设为首页收藏本站

中国病毒学论坛|我们一直在坚持!

 找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 2812|回复: 4
打印 上一主题 下一主题

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

; W) p& t$ _- U. u0 S& c
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

2 n) Z8 ^9 Y4 |9 R! o) n
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
" i- {, M; R) B: f
——正式开始——

. w% ]3 {  n" Y. D/ L
1. 折线图
; R* h9 L" e) D; `0 ~$ E
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
% H; M# E9 I1 }) }# L+ a2 p9 c
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
  w. Y; p0 U, P6 A, I
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
/ ~7 |, A- x8 E/ ]; }1 {
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

2 s! x: y: Y" u
6 K$ q, O& h' ^# \' l. T8 \8 y

2 L, i3 ]8 S9 K5 H. d8 R" U6 v) n3 z' t: X
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
  T  {9 u8 `8 ]/ T
/ {) }- e! S2 r* k$ N& P. o( n5 i5 V2 A
, r6 h% |1 o3 x* B
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

$ {! W: {8 B2 \# e8 B+ l

  X+ X) n% ?2 K9 h* I0 O  s
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

& N; e4 {8 e$ E0 D

2 ^  e: B9 h: T8 `
: ], s% ^8 [3 a/ L
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

6 F+ F3 V; {9 F7 E1 M4 {

; \7 K" ?$ x) w" A5 d

; l+ T1 Q" q, e1 H: H, }  }6 [
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

- K5 _7 R# B3 _, o/ d8 F* s& k) i+ o

" {$ j. P: v) z: ^% U% \6 \

6 U& n4 _' D/ q
  在Data栏中输入数据
: E5 n( m$ F+ d& Q/ r! K
0 o- l5 T. }9 b% l# g$ u' V7 e

; z- G; J; Q9 R6 {- m
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
1 A" s! q8 W4 k1 k% T- o! A

0 X, N: d& z& q) D& N# o7 b

( M6 ?3 R: U( a9 G- ?, ?
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

) l  ]) W$ z. `' R! O
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

0 P3 z' Z! z9 o; i  t/ |
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
; T3 A6 k; A3 i& j8 i0 @! w
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
0 ~- K" a- R$ l6 r4 m( X% N; x
! [: |* q( _/ `/ m, e+ u5 b
/ \4 J$ \5 {  ?, K7 B
在data栏中粘贴数据,如下图
. ^# y7 R* t% Z+ }! Q

& {4 D. S) J% X* u3 H

6 _- L# c; v( V& n) S9 f
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

* S. L; \- j8 Y+ w
9 X* y+ y' _7 s% C
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

) ?, }/ M+ Y0 W9 ^3 A/ g' R9 X
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
" C0 t) X8 d7 s4 D* X. \$ o0 ]

/ ~$ o& g- U+ G6 m9 e

8 E( v1 Z/ \* T% ]9 {# W
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

+ v2 H& i* K6 f

2 X$ Z. D, C# y/ @
) A2 M0 R4 Q$ ~& o
  将数据粘贴进去
$ q: W4 n9 a4 D4 _" ?- v! d2 `

: y1 x. V9 K% w, p0 X

2 R9 F* X5 e& M. Q
  软件即时生成的图如下图所示:
. M% `' K- X0 y, r5 u' t1 `

& M& m. F; P6 d$ C; w

" W2 P1 z0 _! I! k) ^
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

  \4 ^  \3 }" @: }3 _& }
2. 柱状图
$ j1 F6 c7 ~8 }; `
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
" i- E  ]/ k4 r+ ~
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
2 |  K1 o5 e' `/ ]: ]* X5 n, y
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
; u: }6 B! ?/ \, l
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
& `2 Z! D1 P" j# x, B  q
% y0 W) V7 `0 i( v$ w

# u; a. {  @# n
在Data分栏中输入以下数据
4 p6 M" u. |4 r; _. ~
4 ?8 E- o- m" R' L" F

5 a! r4 F) ?5 h, E8 J$ Q
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

' V& E3 a  k* M% j/ Q% t' t% t. B

, b$ L3 q. z) j. M" L) H
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

8 c- Z* X) i, ~+ O. G; T* }
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
) x; v/ N8 O) d
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
. `! q; f  B5 m3 Y9 V3 U* E& t

4 V; R8 i- Z, r( A1 }2 I
1 ~8 O1 ~9 y& K! A
  在Data分栏中输入以下数据
- X8 Q) m4 U4 w: t& I
3 D. D0 L' H6 `0 W# A
8 ?$ B* _# f: Z+ _6 A
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

/ u9 x6 o) A! r+ F: z/ ~
- V9 y5 @; E# V+ B
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

1 \0 P, B' i6 H8 R( _! ~
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

6 x6 Q- U! \& x0 c# l- Y
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
# m2 G  P5 A9 x, A

% u- q0 O! a3 i% i: ^: ~- s' P

" x! d9 d. o4 j8 P* W
  软件及时生成柱状图,如下图

9 ]8 c9 [6 V, r  V
) \1 \, m* g) Q! N+ U
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
6 _2 Y7 D+ q0 j2 U( ]
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
) n8 V! O. p7 R
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
* @7 G2 K/ g+ h4 N
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
& e+ |8 z1 L: Z  H
5 o; d7 w3 N4 V0 `4 [1 |3 b
% w/ P7 n# T7 V8 n; E+ }
在data栏中输入数据

, h- }, G0 y  U6 _) }9 T+ E

$ Q/ O, M4 \8 e
/ e/ }0 A" k% W% w1 ~( G2 U
软件即时生成的图如下图
5 S, h7 a$ M" q7 w* q! a
# f7 ^- M4 A" ~/ D! o9 C, f' @

. A* u7 N" ^. }9 [# K% ]$ C' l
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
8 i) L9 X4 x. p- V/ J
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
* \* @# q$ A# Z& T' h/ Q
3. 组合和导出图片
" ~1 Q7 Y2 `4 m5 m
点击layout栏,出现下图所示界面

! i0 F# |5 e2 \5 U3 D9 X) t
( ?& d; Z7 D% n3 V

% ?2 o+ |2 e3 p8 [  H2 c( Y, f
) r5 N, o% w7 x* w
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
; u' @4 z' E8 J1 F2 y# ^% n! i
1 i+ z: W  n6 ]7 D7 J
4 c( m8 _9 K  F& U) A. E
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

3 t+ g4 n  T4 N5 @; N

. |( O& [' {) ~

" q( p$ }  P) l
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

! B- {; X' d& y- ~2 q

' _6 h$ o4 u+ ]! ]1 \2 X
; p' N5 m4 P' ?7 o6 O6 g
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
9 ~, @+ r! F+ o$ K; n! T

  d$ i6 n! n1 ]  v
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏1 分享分享 支持支持 反对反对

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

228

帖子

549

学分

1万

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
549
板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!* b# d& P- v  Z* L7 M5 g+ N

6 {- O- Q. J( z9 k) o% B8 ?; ~2 T2 s
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
2 j9 f. Y* ]  x# j满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
* a- V: C! ~1 D6 ^
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

帖子

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

Rank: 2Rank: 2

积分
3
5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|论坛App下载|Archiver|小黑屋|中国病毒学论坛    

GMT+8, 2024-12-24 04:17 , Processed in 0.265223 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表