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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
4 V& f0 h3 P; u% X) i
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
& ?1 X1 N# b0 h& B: o7 ]
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

" `) ^' j3 t- U
——正式开始——
3 f; ~+ e) g4 Y' V& f4 e! G: |
1. 折线图
! {% h7 T2 `& ?4 t9 U; A8 d
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

. {+ M# y9 X4 e
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

4 I0 w& ]3 O% r# \$ t5 h* e
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

* I. `3 y7 L- z
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
& [4 W. p# w* F! N- R

8 y7 {; p. @$ Q/ ]/ P5 S

& O1 x9 s. k+ m  R" L8 j8 d: }
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
. W* V% J/ Q, a4 S$ _
# B4 y% r+ t/ x: p0 g/ {

! ^* ^$ ]( N/ g: H9 @
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

1 w2 R5 M8 ]( k; M9 r6 J
) y& T6 f; P0 V2 R1 |$ ?; m* s
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

# n; ~1 h  E4 y2 k: D- P
' H" C' G8 _- {( R+ b( K
! `. N! C, O6 _% ^
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

4 F* V1 B! c7 Z& s% f; u
1 S0 y+ }" g2 Y2 s$ v4 {
8 R4 m/ p5 i/ D7 e- E5 N# Y5 f! n
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

2 v, b$ H0 F! n
9 i# S# Z' [7 ^: J% v! a2 r
9 n6 \, n+ _5 k2 [
  在Data栏中输入数据

  Y/ q" Q) Q& J

. a, W2 c5 l% h7 ^, p
7 N3 p8 ~: u: M) ?2 n
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
* I, H% O$ e' @- f4 K

( l  n1 ?) {4 N0 d
! K: |( ~) Q  {6 h1 i/ `; r6 K
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
7 W1 h- W' ~7 u8 |7 d$ o' w. o
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
# g) P  e+ C$ H  {. ~. {$ X
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
. A+ x) h0 h! h& C% @1 j
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
: p3 N6 v4 _' a; m2 X5 G

6 y6 l, K/ l" i# o. ^' v$ s. e
# l! Z: q" e1 ?8 b9 B: F7 w( Q6 N
在data栏中粘贴数据,如下图

7 @7 L5 [1 {. b; _/ C7 y8 o. A7 o
( I6 V9 \+ w4 k, G9 O" @
; g( a/ t7 ]/ D! M9 o3 x
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
1 l; x$ p: J% P9 D" P
0 |/ _& B5 @  O
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
2 {5 S3 b6 e) ?% X+ X1 m
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
& S$ q$ I! ?0 }# t4 H- J' q% D8 M

% X2 l) q. `  Z* ~$ F  @

% L  K2 g5 h: a/ A3 R
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

* d1 P+ M1 {! S
% a$ x* \6 G( r4 r0 |

/ u( T/ c2 F$ O+ `: }- ~) [' J
  将数据粘贴进去
7 T+ F" W! y1 G$ J) P9 l

* R4 T6 \0 d! `, H9 I, e

5 f6 ]9 y+ R/ N% o& z/ z7 X
  软件即时生成的图如下图所示:
  F) D* C7 V3 W

6 l; l4 b( w% p
1 A; N+ g& S& R* y
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
- W! x7 k6 n* ^5 R4 j9 S! Z! Q
2. 柱状图

: {3 p2 q6 ^4 c" k
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
7 j* _/ p  o# B- p
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

; y0 G# `+ h& `* e
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
, n! |# v9 u- S
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

) v8 `' z0 u: U+ ], F# w( x
$ z) [/ e4 @! B6 u3 a
9 S) f- ?; W* G1 Y/ G% J
在Data分栏中输入以下数据

+ h$ y# q' Y2 H8 e5 N) _
% V) n% a) {, q& `* b: K# e
* ^4 m2 P( [& k: t. [& o: K8 V6 P  g
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
. U7 K# o  o6 }, r! ~8 v7 ^) P  v
" s  X7 e9 b8 ^5 M; a8 I
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

( ]: _: S7 B7 @6 c
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

7 i5 X( }2 B% Q8 Q* V7 W
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

3 L( s3 y% x- K
1 S8 _; ~9 Z* [+ ^/ L- @$ K0 t
$ J! D$ [7 `3 Q/ F+ A9 i$ z
  在Data分栏中输入以下数据
8 j. W' V% E; C9 a! K

9 y* t; u/ Z+ B; g7 U( c

5 c  V3 F, h: o- p
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
. F9 |/ r4 W# S! c, A
3 T# o2 v; z2 C% E' T
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
9 d& F2 x! V" V! \
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

+ L9 q# K0 O: q! z
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
" J  L/ [8 k% A

; S/ [! @, M' R. B; K0 I, k$ W
6 b' @3 z' E7 O1 c8 ]
  软件及时生成柱状图,如下图

+ e0 J; g" c% x+ I8 ~0 B
1 ]  T9 O" U7 y. R- k
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
" b  h8 s! m( E& y( l0 x
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

! h. r' L1 c* N, _
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
' e* w& }4 j$ Y1 N4 N6 r/ E3 M
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
% Z5 V/ q& o- |; f( e
% t# E' x' k8 l, t

- @3 Q$ ~! }. s
在data栏中输入数据
) Z) {& L1 T$ @* p$ u6 m: B4 l
$ g3 m( _' g  y$ D+ x9 o" V) S
7 t3 W7 u- U; f# ?6 h" l" `
软件即时生成的图如下图
" L0 [4 M4 q3 U- C7 l* F: X
0 h. c+ c# y+ L
% \% `' A1 D7 U. n* i5 c; i4 N. ~
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
/ i, i0 ], L* w4 |
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
. r1 ]" ?( I& Q% L/ g
3. 组合和导出图片

, R4 X( `; K, h3 T
点击layout栏,出现下图所示界面

$ ^' \+ N" l0 R' J: n4 _1 c* }
! k( o% [$ e; ?" s8 I( l& Y  K6 ^" J

" {2 L- s, F; b7 z
- t+ v% c  w- W
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
7 H/ J2 U3 f6 W: a) r  |' U

0 [2 `% d: x6 v, @% s8 d
6 C& s8 Z3 t+ t
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

7 G5 w( U0 B4 ~+ i) s' x& c; s

9 J: q3 d0 N6 }+ Z" A3 S6 u
# C+ Q/ l$ E2 J$ c1 k6 d" R
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
/ A" v% y) J( x3 A

; t% R2 l+ U( b( m5 B+ l
0 j- a9 g0 V# q% `
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

: z8 B8 G. F! U) V; z
8 r7 O5 g1 b( ]! Z, `( {
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!; K( T& e7 I  t: I3 \2 N% D
' n) Z& o& |' p7 A. W. K
4 \6 t: v: N* b$ ~0 e& i) \# X# }1 |
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
9 Z9 n1 S: m7 x4 d, {* Z& ~满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
) H1 r1 s9 u6 i' b% R6 _/ I$ p/ G9 P
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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