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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

2 J1 W. d' ]; W( {! ]6 S# V
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
3 [, `8 X: l9 m
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
  G$ c' [3 {# z3 D. k  u
——正式开始——
! K. k% \0 Y& U9 ~1 [, j, }
1. 折线图
) G& j8 I' _" q4 a) u
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

: M# h6 c% E8 }8 [
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
4 m# |+ q- A' V1 K. }: Z
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

2 L9 [: V1 R: l% s+ t* C
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
* q: }# C! s# \! j- g
0 i# Q9 |; U' v/ I

8 z( T; E% h# W4 q6 ]
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

2 ^# P7 q1 R) ^& ^
" S7 i7 B& t7 `' L, U

: k7 o$ F7 u& @9 }% Z
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

% h; i+ P0 @* |4 e

* i. U  q& Q7 {" q4 k& s" b6 D) N
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

6 i  N; U' @( m  {; I3 ?
6 |" z( f8 t7 w, R: w
1 W4 R5 D1 B% z( z9 I
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
' f0 x2 n" N( D/ G1 j. W' i
/ [4 I0 `0 y0 G8 [; u/ N

) w, `; B" u- x" m& P
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

9 ]9 |- k) R  o; y9 b" j9 b

7 Z, |2 Y8 q+ B
, v* c( R- v% A
  在Data栏中输入数据

' l% X0 W; c2 R' k7 ^5 x) I
5 W/ P/ ^5 A# B! y) B( X

) X: z1 w9 m/ i" i4 D
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

9 f! a# v9 Z' L) _1 l* S
& V8 `% k! B) y+ y7 K7 p# ?) [3 c
/ `3 ^, Q9 E1 e1 K! R
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

3 c+ y( R' b) y4 y$ G; ]* d' J
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
1 \* e" J1 E5 r, |
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

. J& R+ n& l3 F+ N! I' n, ?
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
8 h8 R! A3 t% y

' ]& I  |7 t! T- W( F# Z

' ~, T; H% e# M
在data栏中粘贴数据,如下图

) |# L9 s' m; f8 @! v

2 t$ F  {7 G3 x

1 ~: ~; b9 a' ?) i2 Q& t4 M
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
6 q! T: [% l$ v/ ?
1 ^: k& q8 O- `1 h" I/ E* @
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
/ A% r2 v6 m3 l; B
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
! p7 s& R& W, T
9 l$ p: v) n9 \  [( z

7 ~. d. V& y! l6 A
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

- E( Y  S  n- l
8 L# T' ]2 U  k: Z# p$ Y. B. P

- O$ m/ y7 D1 i3 V' B5 ?# [0 H3 @8 j
  将数据粘贴进去

$ I- {4 T; c) }$ N2 A  `% {& i% K' m

8 r$ `) t; J6 b4 {( L

% {6 g6 i- b1 K3 b5 Z
  软件即时生成的图如下图所示:
6 f4 j0 E  S8 A0 Y" n, Y" `$ W6 O1 c2 f

4 c' ~; p( @  w, H  F; O4 \

1 |" |. C$ t- E3 ^0 j7 g3 h
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

5 Q1 P& N( D3 B& K0 P: p* R( r
2. 柱状图
& \/ X$ [6 N/ ]3 D
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
1 J/ n1 V) j/ L) c7 u6 B3 ~" [
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

$ j! f; T& Z7 \" ^/ c3 D
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

. h, L  j, ?/ P) k. I
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

" c" Q7 f2 D, {6 A$ ?9 Z- q
; K, f+ ^- o( v9 s7 `2 R4 A4 v4 y
6 F, f0 W$ g9 ~& [. P7 ?
在Data分栏中输入以下数据
. T* X8 g" @! t* A4 G4 \, ~

2 F1 P/ z" q, X( r: D1 N, c8 e; U
  P3 K% g' G- \  g
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

" s/ {% ?( h  _: s
  s7 Y) g7 Q9 \3 Q3 L9 I  v
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

; s9 e* `% c8 v* n
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
0 m8 f: K; F! f2 g
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

7 P- S& q- c" `0 {/ \

$ R" x& i$ o) a  Q7 R# I4 [( u: l( [
% E1 ?9 w4 \+ s6 ]6 w
  在Data分栏中输入以下数据
5 N" P' L4 G; l) Q  U

' y9 e* q- l% Z6 i
* D" V# I, d2 w4 B
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
: i; V, R, ?: Q' v
( p/ c- i2 T8 K! D4 S
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

1 L; H( y; s8 [1 P) [# p6 I) C
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

8 c: L% T+ o/ E: g' ?; P
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

: ?: w; X- {9 C  j$ [4 D- t
' |! y  e$ P; c# c* [

& Q: ]7 [5 I7 c- r) ], ?5 L/ H
  软件及时生成柱状图,如下图

5 e# y) t- d# r! @# N
) ?# y/ s  q( F. y8 t
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
: `4 X- M. ^7 u/ `9 N
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
) c1 y/ r0 }* y$ V% c
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
! I, G) a# h) Q0 T; c1 D
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
: _" N  j& v+ Z8 e* b, _8 P- W

9 f8 f) K5 t6 q7 L
9 _" Y% _$ b2 X2 v
在data栏中输入数据

9 _" U' B/ A0 r% C; s
, x6 ?( T/ n8 h, W+ e

: K1 E% v- p' O1 ]
软件即时生成的图如下图

$ L2 |# S/ p2 e- w9 u; H, B+ b. R
1 m6 K) v4 J" n$ Z7 N3 B* }" `

( b8 P9 V: E0 a8 P  p
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
1 Q7 I+ s; f* `7 h
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

9 Z( Z5 h6 D  z2 [2 G! |* S
3. 组合和导出图片
/ l  U5 j7 @" U: D; ~( L+ o
点击layout栏,出现下图所示界面
: U* M' {6 Y6 G' f# S1 F) i

* o9 S) L8 t" A5 W
( K5 ?1 ~' B& D& [
* d5 v- d5 E' L4 r$ @
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
, B2 ~- N3 F& b; ?$ n1 j6 j4 ]( Q
6 V, _) F2 k, x, }, r

6 l7 U4 y- ^5 w# [( S
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
; q) Z: d8 K. e0 }/ v
% V, {9 H, Z: Z9 E/ l

8 p$ h, z' u1 P" Z. H
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
# D& u5 Q: F# ^1 I4 _3 V
  R. V* l) J% H, t6 \* \
, i( H6 M+ _+ d% x
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

7 P1 \/ e0 x6 W# C

) L2 o% N7 s' G# D& B1 [. `

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
8 R9 ?! a; g( ?( G
! t) P4 T2 G2 q' o9 A6 W
3 K( ?% Q0 ~1 l; R+ M比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:124 k5 s1 [7 k( C8 i3 @6 k
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

( ]! M0 g2 ]% L  M0 @1 z6 g% |刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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