找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3298|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
7 g( v6 f8 n9 i6 d: j/ x
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
, W8 Y8 C4 u6 M4 Z' i: v+ V
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
- q6 A1 ~9 f8 L9 B3 |: h
——正式开始——
5 g9 \* c/ [) W% u* X
1. 折线图

, {, h0 K+ N% N9 P4 r
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
0 U" H0 R  r5 }; z; ?2 t
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

7 }4 K7 }' W* W& Z
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
  b4 \6 U* L+ |* y0 b
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
/ a: a1 [. m) `8 }

: \5 r0 Y3 I* V' U1 ~, b
" |9 l; U8 h' s  S; B5 _
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
, u+ O5 Z2 v- Y5 N% Y
8 l$ I3 P0 ?" c2 e( T6 l: s( d( a0 Z

; d6 }. r% e; [6 j9 p
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

+ h1 x2 B0 k5 ~3 v- S

* y! P0 o9 T1 @; n: L. g+ b
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
9 U" c9 p( a0 L0 G9 i. i

5 C" f+ j7 V  Y5 y. f  U- N  [
; z2 Y8 w/ B2 e6 E
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
9 e6 {+ x% s1 L5 P1 {2 o$ B/ u$ [

5 T7 C% V4 A* P" N* _; H/ t" B

% Y8 U5 p. M# Y% I
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
+ J' r9 n- u$ k5 z, d8 d1 t+ @$ r
- w* r, Z( @  z! y) W0 g
" L  L# B7 [4 y( E) h+ u8 a1 |, W/ l# y' i
  在Data栏中输入数据

3 w' b4 a+ c& D7 |" u; a, M

$ c4 o* a( w" D; A7 W& D5 v- e
5 z+ t# [5 {: f. d
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
! T, w" e6 V/ }8 R( g5 B: g
' U" |# b5 c1 ~7 D4 D
  A; M8 e: v7 o6 ?
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

( N' H6 s9 _6 q  l9 W
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

3 K8 R' x6 L" O8 P. w
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

5 b- Y- V8 E$ S" m4 P; b1 D: L9 n
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

+ X1 L  y  a  h
7 S* [4 c" |9 H. X; L+ h! t' Z

: \2 b' ]- W; W( W" n
在data栏中粘贴数据,如下图
! _1 v4 e  e' Y. j
1 v7 c6 X8 g2 l* S( a0 l

% A2 k- F4 u0 U( `: d' b" n7 D4 h6 f  _
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
0 j+ X# [3 |; m6 j* h
+ [2 d- d% F/ d: E6 g' Z& v
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
- L4 f+ |- R, H' N, V5 x
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

6 c$ V+ Q0 |& z. f1 |; i$ V5 w/ T1 P

* |; b/ \* b" K3 X% k

. E( |% e/ V. s" Y5 P( ~# A
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
* ?2 f; B$ K/ b2 b9 w8 W' ~* z) [

5 G" M) Z" ~. [  u$ B) V% c4 w

* X( T% s4 B9 n
  将数据粘贴进去

* @: C/ q  }: R1 H0 F0 S
$ j" {$ [3 g% B; i% e( a1 ]

6 u) i' D: U, ^4 @( @4 y7 k
  软件即时生成的图如下图所示:

, E( d/ j1 V$ s. @% w# K
/ S' j1 B- s4 I2 X4 H+ K/ K6 Z
! s, r0 T1 F$ L. F* d* f) O
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

4 z( M2 Q5 a0 ]8 w  r/ t+ Y
2. 柱状图
7 k3 q1 M3 p# k* _5 H
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

" w0 y' J! t: c
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
/ p* a  i/ Y9 x2 q0 x% t0 O
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
5 `! j% p2 {: d
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

6 I) b! G/ _, h* z; j( R) a
- y5 T8 I" K' i  ~6 }( ]
( }/ W+ I% b0 V5 @5 U% v. Q
在Data分栏中输入以下数据
- N: z, f# X3 F9 c* A' Y

5 Y  I/ M& Q; B8 Q* ~; m
- k* ~) l. H3 y# i
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
% `& f# v" a- J# y& V  m9 \6 d
, l3 a% D  s2 y: V8 A
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
; `6 h, f, h6 v' g3 ]
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
& |& j$ S& I0 j5 R$ x
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
5 d( c5 A% L8 l% }# a6 |4 O

, _- u/ [# X5 ^& Q& W- N! V: O

+ y  Y" a% z) w6 @# X
  在Data分栏中输入以下数据
& e$ r& {. @  t  g# {& D2 t

% T8 [: D* s; X  e3 d* ?, K9 U8 }

* o' g- ^* ]+ W- {; o
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
) p; m0 U  t" }3 T/ r& N6 o3 }

# g5 v! e+ u6 p6 ]% L
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

0 w( E+ X' w/ U- @5 t& Q. c
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
8 @4 [! V9 g+ N1 B. J8 X8 b
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
7 c. t" _* l3 V$ w2 L* D
* l9 `7 V* H' ^
; U" L+ n) z7 _
  软件及时生成柱状图,如下图

3 V# C1 p. w" l. k$ m, |2 S6 s

6 n9 Z7 O5 V& }1 H2 x) O$ G
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

9 r/ u# S" r6 g! N
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
6 i6 E+ r  i8 u& X5 w. s( h
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

" G% V! l2 ~1 i0 F
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
1 r! k1 V( P1 J1 J' k7 }6 P

5 D* R. v2 ^/ D" t

! \7 s! |' @( f+ Y
在data栏中输入数据
0 F8 b; N$ {4 F2 o; N

5 p: r4 h6 Y  g$ T+ i: |
% W$ W. N, n) @% ^0 O
软件即时生成的图如下图
5 c6 S; P5 W: S8 c$ y" x# j5 d

- p- [# A& V* X$ }! \/ g
' d& E/ W" T/ W% l6 l
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
# j3 K8 R8 O/ E; r* s3 {- w
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
8 d& U: q$ a+ J& T: t* b
3. 组合和导出图片

! w+ g1 }. L1 E. r% {4 C3 Q" }' S
点击layout栏,出现下图所示界面

$ j, w- h: l0 o8 h0 B& G
( [1 i3 K/ j7 o% @6 x! j
' Z0 D6 T& o/ [- j

( O# c# K( U6 r" g0 T
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

: w, E+ T3 d. d

6 G9 N- S; n4 R

( t+ v+ \5 l8 j- X8 H
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
, c5 E4 D6 j! I( L: S$ ]8 U! @

5 a2 I& n8 ^( F: Q5 [6 {3 [
- m; X4 s0 `) v+ ?% d7 L
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

  @/ B  d. ]4 S

& y/ x: ?/ B: r. X7 K

  \# o3 a% Q. G( t' u# S7 }
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

* E( O4 p* q) t' s8 t6 I
) f: X& W- b5 o; l: X" x% `

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!7 S. J& w: u' n: d3 f- z3 f

+ w  R& B# J/ c, A8 X5 T4 x' a* n0 Z
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12- l% _0 q9 M" o. a  X
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
5 I$ \  n3 m' g8 M( _4 U* x: R+ N
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2025-11-20 16:49 , Processed in 0.066908 second(s), 25 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表