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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
5 W# D6 @2 F* L% V: K
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
; l( n+ u- V' L6 a% v, w
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

8 o* N$ z- G8 I
——正式开始——
( N1 O* e5 n" b2 }  k& q
1. 折线图
" D" i- B: o% C3 j' t- a# T+ i, J
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
2 V  d/ y# q9 X' L; s* Z, x
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
$ O. |2 {' R; J) q! t/ ^
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
' N5 B% h) n- k& x0 E, K% {  W
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
: M* M) U+ H  r* W7 n, o
# U8 ~+ \0 d6 N, m1 g) e* t, o

3 g- N$ B# _- \' r( L  U
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

9 n. i4 Z* {; @- j: e+ O' s

9 u5 d6 [; D( x
9 L" x; C9 t. ^
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

8 v$ w. x6 `9 K7 D( H% A' ~
% v, Z* ~! T/ I% \9 U( u) v2 L) ?
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
* Z; x# [' k$ N

3 e- J' y, H: ]9 d
$ A$ Z, u5 Q) B2 {. Y4 p% {0 b
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

* F" w" {6 i  U- Q

9 z& ?+ }8 v( |8 E; X

8 K& M7 ]% q0 l- d
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

! o0 \3 }/ y6 Z+ g) Y3 o  B

! K  c3 V: o; o, D* M% o
6 S$ S1 [# B7 p3 Q# w
  在Data栏中输入数据
) C7 Y& n) n' l2 R* }
' w$ X7 X% {" o3 \8 j' J

) t# I3 h: J) \+ ]$ ?
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

+ ^7 Z! e5 m4 P8 [

4 g1 a  Z9 b0 e* A' J/ f- S

& K" ?1 Z; P! u
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

/ l0 [2 Y) o6 G5 |- r4 {- G# Q! M9 A
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
) f& B; i# f0 c
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

, p* u  i+ i* r8 R% S! h
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
+ W" u/ \2 W  M4 H1 v# `
6 m# A# i0 z. d; c

6 Z' ^  X" R+ Q4 ~' q1 l
在data栏中粘贴数据,如下图

! G3 {# C& v+ |0 H+ h3 S# i
+ b3 ?* I9 ~5 w: I! o, P
9 E. y# G$ I. c" q' p, M
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
7 |; F  O4 I5 O* f" @
' \" l" ^- Z6 N2 f* s
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

5 S5 |  h: o& O5 `. W
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
( I* y  m2 \' R8 g3 G
! J% |. [3 a- a; G5 R  E- A8 m
, m# G" P; `6 ?
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

4 {* C5 V) N( h# V4 K! K) z0 w

' @( l. g! z; X" x) {0 o- W: o
. X2 F" l8 k, j4 f: n# H% V
  将数据粘贴进去

8 e# v# R- f( o! I

% g* X# t7 m2 F9 O7 \2 d

& T) u; k+ C- h* G' m+ {, j3 w
  软件即时生成的图如下图所示:
) _# e" ^6 j+ _8 w( z' w9 I5 c6 x9 h7 |

8 E; X- N: _: M

/ d: z9 I# Q/ T. [
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

. D+ k! j: K  D
2. 柱状图

" `, h5 m& n2 b/ n7 h" m
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

& ]) f7 w  s( ?( g" N
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
: d8 a# W; o$ ^3 o* ~7 `
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

4 Z. G- m) T" e  h) |
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

. c. e! J1 E  G. L( N6 Z' Z
& g" T& S$ i2 B: A
% B( s6 J* k6 M/ O, {$ C
在Data分栏中输入以下数据
+ L9 o3 k. V7 B/ c/ p6 c

: b2 I& Q  J5 @3 p
4 z7 @$ C' p: L+ b2 k
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

- I' x3 B  H( F- ]6 ]
9 E& r1 j& w5 ~$ `+ ?) B
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
' Y' c0 e* Q# O  e. [' \5 B4 Y7 w
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
# V# W; B7 M: e
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
3 R& O1 ^6 A% L% G) s

3 l0 Q! X* T% b( O  u

9 f$ T. m9 \2 x$ m
  在Data分栏中输入以下数据
1 _! \0 E9 ~" g  r- I8 s. f

4 D# I$ w5 T8 X/ _& Z

6 T$ p# \7 w, }; ], n8 F- Y
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

( s( B! P9 T4 u4 D5 ^1 @  e4 s5 u" y
. `$ s6 ^  T1 M! k
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

4 C; ^+ k& x6 f. I8 ~- n
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

$ c) f$ g2 B/ j( _9 G1 B! ^6 }
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
9 ?8 H0 }/ i8 H! k4 b" q
; w, D. R, [: \. K9 t2 L4 z
6 w0 v7 ]! b1 j/ d( N; X* f
  软件及时生成柱状图,如下图

$ Q4 e9 l) X! s
+ i  u! B+ r3 }* b
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

3 ^1 b5 |6 O- r7 F- u4 W
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
3 \8 ?* G2 Y2 a0 L, S
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

% @, t4 d4 \, |3 z7 Q
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
4 Z! H3 r7 H3 v) N! Y6 T
" F5 `" a+ o6 q2 ^, I
/ [9 M/ _) U' S/ i8 C8 @
在data栏中输入数据

5 U7 [9 V# V8 E5 A5 R5 ~1 \
8 l% A6 u6 H+ V3 C' O
  x1 `& r9 d9 E- r1 a1 a
软件即时生成的图如下图

8 r! b; h0 k/ y2 ~! z

; }  D* ^& b+ ]4 J! S) _: \! Q' [

7 V$ s$ v/ e0 W7 y2 K: H
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

4 W0 a: X% e2 E4 _0 B
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

& _& C9 @7 Y; f0 b
3. 组合和导出图片

# [5 o# T6 ~, ^( C( q) M( {
点击layout栏,出现下图所示界面
8 [$ Z3 {9 i% ?( P4 l  j
  K7 j0 ]- y5 G5 [4 I
* ?8 S. N1 N% j- u! O
/ B# [: M) x, ?* f
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

/ n; T+ \9 h7 @: f
6 D8 I) A$ Q1 F( i0 C' h8 H
$ a7 [9 ]! r! }
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
% @; S" w) Q8 i* C" a& S- m% p

3 G0 o2 A6 W7 w# S) w

8 G  h# @+ \( S; |6 Z
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

9 `  A% X+ B5 {9 i; [: k) `8 H
( z9 }7 w6 ]  `. I' \. F

( ^: v1 Q3 `$ G4 n. S
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

1 N  L$ u5 `) n/ h* ^
: F7 Y2 q0 j- t, \

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!2 C# b7 M4 U/ [5 R

- W5 H  I' t3 F: Z# x$ J- j" O& F
8 Q2 T2 M& O3 ]  x9 s比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
( [, a' _+ p0 M) |8 I& d# x满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
' o# S4 ?$ Y% z4 J/ E
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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