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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

& @0 L# T6 L4 D8 D
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
. |" J' Z1 a# S4 P
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

; c) {: i' D- F$ K
——正式开始——

( ~/ @* ~: y- W/ {0 L1 G
1. 折线图

+ L1 `, m! X6 F% Y# G, d; r4 K: ?9 U
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
, l, V2 V. R; n! s& B0 `
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
' R( w- a' _9 H4 Z4 o
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
" U( e) L" @1 T. K+ _/ d2 r; v
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
. Y' [0 d5 l8 J0 _7 G' w

8 w2 c" ^( I4 p& v. d7 Q0 e4 G

7 ~6 p' n$ N. X6 U# a4 z% y
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
! V, A; _' i, Q
4 S. N) t' s( B; K5 G8 B; ~) s* U

+ R& I2 h5 }& Y5 E) e: w' u5 j8 x
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
! C! u: s+ ~6 {9 a

8 N* S# z( |& u7 d/ g9 J; D; U
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

  E. \, h/ O( c4 R% ]  a( d& [
0 Y4 u' @2 ?; g5 ]/ \

4 t- M- t) K9 |+ {$ A, N: c8 V, z
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
* _& w( a; `% V, w+ e; u
7 W: j5 w! v  ~3 w$ S
4 T- v- P- G' W1 J" _/ D
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
" N7 ]/ R, O2 `; K1 Z

$ G  K8 J  j! ~7 ]

, }, f9 e0 K! Z8 i; V
  在Data栏中输入数据
# C- W: C, i. r9 z; m
1 z* S- p; q& f* P, O7 a
# b/ c7 r; m9 z9 e5 @( n/ v; \
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

+ x: W) H/ `1 B1 r, v+ [

! B; ]" F' j. X- t0 j) D

; |" H& v6 G# A$ M2 i  V/ m/ r
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

! t& l9 d3 x+ {( G5 ?
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
8 |4 o0 T. Y0 n0 G/ Z; d) z% Y
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
9 @+ ~6 V8 u) D" r4 @8 s3 a5 h
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
2 q; m' Z0 ~: O# N3 M
8 v6 [# C1 P! G# X2 {

! h/ i$ b8 y/ [) ^; @9 |5 D; z2 V
在data栏中粘贴数据,如下图

$ ^4 P- R/ P, k( r- D

" s+ S( \- `# f# F9 q
5 ]4 _+ W; j9 w4 `8 T" J" X9 Y
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
; Q9 z  P) ~) V; K( h" ?/ I

) B8 L" h: s5 Q! g
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
' f3 B, @1 G6 e
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
* C  \; u2 j2 O9 p

& d* r% H  H! y( A$ L  w. a0 s

  P4 Z0 V9 h% y, G$ J9 o
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
9 q+ ~9 q$ B1 {2 s2 h7 M

6 S- n, w. s: ^3 F2 z

0 W' s( V  x) L& D  {* D( L9 I
  将数据粘贴进去

/ t2 P2 |9 h/ N9 K  \
' w/ h/ _5 s; v

* k' L1 B7 X) K0 P! o2 t( d
  软件即时生成的图如下图所示:
; ~: B* k0 [! P* i! l

- U! @- z  m/ s4 {) U+ a

8 v2 d4 Z& n4 O  k6 ^8 `4 ^
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

* R. p: q: N, X" R! `
2. 柱状图
! w: v0 G# O+ y3 l% [
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

; B0 S% V/ B8 K0 g. O! h
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
# K' u9 ]0 o8 S; m7 ~% M
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
0 K0 }7 ~! H" _
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
! R/ c3 i2 s+ b; f* z+ o/ Y

7 @) F+ y& R; m$ b
5 c% T+ @  @! c0 j% g. [* |2 e# @
在Data分栏中输入以下数据
" G+ k% K: m) u/ ~% V3 m

; a7 k4 Y% N" V( h0 y

% W3 L  ~0 L6 s5 P3 j# _
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
) a* w, _& M# l* l

) A# t" f1 J0 v& N
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

# ]5 g$ E0 h$ l$ k; ^6 i
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

/ F" S2 {( {' x3 R2 [
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
5 ~: n& k/ k* f$ z3 F  K  ?

7 p1 W7 w, W% |, S* P9 T& E8 w2 ?0 D
$ x8 G7 N  z6 o+ p
  在Data分栏中输入以下数据
% a3 A5 k# I# U( ]. q" W
* W1 H/ p& V8 n! V, N
6 w1 J2 I8 |6 `: @1 f3 y9 U
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
3 A+ R6 r0 c7 z( a% e

. T$ o0 ~* a  @- Y
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
% d- x9 p: u% ]% }3 r; }
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

6 I+ A+ f2 L, v6 u
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
- e3 C5 R, \  Q! \4 F' e" M8 S* K

  u$ h: x) a! `

3 @* D, z5 O- W" J
  软件及时生成柱状图,如下图
& @4 T5 M. L; e* @$ ^$ R

( P6 B$ k$ W1 ^5 D
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
% W1 Z; z+ a& p( R1 a
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
; Z5 y# X- h" E: U. B
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
: V/ S5 ~7 J2 \) g1 S! r) ]
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

9 U0 p4 z3 @3 ~4 h* ]
$ |: o. z. P+ E' \" V

/ F( @3 B, y4 X! _4 n  n1 c% f) ], p
在data栏中输入数据
$ c% k0 J3 c* x# w! @
1 M% k, h, y0 ~5 B0 i
* @: V4 B0 @6 ^6 R8 R& z9 _" q
软件即时生成的图如下图
$ S( J. B7 k  f! X& X8 [7 n& n) ~
5 F. I2 q5 a* L) Z. e  I
  p* J/ W/ _/ h
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

# S" o& w! J+ c: Y
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

0 Z& c" r( F6 G* x
3. 组合和导出图片
: C( H6 a8 R4 n2 r4 D& k6 Y
点击layout栏,出现下图所示界面
! ?5 l7 u8 K( Q* i3 M( J/ l8 v
0 ?( a6 K( d# S' k: e3 U

/ Y& }4 K5 ~5 V& r" K' N. o' K

7 A, [. Q/ u, J8 o
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

) m8 `5 N, T+ f+ C8 f. u, B

, \/ M4 l! }( D- [9 d% Y

, O, P; V$ E6 y$ a# z
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
% z4 m* x$ K) ^8 k# p
, ^- r7 N  A% r( [5 M, U" F
, {# `% d' I* j$ }, q) m2 v7 Q3 f
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

3 D3 p8 b6 A; w
' Z$ s; \, d' w

( }* t- X1 f! c1 j
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

( K# Z6 X# M) c1 q3 A( @
( L3 b9 v* \- m4 a$ a

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!- L9 ^7 {9 L; U$ ?
. c/ p3 Y& S3 T. P& _; Q

$ \: O$ I4 c$ j5 M# b比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
+ b4 M1 b5 v% ]1 M% J& _满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
8 n( g+ Z* t2 o) H7 n
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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