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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
& p9 k3 b9 h5 g' s
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

5 `  \3 }3 b5 O# P4 `5 e' k( P
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

7 |: C3 n+ s. G7 a8 W# t
——正式开始——
! j$ n; b2 N" B3 `. |/ f
1. 折线图
$ J' Z1 M$ R' O! w7 o4 Y
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
1 H+ w, D* f, b! R% w$ u
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
1 N& B; G2 w/ Y4 s* d' b
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

' p7 k2 a* u2 Y+ X
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

6 m9 T. F& m: R0 @. O9 k( p

; {, }  ~3 _: P  e# D% _
, {9 \+ S; X( r  R& f
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
* \2 e( g& q0 Q8 B
5 u, f3 ^3 q* i5 F. t* R! b0 V0 R

/ B( {9 e6 v. C8 n% K  F4 `
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

3 n. K& t; z  @7 `3 D( \
: k# }, K% }+ ?: n/ @
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
, j6 |' W8 m' a, F" @
+ N% F8 K" \1 I5 m# J
2 Y) f$ a- W! c6 o! G. L1 \
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

& b9 [' L$ j1 U! A( i4 X

# O; `9 G# S! g7 P, E# r) ?  J

( D# m' c- P: ^5 f6 }$ n
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
7 |5 y8 _- i/ h5 a, {+ u; b
1 F2 \9 z# b: J, k) P
: f/ D# B" K2 M0 J& P
  在Data栏中输入数据

3 ^0 w+ b5 e' v3 i% r6 R. I6 w

- P' t; f: y2 |0 o1 K4 }6 C% A& A9 }( x
- e5 d6 `, G, }. y% r4 D$ e) I
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

5 K$ ?# J0 t, O3 v+ F
. f, M: `; L0 k6 ]5 j
7 A8 F* s# m( ?$ c. G( Y% a
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

- S( Y& v6 B/ i
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

8 Z9 F$ A' Z& h; O9 b
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

: N3 k/ a% x5 I- t
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

# E+ i/ y  b9 Y, |

  u, c- H& F; A- }) k. z
/ ~; ?, m& x4 O
在data栏中粘贴数据,如下图

5 A0 v6 ?/ O4 b: R: N5 f  U

7 Z0 z0 `0 E- V8 |$ r3 r# m+ G
6 y% p+ H; o3 e2 f8 ^$ T$ V
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
. G3 }7 p. f- C8 v

  h9 A8 g  s  [  x" m4 U# N4 K
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
4 C# {+ ?5 V0 S4 N0 Q' C" e7 q! W6 e
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
% a. O( Q7 F7 a: a- T
& I0 ~" P! X( o8 |' ^

0 {9 R3 q( b" A' ?* n0 ?2 N
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
: n) R8 _4 J; @+ n

1 P. P- n2 `, W) L# t1 e$ C9 C5 o
. v/ ~- F: P: Z$ \1 W7 }
  将数据粘贴进去

$ ^6 A" a; c1 [

* }9 h* q3 L" K' f0 D. {6 M
5 |$ n1 e, s: e! I9 O1 \+ J) \
  软件即时生成的图如下图所示:

9 q4 W) m& v! j4 o  f# P2 H

! ~+ k- p' _, v. I' A) a% r

* Y- A/ ?) M3 e& j" x# ]8 ?
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

3 d* S+ V% \) {9 y. z
2. 柱状图
. ~8 j- G5 w+ M" i
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

2 r" R4 |. ?; n$ X3 L; e  t
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

9 J* u$ L# {, o7 b, b) w
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

1 e& [' x9 A, g4 X
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

* V; a8 Y1 i( Q

1 O* o: a# ^; B  Q% p% K( p, k( K- O
, }' ^1 X- N/ t
在Data分栏中输入以下数据

$ g" G# d! E( @4 c+ E, N; R

. _7 A" w6 k! r& }+ _3 w, Q' w

# p; f% p1 ]7 h+ y" U* Q
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

; n  q) U8 b  E0 y
7 A! D! x' t1 Z8 v4 c( W# k
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
' g: |9 B6 l! u! Y! ~
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
+ N' q& o9 c3 V3 Z1 p7 P
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
: c& h" }. S* U- a: ^- \. j5 w

) l0 {8 U* r& U, C3 l- P) {8 m

- s1 D! `3 h" Q! ~
  在Data分栏中输入以下数据
5 ?$ X) m+ ^" \6 x6 n4 \3 B" `1 A6 D
* ^3 x' f0 C# v3 V4 o
2 y5 w: ], Q4 I2 a
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

) g4 H/ M" [' W6 q# ?% I: @4 U9 r1 f% ~

' ?1 p4 C0 p/ \3 i
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

4 B! c& [2 c# Y& J4 B
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

3 C* Z4 o. q5 b8 i' E( j* W- K
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
" M2 \# m7 ~* _$ F) y) a1 K

% U3 Z/ ?1 e$ w# r, {
0 Q  Z  P# @9 P9 t
  软件及时生成柱状图,如下图

$ k# K1 n( |4 T; _5 H# S; j
3 m2 A" `% N6 n4 b2 x# t9 F1 w5 \
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

3 W" X0 ^( Z' X, x5 ]* `
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
' r- z. i- }' D6 {
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

/ w7 N- C& q& }- J* g
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
0 S  n9 I! f' ^, I- Y# s$ @

4 D+ G* _# B: U" J6 x" v- z0 F( i

  S" J# j1 T4 e7 E6 p/ Y
在data栏中输入数据
. z4 a) Y, Q# e0 ~+ A8 T
* v- }$ [+ |& k' o9 }

/ w; r; t! p0 ]" v1 M7 c
软件即时生成的图如下图

6 N0 |3 _( \4 B) ?
2 e" q: s9 O; I, V) O
9 v: e4 {) ^' q0 q
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

7 @% H9 J4 @8 g* N. x" {6 ?' b8 X
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
0 o  _  z" B8 F% {
3. 组合和导出图片

: W: j" _- k. P
点击layout栏,出现下图所示界面

+ w5 b  b1 u* x2 A* E- o; N

# f+ y) _; x2 I0 U5 B. X5 y

8 R# y- `" }7 T9 F

+ s% b7 r7 b( d1 S" F: ]
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
1 o7 y4 i5 z: [* s9 G* r- W; o8 g6 z
8 h/ i& E; D/ g8 M( j

' ^5 @6 Y  R0 k; T3 T6 D% `
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
! {, g- P3 O9 |4 u

9 A* m+ W& s9 p( X: m
& ~/ l/ \6 T' p3 Y" ~) {) F
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
  a0 N: H/ [8 S5 z# n6 x

/ ?. W  j$ R3 `0 d  i

4 K0 X$ k3 R( E( M
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
- H0 p& ~; L+ Q; U8 j
/ U. W" L+ F+ A* F/ |
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!6 ?( a1 |0 [% U  E/ @. @  w
  j+ J" L* Y6 ^* p
8 Y0 [+ `' a3 p
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12( n6 z) I1 y, Q; M. P1 x2 @- A  Z
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
# L6 ~9 w4 t( Y" ~& e" g
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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