找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3362|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
. P4 [' r0 M( `5 P  T1 r6 _7 }
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
5 U9 J/ n$ V& }$ {
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

' J0 J( q# ?+ Q+ l
——正式开始——
; b1 }0 F; v# b# g5 h$ O. o9 {5 D8 i
1. 折线图
" l. z( J4 _7 j& s1 V+ l
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
6 i9 j7 ~7 V# c! s) A! F1 V, J
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
+ c9 O1 ?" X. J" i
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

+ _5 P1 L! }1 t+ _2 H
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

( i& \7 y) J' {8 Z

. G% |( ^3 l* P7 G# f
8 [1 N, g" [: h( ?  ~
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
+ I: [) X  ^  y* W. F. n) ~7 X
7 ?* V! u$ u' [  i" X3 W  u! L, D. _

4 Z7 w  F0 v% _5 U3 q- F
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
. Z: \( g& [; r7 j7 L! G) c

5 [) L/ I" `$ \( o
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

  W2 `9 z$ O6 r' p) x& g4 g! f; c
$ U$ d4 S& V, [

8 \- S* ?, b- ]  J5 a
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
, |" z; E& H) ?) b: d: U

* r  e3 C2 H) |4 h$ E5 U: J+ t

/ R+ e9 G# i0 E- U& s, {0 c
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

3 D; Z) q& J2 n6 `) g; D. D0 J/ f

1 }5 G5 N: P6 b
) F( s! D3 @$ o9 Z5 n  V+ s" P
  在Data栏中输入数据

* `! Q+ P! H0 o0 G" q8 a  g2 Y* v6 i
1 Q# z/ _, a$ B  b% O# |3 g
8 i0 r) q% @: s7 V5 ]
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
$ c7 g, e9 t) }: v2 m' H* _

+ l! {# `- ^' I* d2 j; a
! g$ r9 l. w  T. |
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

& O% [% }8 A" l% }* O8 H( I
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

9 L' E5 y+ ~" j8 Y) I
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

, A$ d1 a& g( v
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

6 R, h% h9 v4 ~" O# V0 \

0 g, f; g# J* S6 N' x
& `- Y$ W) t, |3 c: U
在data栏中粘贴数据,如下图

/ Z; x) b. F. N7 ]
" B# p  U# |# p' s6 {0 u0 \# J

1 ~( M$ P$ V! v
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
: J% S- P- g( X! v2 m# r

- x! u: {! p- B9 A( `+ @* i
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
- A! M8 U2 }9 W( f+ C. A) Q
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

2 n, Z8 T- x; o8 d5 A( u, j) T
7 O' ]- n4 {" _
7 E7 K% q+ Y' J* ~! P3 U9 U
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
* r) n, s7 s: Y& X" W$ I
/ T0 M9 d$ `- X
( I0 c* h0 h) q! Z9 l" H
  将数据粘贴进去
( O+ O! d+ K6 }7 Q
( p7 M9 s5 ?3 P0 b. R

0 n; S' R( b$ L  n1 z3 k/ F  Z
  软件即时生成的图如下图所示:
' h4 X& z5 Z2 W/ i4 O/ ~3 o4 ^- G, f

1 x0 D# B& X2 {) P

5 Y2 i4 S0 A* C8 |
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

3 W7 u  B; Z# @3 C4 n$ D' Z8 r
2. 柱状图

" [; {' P3 b# M: J- H! N/ Z
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

$ m. x0 }0 |1 _- L, H3 G
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
' W- c" j; L( k7 H8 [
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
8 ]8 _4 v; E& m0 Q7 y5 l4 S
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
  C. {6 R2 V: r$ ^9 L: ~
& e% l9 W: T6 X5 F5 b* D$ D
9 R' \. a7 S8 ?3 a4 s
在Data分栏中输入以下数据
: q2 T  f* c5 Q. D8 t# V8 R1 N

$ t5 M6 v/ F- C& M% }4 W
# v7 h: s' c0 _5 |" D
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

) Y# s! R+ B1 G+ n: c
% k  a4 A9 L2 v' H) ~9 D4 K! `
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

4 l7 Y- M% Q3 y
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
' y+ q7 s8 e2 ^& }* [
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
# N7 D! z* y& O5 H

' K6 ~5 ?5 k# _" N" _1 w, N
/ v( u+ K1 W( d2 N3 |
  在Data分栏中输入以下数据

/ z6 B4 t5 K1 p; V( c

4 _) n, w  `( |- g" I8 p/ v

2 Y" j8 r! _! N1 z  d# f
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
0 E- r" F5 R* w; E7 {/ n8 R
2 L  G7 c1 ^2 c) s4 ?
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

: Q. S9 ]1 X/ N2 b
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

. x- b, {' a' h" n
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
  A1 H0 L: O2 X; s, I) n
* Y6 }6 P9 U, i$ m' N

2 {6 X  w  L5 o5 I1 _  B" g+ L
  软件及时生成柱状图,如下图

0 H8 m& {' I- J" \- A
+ @: i) {+ ^$ l6 m3 C; \  q: k
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

4 x' ]7 x% L1 Y7 ]5 e: P- m* V
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
! s# G/ @1 R; Z6 M
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

( x" u3 D2 D/ Z, E1 L& D( b7 O  L
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
8 {2 L# G2 u3 _! E" m5 J

: V- N" ^5 w) r! B* P

' S  L1 U  z5 A0 Q+ y
在data栏中输入数据
3 ~$ j- M* ^6 _! `# \: q

7 {9 T# G+ s5 Z- V6 |
6 O: i0 ]7 j( V
软件即时生成的图如下图
5 f7 z' d- e- A; H& E( F

, u9 M. Y8 t% O1 q! F8 G' s) I
1 _- ]0 h- g# J6 F3 Q3 y1 Y2 V
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
$ R' @8 D5 l8 ]+ T, N
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
1 C5 E, ?. f0 y2 m. O
3. 组合和导出图片
0 P/ I0 h; M( t/ s% _+ u+ _
点击layout栏,出现下图所示界面
' m, P: U# b" F5 _; o# P

& o7 r2 R2 c; v+ S

: E* R4 Q2 W, x0 x

. M; t( }  T1 L1 R5 j' M
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

9 y: ]* P3 u, @. S" T3 B: o
8 q8 |3 {1 y0 M! p* U  @

! O5 X6 _" U- ?( t4 V
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

$ [8 P5 o- j% V; Y4 x1 D, l: }, t

0 ?( \1 P; H8 b: @
2 y9 ?5 b- u' ~- P
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
0 f5 q, i' n/ v( [; K+ ?
/ E8 z9 S  G/ a+ i( R8 ]1 h5 `

& p7 r+ ~, g2 v: k$ K) H( ]# v
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

% L; G4 f# ~! i' c5 M( r, H

' @1 j/ o, v1 n9 d9 {

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
8 P: L% C0 K0 s) f3 \  ^# A: G- d5 _/ M
  p% t; l0 G1 w6 @' B5 E
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
* x4 I4 F8 x8 x# F8 i4 @满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
$ b: y$ }9 W: J; [$ A8 [
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-1-22 00:21 , Processed in 0.070923 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表