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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
) Y! ?% P! W" T0 o
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

8 }& G/ r# I$ q: j) X0 f
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

# L$ R9 B6 Z: z9 j$ I
——正式开始——

% G, _/ o! m0 Z& b9 x
1. 折线图

) _3 L2 E( S& l/ M
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

$ B3 T# f5 D+ ^( i
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

, {( M1 n2 H6 n3 e
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

: \+ d. S  @7 k- g5 \
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
- t( T8 A8 D; v
7 m6 i# U# W3 W2 I5 O% X5 l1 @
5 o1 `6 J3 Q) U: r1 X
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

6 `' q& p& n: e

3 u1 m3 `* B! Y  d( y6 X

4 P4 x  F( F3 g% s! F3 {1 ~! K
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

7 Q* Y! x5 P/ T) k% T
" J$ W. M3 W5 K$ R( J. J# D
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

/ \, l( B' r5 A8 @/ @! L0 x

0 E, ?! a  M9 M

$ M  Z0 X* Z9 D) [
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
$ }1 q$ v+ w9 s, E% f

/ S: e0 w& F5 p# T% Y$ x) Y, k$ X

: ^" y: B0 H7 H/ l& a  S) r+ ?
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
9 g: J7 P& H  v

6 v( A' B% J% v: y, `

# F8 ?  Z2 n7 i  L% Y4 t7 O1 ~7 x- F$ U
  在Data栏中输入数据
( O1 O& J' c2 P6 C: I: [, O; N1 h

" |2 G( m9 o8 ?: T! S

. m0 h) f6 F$ _# ~2 D5 c# G
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
! E& v( B3 W. T
4 E; A* d$ y8 \: i
/ Q, V6 m# u8 ?5 d
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

1 @8 N% l0 d; x8 }
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

. S# Z, Y2 Y  V) M# z. \: E" A
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

) X. D9 j' J; {/ u  @, x
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
5 W/ A; l/ c" B4 k* B! U' ]0 V0 m

3 w' ]0 A" V: ^2 a5 W$ c1 h) ~' M3 I* a

& T! H/ N0 e7 b3 p3 |
在data栏中粘贴数据,如下图
5 F& i# b. u- |3 t" C# {
% p& C, S. V4 q0 y! ^  _: v! J

% v% ?8 K8 r5 B, ?- O8 J( f9 U
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
; e8 |) P; U  g7 M; O! S( `! X5 q6 x1 O
9 M0 y0 t9 u" l# ~: @% L
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
, P# y* K3 Y9 U% R. \  @. R
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

& X+ G% s) X7 o6 ?. c; R0 [4 `' H) f
( @4 [5 I) _( i! Y* M
9 F, r8 _& y- B2 ]. _" u, O
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
6 h+ z+ F9 M! G/ Q

6 z7 R) y* q* P) ^' J" Z2 b

1 H; r" B& i8 K
  将数据粘贴进去
& L$ ^& A! Y1 M# W2 V4 z, }
+ m8 Q" C$ r3 H1 n( M& g

( v, a6 J3 ^6 r- Q9 h9 P
  软件即时生成的图如下图所示:

5 ~, T% I& G5 m) f& T6 v/ j# d
' P* a1 C2 J# r! U7 `- Z1 Y! P

' k5 X& u3 Z+ Z0 r4 d
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
0 I$ R0 V0 e* k+ P0 y
2. 柱状图
0 J" o% n, X) h" F$ Y/ a
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
2 i) [! R6 g; C- u( t/ a
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
  |# k9 k, k' V4 q) p6 L7 y
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
' w% A  o. [6 f) w3 r
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
0 W& h3 M' n! b; [" r: C, ~

7 v" d. C2 c; o2 G& [
$ J) J" x8 w8 w$ K
在Data分栏中输入以下数据
' A# Y$ o, z2 R% v% w

' V1 t3 g2 E) `; m' k

1 j- R' d6 Z( O# `/ c. g* B
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

% w- ]1 Y7 S* Y/ m

& S) ~, x" I+ F" Z6 o
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
% \# o9 W; Z: ~! C4 B8 z6 s+ a
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
$ J8 [6 p, p, Y% F
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

, Y, b# l% g) B4 h

& m' g8 o* m7 Q

6 q, Z) g0 ~: @, f9 _# L! O! M* G
  在Data分栏中输入以下数据

+ J3 g: d7 ?! m- K5 T0 `( l

, q# S$ j8 V0 s* R/ P
5 ?7 U/ G7 k7 t$ W  B6 A1 I/ X
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

/ b3 x" Q5 R3 t/ l
5 R; j) Z7 q4 }1 n! M* ?$ R  k( W
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

' e  J0 [, o- o" k$ ?* S
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
& J6 A' U- s, b1 n
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
$ e  w! O0 ~( s- e; l. U+ }( p

( f' ~9 a( `; T6 P1 T! r
3 v( P( k( [7 |6 L0 n: L  J- n$ E
  软件及时生成柱状图,如下图
4 j0 Z+ h7 D2 l6 U! ?

+ h; D: f* I# s+ `
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
$ @/ c6 d7 k/ N& }; j4 e
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
. \$ M9 u/ v/ f$ r3 O
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
5 Q8 P: ]/ h* u9 C( f! c
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
0 o' p8 U7 S7 j6 t

1 W- n: ^* O% m

/ K2 n2 k0 g. R4 L$ F3 v
在data栏中输入数据
( h' c; S  t, T: |; M
, `( c0 i$ _9 s9 W1 R9 c
% ~# }4 e) S! {4 r7 h) i1 I% A$ M
软件即时生成的图如下图

4 c# S) s) o  @& Q8 o' V
) p4 [5 R, E" I( ^# ?6 J

" Z" D% t5 u" l& h
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
, H6 j+ N( |5 I( d9 p
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
. k. h% k1 f7 F
3. 组合和导出图片

! D$ H  h+ _$ {% m  `
点击layout栏,出现下图所示界面

/ d, [* L& T9 @8 s/ F* c7 Y  g8 V

" k# Z  J& u- {9 r) [' G

: X8 c) ?' e2 l7 \4 I+ |9 x

! s7 {& u& m* I, y! S4 u+ i
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

" D7 C* E, O: U0 j2 K) P" b
' S; Z. S+ v' {- ]/ i

" k& v0 f" o0 T# T- e/ h, z" R
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

# T9 i$ a) }0 c- a: @. N$ K: B

6 v4 P$ t* B' r) H

7 {3 Q# m( ]3 ^+ S( c# F+ ^
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
" c6 x/ S, U3 t
- m$ s: K0 e9 N8 C3 ?
0 y' D$ n3 K0 {8 {9 e
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
* i; H" c: |# O3 k2 C5 G
/ {* K6 s+ M2 V& a+ B

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!/ L' t* I- ]( a# Z' |% p* I
/ z. _, o  |/ J7 p$ ]: H
0 A1 ^8 q: k" i  N) L) T
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
: x+ }7 ~# a8 v  m1 h满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

8 _/ m8 U- R; j. A6 D$ F7 K刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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