E/ Z# Z% D6 [1 g  P) l: O
) `2 y+ C- I) l  T; c9 Q, O1 m
在data栏中输入数据

" q: C8 B( C* O

6 p; f/ z7 X7 r( m$ }6 L; t) _" j
* P5 D% c3 p! t0 z" p
软件即时生成的图如下图
$ ^5 C0 G; o/ S

1 D4 ~! }7 C- f; f- }

7 S' Q+ ~3 Q/ G, i* D
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
* {) r, Y  Z; c6 m8 |" f# M
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

# \4 \1 {9 _4 n+ C
3. 组合和导出图片

+ L  c8 `+ i) w2 ^( O1 W
点击layout栏,出现下图所示界面
8 g6 L8 b' K! M. F

6 s4 J  b8 Y9 r. N& X* P$ ?
4 T6 X1 N5 ?7 D0 I
$ l+ @( z4 R& J, K0 O3 y- P9 L* F
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

( q, b5 {2 t6 I% v- o, Y
) F2 v5 V0 t$ `! b. S
3 r, `+ ?3 P7 u, l" V# Y
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

1 j! q& o4 ~# i7 Q5 f9 g) ]2 e

0 i  c" I" c# H1 \4 \

6 S% |: \: n" I7 `' O0 R! m
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
/ Z' [- r! o' A- A" C

1 Z. x/ F  \) e1 G2 S- Z; G

. `0 d" @$ f/ ]1 |% O$ x
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

. p5 H6 T7 L8 U( b8 \% M, L" I

3 }( L) p$ [' \4 H3 R# ]
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!& V# O# H. D+ ]( L* j& \- l
4 j8 a/ t/ G+ X: r' K

" L/ R. G4 o7 x9 z2 @) u- q' w# s比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
% Y* @8 J$ ^9 X# R9 |3 ~满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

+ y! e8 T: b$ @& T" v刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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