找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3794|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
- o! Q* Z: }( k  P, v" r/ c% t5 B8 R$ v
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

8 ~9 q4 h' X- R9 N7 q
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
+ a6 f. Y1 I! n2 x/ t, Z
——正式开始——
' j+ x4 Z4 w& F3 @" W& g$ U
1. 折线图
, B# u6 A5 {, j
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
6 f, J. c$ b" Z4 V9 p" ^& P
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
1 d: H( f, \% j+ b+ s
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

& ~4 f9 l( V) n
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

1 }9 I5 _& N, p- M9 p- R
1 ]  v7 w+ _3 Z+ K" d) ~- a

7 w+ ]- m* k4 U5 W  Y
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

2 Q" v- Z( x) j" e7 ]
. _; k+ D/ r& o4 s
0 w& g. z7 B: B) k7 e! J# ~
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
% y1 x! G. {& Y* H7 T! I# C

. h* Y* T+ l8 ]2 e5 g" R; Y! Y1 Q
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

6 W* W" r6 a3 B7 p9 H
5 V# k( A( `2 v# \- W; \
, {4 b8 U/ H! K: I0 ?0 E9 B' F
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
. M( W' [0 O$ `

& F" d% X, B; ^0 Z  q- |, y
: {$ N, ]  Q. }# {& P9 C9 V
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
* q& u* e7 j& P7 y$ ?9 W# J
7 z4 F+ Z$ o. m& a: |  U

8 S: J3 |0 e; Y- M
  在Data栏中输入数据
( Q$ _4 z% ~1 n% z9 G. u
) Z) _2 z( Q, d) O

) R4 Q8 o% }! h9 J+ t4 Z8 e4 b. V, p
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

& ?  m- J2 ?. ]9 E' a+ ?

& G9 v  G9 a* s1 l7 b

; h- M, T9 E* j4 ]& Z% T4 J3 H
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

$ }3 o" i& j* J$ d) m
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
  e8 r5 f' E# M# L1 o; l
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
2 B: N+ W5 r' s% u+ S! B3 ]6 ?
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

0 g0 @0 E7 _# y; @" J

- M6 G- k- P8 q% Q; x
& s4 Q2 h4 P6 g
在data栏中粘贴数据,如下图
0 }. F% l' b, y! w
5 F- ~# g) p* Q
# V: b  _5 r: T" f4 `2 y( d4 D. {  N
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

+ Y0 n) t- d0 [( F! C; E) J/ c/ V
! n% r1 g# k6 W+ Z. h3 _
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
, E# k9 C5 S% L, W
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

; J5 b! E# a* d. E

6 y! g7 z  `. O! F6 g
& {1 W& ?. Y0 I4 D% m! Q
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

  S/ N! ^8 t' T& x2 f0 [

' T( d1 A! }& Z8 l: _9 O+ X3 ^

$ c5 O+ R( B' v# c- D
  将数据粘贴进去
: C8 ^6 z/ M" Q: f  S1 r$ V9 j

3 G8 f% Q, ^8 S8 i0 r! C5 y! x

) g9 G( o* ?' v* G# [4 c6 \
  软件即时生成的图如下图所示:

$ R& V2 N5 V9 N$ \
* |; E- T, |0 Q5 f# x: K
- v# ]# A$ g- V+ p% i2 r
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
# v, Y% ^. s) V
2. 柱状图
0 [7 i6 u3 [3 ^
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

; j+ c* g: `$ e8 s& ^8 h2 A+ B
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
" T& C7 n0 `( f: x, O: L' [. G3 \
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
) O9 s# Z1 k9 ]( L$ r" a. @1 H+ |
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
2 `" P3 `  e9 l6 `, u( z+ K

( G( t7 `3 D; s, |% D2 V
& _# |* w7 }4 A+ k+ m% |# w) g
在Data分栏中输入以下数据
/ a" }+ K/ ?+ o) o/ _

: l# W2 t) h4 f* z$ ~

4 G) i2 H5 r: r5 `3 e3 l' Y
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
' a: }7 h) j3 t
3 _+ i) i. D9 h8 H6 f* E$ D
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
7 P$ t, `1 v% N& {( U
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
/ S, R" j5 w0 x2 e7 G% \: M
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
8 S6 d8 B) n% \) V8 J$ @

. j; v1 L5 B: r/ V

% V& S+ c* |# ?0 P0 ^) h* E' |$ N
  在Data分栏中输入以下数据

" w* o+ k  x0 b" Z2 \2 e
" b( m9 }- }& p- G

( [7 G* }9 L/ w& q% k; P% h
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
9 L" @4 j$ G4 D( Q

2 N- N. s9 x5 R2 M, s
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

5 K; y6 ^% t3 W; V) Q, f- l
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

1 J+ }1 U* P0 ^! A% Y3 s
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

$ k* y  M$ G& g; L7 F+ P) o' n( [
7 M. d. C# V* h9 |  g7 x+ h

+ Y/ h9 @2 i5 M, ~
  软件及时生成柱状图,如下图

( r# t. |, `+ @5 W6 `
" r5 {: v; ^4 B& L5 ^
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
; }/ C4 L- J: c4 z( D( }2 R
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

& y, N" a' v4 w! i, `: v$ O
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

3 s: ^4 g  ^' Q0 F; r
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

5 p/ b7 f1 J5 ~3 ?2 ~8 D8 X
" j- V8 c7 [4 p( e/ z. X

! W  G6 ]4 K' i5 A. b7 N5 f* k
在data栏中输入数据

+ m" X5 F# J# X, P
/ _7 B! _: f, T9 O2 D

+ o' U- f3 n5 H: R/ z: M; u6 x
软件即时生成的图如下图
; _2 }7 I& H& T; V6 h! V' t

! \& ?7 T* R" _9 {# s, a+ ]4 v% ~
- ^1 T$ E$ s: V4 Y6 b
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
! [) p, P4 r' N, J" }
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
3 h( R( \6 b' I
3. 组合和导出图片
4 k$ B0 {8 I+ P" ~, w
点击layout栏,出现下图所示界面
8 o+ }& W6 F0 S8 t4 s+ K1 {

7 D8 L2 M, {; w
$ }6 p( ~8 ]: Y

8 R* ?5 \) T, E: }; U, h
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
2 |2 g1 A# ^3 a- o8 c: P6 {
  i, ^0 m: i5 _- z# Y

5 ^$ G# v8 z- U
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

+ E* R  ^- I& M" r& O$ T7 x
; L9 ?- r. H7 X5 X
0 k) G% b8 j  \" s  o6 ~
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

$ p+ X" o0 v" ]4 R# [0 s1 c7 B( y
. f, T5 E6 A0 y1 x9 |4 ?: _  V# r
5 w1 ?% w: U; w7 X6 Y
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
4 e. W4 L; A% j" w3 i8 q* @0 x

5 a$ m4 R8 }! [# l2 _

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
/ A/ g  ?) `- q0 j
& ]6 Q% f2 ?, u$ s& l: n
! x# h' z0 c# E, D# ?) \比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
7 a7 @6 ^& D; d7 I5 _满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

; T2 u+ F! Y. L2 {0 v刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-7-23 10:47 , Processed in 0.059613 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表