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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
' j  G% _1 ]+ z& d/ T4 N/ j
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
; N& w2 g. S; j* [0 v8 O" }
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

1 S$ ]0 ?- M  F
——正式开始——

/ D) p' f; E1 F- N6 I
1. 折线图
- |$ Y) f& R1 [' K+ w  `1 ]- I
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
4 j1 q( \& m0 Y/ R  e& J
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
( S8 p0 R( f5 g1 H: P2 ^$ \% K
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

( Z, ]; F( y" U; R
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

2 P) {9 S1 I7 \8 J6 Q' ~4 p

* {) A9 }: \5 R" q) c0 e
4 D. E3 R) [9 v% l
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
5 K- B3 x6 m3 c# n! b

+ H& d: q8 r. U7 D3 @2 c# _. a$ y

7 ^0 M6 h$ e2 g, i* H3 @+ q: {" N% k, o
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
. n. x1 W. V& E" t

4 |& i' j  S. l% i( J- M( K
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
1 M/ O4 p7 ^  N/ `

/ j+ w0 \' X) |: C1 b# o
& \! W0 S( u6 o) L7 Z: Q
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

$ V2 d4 v7 ]" S. h, B. T

7 Y7 T! P  V- e0 s& a

8 T( e# u8 `7 }
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
, O4 W& m5 a" Y6 N4 e! Z2 N2 `" b2 n
9 e. `: [( e) {0 |7 h
2 s/ ^1 n: c. }; g4 c0 y5 ]/ e
  在Data栏中输入数据
( d( `2 ]* \4 X: _( f7 X8 x

- j9 u1 {& ~1 T9 m" N4 H

) _6 K- x2 Z/ z4 v0 x
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
" D7 k: m" q) r+ ~+ t  A

4 m6 m1 U* x% T9 h/ }$ l. n
) L' ^$ R" C2 D2 z/ i1 f
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

! k! y8 b' h5 N) O. w
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
3 T5 w4 d! Q; ]0 L6 P, n2 n
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
+ y, F5 n' B4 }1 g5 G- q
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
0 T4 q& n- Y0 \
4 |( M2 E% j" D& Y( Y4 x
+ P( ~' b. j& n* R1 ^1 C  T0 T
在data栏中粘贴数据,如下图

2 q+ Q* ]+ o* P/ i* k

: B0 \( h/ d" E- A) o, x

) O8 n3 ~' o# j- |; {% ]( x! k
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
& x6 G3 d+ L7 s+ A; M2 t
4 C6 k8 y. I7 @. C* o& W! X
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

4 l$ g) ?- q$ E0 U8 V
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
0 ~/ l3 Z; E+ s- m& Z# u( s+ q
5 x9 L( O% O' ~

- b* n  z& d1 z# e
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
. H( X. m, Q: q: z
: J! O2 U8 y3 r+ [
! `/ S- H2 s( C( s1 @7 n/ P6 Z" @
  将数据粘贴进去
% ~" S0 h  ?: m. w( k. t

+ q* S# U6 g3 Z1 U2 j
5 w0 K3 g" n5 f9 c& Z+ h6 Z( ^, Z
  软件即时生成的图如下图所示:

& u! N* m% F6 j% `  `* Q

6 W2 F+ |% G  _5 f$ j2 f
; f0 x9 v" C" R$ S4 q8 B( p4 c( X" I
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
6 P: q9 ?' J$ q: ?/ [+ j# L7 B
2. 柱状图

4 G3 @6 S, z) S7 X% ?, h
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

: K0 ]- @* k, C2 `- t, i5 j$ W! c8 Z! v
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

* V  J7 n+ ~: d1 |6 J* C0 \5 L
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

: l4 l+ A# R* H% m  |; ?
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

5 W) P& w) I" d
" f2 z7 a  n* F$ k6 L- z, F8 d
% I! `7 Y! s& X5 Y& k+ N, {" J; Y
在Data分栏中输入以下数据
3 g4 F$ B. C+ W2 }1 C. J7 |7 E/ ^

2 u% M* j4 i6 e

% \- u) v3 w/ z5 _- v2 M
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
  ?/ d) W  U( \+ n

& y5 B: r$ S  S& `, k5 I
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
. G* v+ U# r! r% _
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

3 N' }/ R$ O, U' G' Z/ S/ u: \( ?
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

5 k" z  c5 g2 o! T; z
) `- ]4 w2 c- M+ F2 Q# K

; e! l% ^" y  e  Z( |- Y; R
  在Data分栏中输入以下数据

2 P* w0 E) }, c4 v' L; o9 [7 E& W' W

: o* ^7 J0 p: N0 y& w) ~7 M

8 v  s# K+ B! y) T% V! M' Z6 D
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

+ i( S2 M- e$ |' X8 c8 w

9 ^& r# x: A  u: E9 e9 W% r: [  c  F
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
9 S7 i% T" m& i# y' `9 r0 x4 ^
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
0 `( d( ^+ U3 ^% h6 l
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
! o; [' z% n2 }2 g5 u- c0 n# ]: ^/ H

$ D; R* |' r+ h1 o9 i8 m4 b
6 Z* B& P' U( j- r( T$ X" p
  软件及时生成柱状图,如下图

2 b: H: S9 i: Z& q/ ]6 \
# f5 z6 x1 A/ w3 Z# c! B* ^
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
% y3 E* P$ T/ M- S/ z9 e
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
4 D! [- u" b* k) y. p. V8 e
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

' }: B' z, G) P5 T1 i
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
1 ~0 A) t+ Z! K% W

8 q+ J, j: m" |! ~9 w6 Q$ s
! ?7 H! j0 V, g" q0 R8 l! F' C
在data栏中输入数据
. p5 N, ^+ W' ?
' g7 g5 L- T( O2 D# E( v* k
2 {+ C3 O7 r. W/ @
软件即时生成的图如下图
4 a6 C6 X) f; w* d9 M
+ }* g; o/ Y. Q8 W7 H( W

5 D; F7 }  G& X8 }5 _
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
' s  ]) T6 k% E$ F6 f1 R% g% \8 z
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

, o' k+ w4 g2 Y# Y1 f
3. 组合和导出图片
1 h: L- z+ ?6 _, y: G2 B7 K: x
点击layout栏,出现下图所示界面

1 T: T2 |- `2 v' `8 m

( y9 m- z7 D  r: D# D  g

. d& R: C- l# n$ C. J6 r
6 z, a# W' i; t0 _. H
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

" s. N( U# M8 U9 x$ L# H

* a6 Y0 P6 S5 N  V6 Y- M4 ^. W

6 ^* c- M2 J+ D( ?% h6 V; P
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
, k1 I$ \* I6 j6 M0 Y4 P, k/ m

2 U3 c2 y( C* w/ }: e5 T
4 B4 y; I' I9 i- g
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
- c& i. S% N' b3 t! b% g
& p1 T2 d3 h9 A: u" v

  o: U. `! A+ d& E$ E7 ]
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
9 m+ v; n( ^' P1 }1 J; S1 L$ r
% ^, D, V5 y( g) ]

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
4 g; s2 l( C+ G, w
  J7 u! ^' W6 z  y
) n/ M" I3 O+ U5 G比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
) P+ {4 N( p4 f0 P5 G满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

) W6 i) ]/ X; i8 f; r: x' j刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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