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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
# n& W* B+ C0 r; B! ?5 {; v
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

5 T; I3 u- F" u; t  N
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

5 L2 h: v- N# f4 r5 p  N& `
——正式开始——
8 G6 Q! ]" Q0 K6 d  j. Z
1. 折线图

; g0 L! G) [. E( j
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
4 U: q7 m9 a  |- G& A
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
2 z1 \4 M) W9 s3 P
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

  {( t- n. d5 `+ H
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
2 u0 P, M9 I0 S0 Z: B' ]+ u

& p/ L8 ^& u* g' ?

/ i' U" E! U0 ^- r
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
1 N  f8 A  b5 Z( p; I& W
5 U: L8 J* d3 C) L% U% @

; J3 X/ Q7 c$ m& @
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
3 `$ F" x/ p4 M# |) w/ A
$ U0 ~4 g: d8 _1 N5 j
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
: C( l. o( j) E% }! A. k4 U

9 B2 u8 n3 K$ I$ U* Y

9 F: q, c& h7 H# ]! l5 q
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

% f( H# k+ S2 c1 _  x' u8 n6 R! S, \

# i; @5 C$ A4 @+ e8 a) Y4 V
/ Q5 o) q' n# a# n) P& g4 [8 G; x. N
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

2 Y0 @7 N& \: ]8 ~! t0 M9 J" ^

3 R: w. v4 H. c% R, K& o
& S2 w3 t: |1 K8 M: v# Y8 n1 i, h8 b
  在Data栏中输入数据
" ?/ f8 V% C1 k) p
# e: H" }2 N' [  h/ Z  l$ o8 ^
: l8 o+ @% \% o
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
" d" z9 b! j* t& p) m4 Z+ P% `
7 z9 a  Y$ i- W$ t% e/ N  a

& z4 [+ B, U; g% p7 a- F* O1 @
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

/ V& [$ C. p2 M( i. B: H% h* D
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

! s1 C: ^; i6 ~
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
1 a1 K+ Z; v" K# ~
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
$ P  e5 p9 i8 ]' @
8 ^  b: w  k- I# R! n5 W

4 H, U8 G; ~7 l+ p3 [! _
在data栏中粘贴数据,如下图
3 Z8 m" u/ S, t) E
& G' }; `' `: P! B* c4 |
! `7 N; R8 ]& a. O% Z, C
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
7 w+ E% Y- Y  O' ?/ ~6 X$ ]+ w
" E# g% r( H* N% p6 e6 L3 n. v( Y. P
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
$ i$ y1 \7 ^! b$ f: h/ H: t, V# y
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
' Z) T' f: x/ b, Q
4 q# x. h7 K, i
% U' i1 \- J) e4 w1 l
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
# ?. p7 a% p) |! z( {3 v

. d  Z! l6 H, ^# W- ~/ g) K
4 l- M8 g& o9 g/ J0 [
  将数据粘贴进去
1 A- `  m" b, e
8 `2 e. p: [% H" j' ^

* q# F8 H' K/ e3 e, _$ p
  软件即时生成的图如下图所示:
  u* I  g, Y$ F5 ?0 X) m4 E- s+ {) `& r( d

. R' I! i) p0 v" O3 S
5 G/ y5 T. W# J2 j/ o8 |% A
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
+ W: X# D; c$ P8 p% v, N, V: G
2. 柱状图
" U% Y4 _! _  P/ d- I+ {
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

$ v! {0 n8 M! K# t# e& g! Q
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

: ]$ u1 q& }; f; D% l# ?+ I5 O* Z( ]
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
- }) N) k* b) c; W5 R4 n6 f
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
6 u6 y6 I0 k) z

& t; B8 r( V% ?9 \( W, }
9 ], u: y- b( }; \2 T
在Data分栏中输入以下数据

9 V$ t' R" E0 a& s+ X" ]

5 N3 X6 c1 P8 f; W+ X- w$ l% W
( V# j$ ^( h* T, j- S/ X' L( Y
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
7 Z# W5 W& ~; f, u7 p- j8 r

7 O; F: `) x" G- b2 A3 G/ X  r
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
) y0 A' H2 C& W' V* U! y9 }
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
# w" }; M8 `1 q. x1 b9 ]
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

2 w: c6 H# y5 t0 J
. {" O1 t% l' S+ ]0 e: U
2 p& J0 p. o8 t4 i1 Y& O* k
  在Data分栏中输入以下数据

! g# L, z2 n& m) Z
7 X- W# b3 J; U- g) s3 L; H

7 N9 J5 ^* a& C7 q- C5 K5 V
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

: L% {2 B) W2 ?6 J" M; `6 j0 M/ O
( U" z& H# ?: `
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

; e: k4 Y& ^! g6 Q$ o
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
; J+ R+ N+ ~3 |+ f
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
& l8 S! a0 d. e$ A% d
! _9 L1 z" W3 ^) D: E; v
4 R- H0 T* Q5 S4 U
  软件及时生成柱状图,如下图
/ w! K" n6 x" f( ?% D
* G, ^  K1 x" U2 A
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
' g2 [5 s( [3 ^3 i! F% O6 k' f
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

3 Y* m5 P% G  W* N+ {( R
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

) k4 l0 L6 q1 F- a( n2 D
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

  m( [% R, ?$ l5 R% M( s

5 S# T9 a- y: L; s) d7 j# y4 c1 ?

3 m8 |8 @7 ?% T3 K
在data栏中输入数据

' L, v- Z! z% Y0 N- K& I
9 Q) }; C. Z1 s+ w1 K4 Z

; m- `6 X4 `  k  s
软件即时生成的图如下图

1 v# q: D: ?2 B8 Z  g
1 J+ \1 j* r& B; z! ^, h' y6 v
& u* [7 z0 Q: @& D! O
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

! T  }6 K! C2 m/ e  v$ O( H
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
% {1 T0 J" @6 b. _
3. 组合和导出图片
, ?6 ^0 p5 Y1 A( }% I
点击layout栏,出现下图所示界面

3 I% `! [# A5 c% c" @

1 K. ]  l7 g1 L
) z1 p1 x) S+ i6 x

1 Y, O( N$ c! x( e1 Y
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
% e$ e; s6 a. M- p9 S

2 e+ b' Y9 O- ~, x7 @8 K

' s6 l) d) a! a! Z$ Y
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

. p+ i, w9 w1 S  q/ a6 w

2 _, A0 m  V% N1 n' l' ?' b7 d" c

( H0 F9 g# X+ M; K0 k
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

1 V/ i+ l3 \7 Q; o
8 a: D" I& X. A) w( D

* B, f( e4 @" |) {4 V  O
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

! E2 b6 z! K$ z0 e  R
7 M& e  v! u3 W% U3 R! M- b$ x

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
9 }7 F) ?0 f( R/ M3 a$ ^
. ^1 {& V) K. }& v6 K' H  @  D3 p
) T$ c' d) {) v比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:128 B+ m! q  ]# D
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

, o$ _, ~2 V6 f刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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