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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

  j- T. Q4 o- ]1 a1 L2 ?: z  H* }) D
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
& h" f$ i- R& U
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

$ E; V& G' w& M4 v, `
——正式开始——

2 _9 k0 r8 N& ]+ X8 r
1. 折线图

$ X4 {3 X' R; c- g
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

4 L# q6 m, c& \# N) z( E
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
8 g: f5 O, ~% B1 v
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
% f0 Y; `. ~' C3 }; z
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

7 n: }" N8 y6 p) u" }
' k7 @) M& ], _. a5 T  m
2 h' r# e" M0 y  z
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
+ n( w# h) a9 T, ?1 _3 L. D
. g' e. N; X# G, i
; g$ F/ `' T4 w' Y- Y4 w! `3 r6 k3 s
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
$ p6 y7 [6 I6 X/ H6 q! n

! ^0 ?# M3 P- l( T, u3 {2 h
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

8 V  s8 J1 G# j9 b5 p, K+ x
4 m; w7 `. i% z7 Y7 x* x! B

6 K) E# M8 ~7 W% S, i( k
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

* p9 l3 n' u/ _1 M/ g, k
0 x1 C* |( y* ~% J$ E/ w% S

3 ~9 \0 h$ i" h4 K3 f( M+ s
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

7 M+ z0 Z6 G( Z1 @1 Z( n
  _4 D( U$ B' C! z! ?6 A
6 d4 J- ~5 U. o: M  @
  在Data栏中输入数据

. C/ |5 l" z1 y7 u
) W4 ?: C. r5 S1 d6 R  |! c) ~: A3 g
7 e6 g& }& A+ [6 x
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
8 R7 s7 M. a# V& P8 ~( j$ p* V
+ i# T" w' n5 i' ]6 @& t- H
. P$ ~5 ]$ }0 z
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
, Z$ x8 n* c, W5 r9 m
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
5 G$ B' a& I0 f! g. [
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
& y& x# R4 b9 b1 G
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

# x1 b2 o8 l3 g9 @. y9 I
) H5 M9 y; Z3 O6 g( ~

+ C, g4 O& E4 z  e% B0 D3 v7 V
在data栏中粘贴数据,如下图

$ N. C  i- o" M3 E7 F3 _
6 C3 P. y* S3 Z2 o3 E2 w2 h

0 C! P" X' ~2 t
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
# i, A7 L$ I6 L9 Q! Z9 {6 y

" H, m4 l' B7 }  s& X
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

5 O& _, N' D* J7 J/ {' I2 O& \/ K
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

2 F$ P9 _# q, c; H7 |
1 r9 _( a# A' ^% h% h
/ R+ I, [* O) x% w5 s
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

# C" ?" y6 W1 z8 j
* j4 r% X6 Y# H" E' r) _
+ a0 a- u- f2 j  ~0 f. _
  将数据粘贴进去

( W+ ~  h/ F8 ]
% j3 R5 {. ]& Q% M7 C6 p$ @
1 d- s9 f$ g& l8 ^" t; D/ D
  软件即时生成的图如下图所示:

. d' H2 i1 M8 e/ u: u: e

$ `7 ~7 v+ A2 I* \: u% \& @! F

0 z" s+ b: P+ [) L# F
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

  ]& g& I4 x8 F) z. f' _$ E
2. 柱状图

" m# T' r9 d0 L3 @
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

, A7 {" R; h( V# X" p
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
, w. D: J( }6 r% T& s3 X+ \4 N
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
8 o+ b! i, e' ^+ U4 H% D
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

! S0 m7 Z$ l& T
& h7 ~0 f- _& X/ N5 t- B
7 |# ~' e3 ^  Y
在Data分栏中输入以下数据
  {8 W8 t4 L: ]# b- N) J; n3 W
" l4 p. H% u- ?; k# L. u
/ B0 G# b: f- i2 M! E
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
! d# y# d+ o- p- ?4 A

8 E1 N. `0 \2 Z8 l9 C
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
* ~9 ]& F5 |& d
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

2 V, A& Q/ n) ~
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
7 S6 A- y) \; o
6 O. r) E" V% ^( W% N
" K+ Y5 g! Z4 {: w' C8 W7 e* \
  在Data分栏中输入以下数据

" n, l, A( h" n

3 Y: e* a" F' _% a% q  ~

/ t/ e9 v6 \' l/ R
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
9 e& S6 O+ S  r

. s8 R. h2 A( o% a
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

/ P7 T, c8 |2 G% q2 F5 a' }
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
% J' _  p4 f0 {- T, W4 T+ B; U8 O
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
2 L& J/ }( T* z6 R5 ]* d6 u

( _% {' O$ k7 ]/ I4 |! p
/ V* H1 V9 _5 S
  软件及时生成柱状图,如下图
3 [5 K& L2 i7 ]2 k6 e) S4 K3 k
: w0 H4 [  |1 W  }; c
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
: L/ Q1 `4 @( p
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
+ g: m' M) }, M% j
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

/ d8 `' o7 F2 m5 y
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
7 K' `9 E. i& m0 W& J

4 Y6 f+ }* ~: R
$ H* E# [; B& f
在data栏中输入数据
* s6 Q+ x3 K+ ]) a

8 ?- W1 \$ Q9 f. h) @" N

9 D2 t& `1 ?0 \' l4 P! o0 B
软件即时生成的图如下图
! O5 E, b: _6 O4 }( l
# N# ^# U/ k" ?+ z" p& H

& T  a; b2 h; O0 X9 n+ f& ^, a
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

: T9 v6 r- [8 w+ M: T0 B
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

2 N2 g6 v$ X2 h0 c% P  Y
3. 组合和导出图片
7 i" z: s+ [% t% ^% W1 H7 L* q
点击layout栏,出现下图所示界面
& H' A% |# d$ ^3 }7 U
0 o3 d9 Q9 G, N' p; r& Z; D- j* Q

  W; M4 M7 X9 T# q1 X5 M5 V; U
8 l- k* \1 W' k- G9 G; v$ B
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
) i8 W+ ?' R5 M! e6 J5 u
! S9 D  C0 a+ y# D

* C& M  r! J/ V) M' S8 g
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

! y* d) i% @% F0 ~

  I- B5 F& r8 q) [
& o: B4 g" t$ S
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
2 p; g$ K1 C6 _$ M+ a. b) T

5 U1 ]0 B( B9 M7 Z, g9 u
, @! Z+ B) f1 i% P0 o' v
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

  d. e6 V, v9 d- h" d. x' v3 ]

. l' d. u# ?* Q  q' X- e9 ]$ ^6 R

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!  ?9 k% e0 p; O. X& i" R

- W, O- C$ |- R% I$ A8 x! _+ G
/ s0 c+ A) O, T$ ~2 {) P  N比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:120 N4 m, H( x0 g0 X! U1 c2 X: X$ H
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

0 A& k/ c4 s# \2 e刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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