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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

# I  k2 k8 B. r3 ?
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

0 \0 _9 @* l4 F
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
3 m" d1 k9 y* H+ J
——正式开始——
; e; b9 F+ c. }, d7 i. T2 |
1. 折线图

/ C9 ^# ?, P; O! V/ o8 [
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
4 y4 v) p: H) O# d
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

' J9 v" W# X+ L+ y# w
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

4 {8 ?* {0 H2 H7 F
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
* M; p5 b: a( ?: k7 w4 i# {

) Y3 N: X  Z: x3 G' e( D7 y+ r% P
3 L6 x: f4 e5 p
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

* a/ q2 ]$ N- o9 R
" d& L; B  I/ E' i* \7 H
8 j6 [4 `0 o  i" }5 w. f6 o
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

; m6 a" @# R4 g5 b

  i9 ]% D+ {9 H+ S, E$ I- n8 ?& y* }
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

+ m* x1 S6 l$ R) f& E8 h8 ^) w

2 Q; {. I. o9 [4 X* C/ E

9 V9 r; ~9 O. k- ~+ j
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
9 P5 k5 ]( `+ z: U

) q* ?( G( y7 ^$ |5 i; g

0 d, r% D& ~$ G! Z3 E+ ~2 a. C2 I
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
+ ]4 A: b) {. l; l. _' T4 H& ]; f

5 V! ?* P; M! B# U

5 p5 x2 Y) J6 N* B
  在Data栏中输入数据

# d% l" w3 K$ L4 c, P" n
4 e6 e* N3 U) [7 \& r, A1 ~

+ J5 x, O( f" O. {% }1 C
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
( h& s9 f. _) e8 X3 D% S8 o
3 @+ u( r) ~& y7 Q) I$ G# L
! ~5 q1 z4 m% \1 I1 I
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
8 x- |- m' L/ H" l. Z9 K/ j
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
' _4 p6 t* m! `" s
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
! {7 f$ u" J" N
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
8 w. y. k. q% U$ _" c
1 \( t, w$ \  g/ i/ ?9 `
6 f6 m% B0 x+ ?: e( Z5 p
在data栏中粘贴数据,如下图

& Q0 N( S+ p" n& Y

: e% F3 J& l* [1 R  {7 |% o$ n7 R
, S3 }, c6 \4 O
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

; O1 \& f1 H1 ?9 F2 M9 |" y
; b1 K9 {4 j4 h; m3 e4 ~
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

; v! j3 ]( P! x# O% |; u
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

- ~+ `! s& N( C, c0 q% L2 G

) I- v" j. S) f
& a3 g1 g& |7 q9 \% @, l9 A- U! r
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
% c: }- y8 ~5 J  h+ _  b& ~

9 F* {) U9 ?- H' ~0 _$ W- b, H" l
" T# Z# m9 t% H0 x) i) c/ r
  将数据粘贴进去

; F( V: X- y: u/ e( ^
% z! [& O- d8 `+ f. o, u* j  A

/ U; v2 a# r1 z, C3 i) n
  软件即时生成的图如下图所示:

4 B2 A  I6 u  n. B

0 N* ]+ i& J0 ?  q5 f0 T# A8 t. O
* p+ |/ \% _+ l* X6 t! R
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
8 F1 g  ]/ T) _, O* C3 S
2. 柱状图

+ f- G# S& Y, P8 m( N9 M
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
* E, D3 b- a/ e( q/ X$ _2 ?; h
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
! L9 O4 }  t' \/ C
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
5 g5 X) ^/ a# j9 `- C# ^
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
7 ]& }3 @$ c0 W/ F/ d; ~, f
) q9 z8 q& a! u
. P1 h2 O% h* R2 `4 ?/ P4 v% U
在Data分栏中输入以下数据

$ G) R# m3 A3 C" M

9 x! S5 t4 R! _# M) Z

# X  \. N! Q; M- }) U+ L
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

: E0 v+ C+ d$ \/ \

; o" q6 `0 e+ g1 [1 `5 {" ~' n
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

+ k8 H$ v5 t/ A2 q$ I  l
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
1 S6 D' T1 A4 w1 v
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
1 \$ }# e8 b/ o) m: B* M3 r, `- R
+ ]  c$ b3 Z- ^1 f, g! F; {4 i

7 q' t0 m3 P. x8 w, c
  在Data分栏中输入以下数据

7 Z2 U3 c+ h1 z+ {
* D3 M1 B5 \7 O3 y" V; |
. m. s2 o* O# E  n) j
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
$ i4 Z0 {4 Y# O, e' Q

3 r9 r- d, x$ N9 X, U
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
+ T0 `' x1 g# @0 z
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
9 k3 C' C7 F* W( P3 h, w/ I
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
6 l5 r. [* ]+ B, g3 V

) F$ I" W; L! \+ B

+ T; I* q9 U/ j3 w3 H
  软件及时生成柱状图,如下图

3 |# N6 N  n8 o2 w5 n) G
8 z% Z2 m9 x2 L+ r  {* T  u
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
+ _8 Q' o- j. P" Q/ y( ~( }
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
* K' N; j. p6 f% D" l
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

: t3 r) L' Z4 Z6 J: g+ P
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
/ Y! u1 I" A( |' v$ Q* _4 t4 V. C

$ M, ?0 h4 w3 u! {
5 c' i9 M4 F/ X+ U" a
在data栏中输入数据
% W# Z  U- e# G& Q# O: B) R/ m2 t
: U& J8 R7 q8 s' @% p# K' O! I
8 {# z: H! W! K, F3 j! }# M8 h1 E
软件即时生成的图如下图

% w9 G# L4 x) Z9 H8 P2 v

+ c! q: S" u) H$ F

7 l, k: \& Z& Q
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
1 w( v5 \+ p4 v- o, H. a% W
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

: @4 h6 Y6 m2 I* u1 [
3. 组合和导出图片
& J/ T. I- K0 k3 A2 x# t
点击layout栏,出现下图所示界面

# ^: a' Z; q) w; K. l. `+ A
# A& z9 b0 s# r' ~+ \7 w  c
* V, j8 H5 D- A3 b2 e

2 a5 T9 h2 g  |  ^' A" J# h8 @
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
4 y" A, q" t/ q4 d: _

6 R5 c) o. L/ Q2 n" z
, Q. C' J5 @! ~7 B, h) g' R0 O7 D6 C6 W+ I
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
2 G: o2 b3 |% W
6 o0 W  o0 u) z
/ u0 t9 e; {5 Y/ k* R1 M
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

0 m6 g- ~' O% d0 E2 S- G5 r) b' Y" U
" T. D% b5 F5 l3 y+ k  r: N
. Q* q7 |+ e  V
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
3 }* @8 s) [2 X2 v

1 u: P% F- j% g( ^1 n9 M8 T, H
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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12+ g" b0 Y6 N; s! R4 i
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

. G3 `2 @4 j* t! o5 E# Z+ I/ N刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
1 d* G. k, V0 h6 a" v9 _4 V$ Y' ]( _& X

' k# z# E4 ~8 n( k( B) H比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。
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