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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

: g  Q8 x" K2 \! F
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

* z. O5 u" J2 N: I+ p& H; n( ?* _5 {
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
. A+ O' t5 o$ s6 I& p1 T' p$ i
——正式开始——
" ^- X' F/ Z) n1 A5 a
1. 折线图

3 Z& N0 W& F& c4 S& Z
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

: ?+ Q: ~3 Q; s  W
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
* k4 U1 c2 ?3 T, P8 I0 k, o
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

3 J+ _0 L8 z. M8 \( S4 w
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
5 n9 U0 ]$ y2 @- H% M0 c

+ @" `9 O% Y6 N

+ I/ e% \7 q2 a# I  V1 w; @6 W
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
1 h' i: }0 C# p

* N2 ^% p: |+ U- E% J

" d' |- E- `5 T5 n5 |. P
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
% v; `3 n( r- b5 C9 Y

! X* F' N) ]( F' g4 [- r; S) V1 l
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
1 H: `1 H7 `; j& a0 v+ O
) a$ D$ G7 ]  I: f) w* U$ W
+ n9 s% m$ X8 t7 {' h1 p
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
6 N, V# a3 i$ {! q6 ~( Q

1 D& Y  G( p8 o3 `$ n. e
. \! T, W2 I" Y$ `- E- v3 m
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
3 h, J& P) ~) Q2 Y6 a
0 l- S- ]* C4 k, J6 w
, o1 e8 \8 q9 u3 b1 r
  在Data栏中输入数据
' T' C" m: l2 S0 e( `" \

% ]* v! v4 Z) E& D' R

5 V2 \0 z) Q9 X1 Q( e
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

1 ~2 e: X* Z; N' p( e3 F
; O2 G; ^, @3 H. ~
; s. p2 n' @' Y. z
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

" ]6 c: x* ^8 l5 j$ K! K  c
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
( W/ f$ p% ]7 g$ u
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

; s! N% h' O3 G  G# q5 f1 D
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

( k$ H( }1 L, p
- D% d# c+ o6 l3 h, `

, f; W  ~% }7 K; s% O
在data栏中粘贴数据,如下图
$ T0 i8 n7 n" |* \1 g# u  L& H

3 g5 G5 E" _4 w! V! _
8 B7 L/ }; U% w
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
- q5 B* x+ Y/ ^2 M

9 R- p  \0 `9 M2 D, U! z
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
" _  F( L8 t, b' V- Y/ o
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
# a, e% a# h1 U$ k
% F' e. J0 \8 w

$ Y4 C9 w3 H0 f" l& E
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

& {/ n! A5 x9 N9 W  A% ]9 u- a

9 H2 K1 p- d. J* B' S

1 a; {, X# r  J# i
  将数据粘贴进去

$ W  I, g/ L! p$ ~5 j; k% p
8 a* u  u- T: Z! B
$ ^) c8 S# t3 F+ F% ^) ]8 L
  软件即时生成的图如下图所示:
, T+ E9 s* s: y9 Y# [% F4 ~
9 F9 G6 j& l+ M
' L  A& ]0 H1 s# U% A8 q
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

4 f. _# i- M- C7 }+ g* g+ J, b. x: o
2. 柱状图

/ p- q6 V! c5 |, y" v; J% T
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
& _1 i0 z+ J: k# X9 S
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

0 c. u% G' }; i1 N
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

  L: p! \$ [( A' A
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

+ U( b. }; {; j' b9 ~, [: h( C
$ k! C/ W2 o- _+ W
4 {4 {" T0 p; t: M9 j
在Data分栏中输入以下数据

* H1 q6 |' l0 g  B

2 p* W  R( O+ K5 m# k# w
/ @5 X2 `: ]5 ^$ c* N$ H, S8 e
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
3 l+ i' Q8 w0 T# d2 H- N7 d* N

: l. {6 i! }& Z
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

1 s9 e2 L: \$ H8 i. ?
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
2 z4 b4 r" Y* [0 x
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
8 F# O/ v$ L8 M3 \% ]1 X7 j7 [- H

8 s( K, T5 q- t0 L& N8 Z2 a
, P2 i) w9 U8 C5 H( `$ }
  在Data分栏中输入以下数据
& G6 F  X9 x6 C6 Y, t  q2 p

5 X( H$ R" ^3 t

9 ?! g5 {  r2 O5 e! L
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

  x, O% N1 `0 K5 E& Z1 \
+ ~% X1 \+ g3 }# q
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

& Q0 h* G9 E8 ]& v7 \# ?7 A5 B$ t
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

6 c+ P7 o$ H5 V9 h2 i# b7 w( p' ]2 x
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

, p' d6 [: \, F: S7 z5 d9 D
& q$ |" I- @) G( h$ V0 g

/ H$ i3 W' M; y6 Y
  软件及时生成柱状图,如下图

4 ^( }( [. P% k. v
7 P3 _. w5 h1 C" E$ q6 X/ |
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
  I% p0 n% b8 y+ [( X0 Q: r
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
/ T* b0 g0 o7 h, f+ d/ a
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
9 W, X4 N3 n* c% {( C4 d- m
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
# g8 H% D0 f7 @/ ?

7 y3 Q7 @( S" S$ A9 J2 G
- y' O/ b# C. ^5 ?4 A8 \
在data栏中输入数据

( Y4 T; q6 W9 C! G
" f+ U! @4 e" \; D

) k. V# ?/ O" `- `1 I6 s" l0 ~! B' D
软件即时生成的图如下图

$ o) ]1 p8 J- N
; p% v: l. {& c7 r1 k" v" c" t
4 a9 N; o* C5 c" J
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
  F9 C9 u7 a- f% Y( z1 c6 u0 u8 X
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
- l9 t9 @$ D: |
3. 组合和导出图片
/ Y2 U5 r& B0 w" q  v4 \" |$ h
点击layout栏,出现下图所示界面
; @; b* m$ c) k. f) H6 k/ O

& n/ J* n3 G. E6 p$ E! b" \

. P1 V1 x3 e0 V: q( R; p: p8 r3 ?
: j0 m" p3 k9 |  l' P5 f& I; w9 o7 Y
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
" _3 r( K+ K  N. O

1 W+ _0 B6 A0 z$ l( k" G

5 [( _8 p4 Z( f, b, r( }
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
$ l6 Q6 B! V  x5 X
0 ]$ m" _& r: R9 w

( W% B% a6 G  j
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

7 C+ y. Y7 w8 R1 [3 j
5 Z" u: J% B# A9 e  ?

& ?8 p1 |& v2 X! `" G, i1 c/ f
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
5 n) [+ b  p/ A$ `; R3 J* ~

& ]6 ~6 ~6 h+ S; s

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
1 E  l4 Z; g) s, B: ?  R9 @! @4 x' T, X6 S( l" Q6 ~3 ~
/ p; J- L, O8 k% X" S5 O
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
, G: [5 T7 Q5 @' p( p3 w满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

  T$ Q, m. f7 Y1 q刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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