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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
+ }, Q; W" A; F3 v' V1 `
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
8 ?/ j7 R; \- S" g
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
: M& P% F) |4 q" Y  p
——正式开始——

/ S5 N$ @3 S$ |- ?; q6 {, l
1. 折线图
  U! S, c5 r, V
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
# o1 D3 n- S( S: a: Q7 x
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

0 Z0 R1 i# S1 {) d9 ~& x! Z
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
: V" B3 t8 [- i/ T) q# c/ D
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

* h9 G6 s$ x4 m& C
" t( h. E& U7 ]4 T! `8 |: s

# S  f4 k& {; {  C  h, u* g
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
6 M3 G  o! v9 c% @: E+ N( E  A

8 y1 j% b# X4 H8 [
, |/ ]3 r! j. |4 O
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
$ d# E1 N. x5 b7 `$ q# E; }
" W  z* D  X7 _3 y1 [
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

0 B* p, O0 x' h$ y6 D; ~

: X; q- M) x7 o0 B8 t7 b$ T
0 ^- k% q3 k. f( B
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

1 z5 @0 ]+ w9 k& \, |+ q

3 B! Q$ s7 ?- C( H1 I8 |) [1 \7 @
3 x5 D* X5 E4 l7 [4 e4 i
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
2 O& o* n' f1 u8 `4 x8 {4 S
. {& y3 d2 b7 Y; h
9 H) e6 {5 _2 g& \2 X7 J
  在Data栏中输入数据
  s3 _6 j9 C, f2 E; C; `! J$ B4 S

& X2 g9 h$ l0 n: D( N
) Q3 w: L. z- z; ~+ Y3 R; p
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

8 M7 X$ F! s2 [4 R  H# V' R. |( P4 ]

- T& L' E# L) [3 x" G% C

4 u' _( a7 @* x7 X5 a1 X
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

$ c) c7 x2 R& @( e3 D. f
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

& j7 A3 S6 ~$ ~: e0 k, \4 r- \
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

/ ~7 {2 O  v1 e! E. q' H
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
% K, {! x# m+ h  m% ~
: n. `5 n; Y. P' Q8 C+ j
, h3 }7 l7 T$ m, ?# d. S
在data栏中粘贴数据,如下图

* \7 L$ e2 }& p6 C5 l

/ s6 y/ ^2 B' h$ C  B

  Y1 l1 f. l! n
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

) e( B3 u& ^+ Z0 Z( p

+ G1 \8 c: Q2 v0 f9 v) d+ ^
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
/ [- g0 }' E& E/ P( q7 N
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
* Z% c6 l8 k) V9 k

1 x* U( d1 v. Z: K6 X+ v% j  w( }
5 S* ~; d! b+ o" i& }+ G
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

3 z+ ^' F6 M" d( X% O" O
4 C9 y8 {+ l' N7 z# h" A4 L& A; E

* e  a  ^* t# n1 F
  将数据粘贴进去

5 F* D1 U$ H+ n

- [0 l7 c% `7 D6 L3 G' k/ f
7 l+ X  A$ X! ^4 z* J
  软件即时生成的图如下图所示:
  a( h! \7 ^! f9 F- O
7 d& J' K2 ^' y( u

* `5 y! ?& k7 T  l3 }3 X! R
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
1 n* c3 y) O3 r+ Y2 `7 \& E( j
2. 柱状图
, f  Q) i2 g& Z- s$ I! d
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

) N8 j& C9 M6 O/ E& }/ P
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
3 W" ~2 B+ e& F6 a4 g* i
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

1 p; i7 s/ |5 N3 K$ t
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

  S& ]  p( s, H. F

$ e$ h7 `- f' I7 e' T+ `# b

) J' t1 t/ b0 V: j7 d& k: K
在Data分栏中输入以下数据
8 A* b+ ]# M7 E2 E, {
6 _; ^" h* n& L$ t* P

( j, E$ W" S$ z4 H
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
- M3 f6 K4 R" G1 C& z% r
# T" c3 z) E- T. j
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

9 m, `4 }$ b" X
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
! w% @4 J' }; m" ?2 x; {
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
) D1 G. X2 Y" _' p2 `- x

# \6 k9 J0 T& D4 h- w$ K

" Y, o( Y# ]8 d( A9 S2 s
  在Data分栏中输入以下数据
2 i" ~* E" K; P5 ?

2 A; Z9 o5 u7 m# e8 H! K
0 n" J5 i' T. j$ S6 Q% v
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
  M6 F  u4 {. q0 }- N  P

3 M) o9 p/ |! ]) x  |: M5 l. `# M( q4 n
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
/ J% S3 Y5 X* K* Q4 p9 u' s. R1 V
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

" m% R2 j% S0 E% [! B# T
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
- N- O; N% o. t3 V

* p* E2 b* w6 |( w  ^/ w

+ h& ]2 C7 Z7 w$ L; b4 W' h9 {
  软件及时生成柱状图,如下图
* v, T2 f5 I6 R  g# M+ v5 D

) w* H8 n- D& r+ d; R& P
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
; T2 Q! `$ E( j
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
5 d( u# P  O, C  X5 Z
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

4 H- P: _6 Y; O( {
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
: g; i& }4 d, L* n

/ b0 w; \6 ^* O& K- e

" \( @, n0 V6 H  V$ e8 @+ c
在data栏中输入数据
+ g1 @9 M; f5 d6 C* l

" i1 S) J. V2 S! f0 d$ L3 J8 G# r

  y3 M! a1 u% J3 [; v) `
软件即时生成的图如下图

# {7 n1 Q# E3 Y0 U3 Q
& u& N% U1 X7 B0 |# z% ?% s7 p

% U* K9 V: O& C- ~2 [- A1 k
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

3 A% [* p* p+ K& d6 {- I( ^$ k% q5 n
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
; f# j4 _& ]& v/ Y; q, q
3. 组合和导出图片

8 |9 e* L! M$ |7 }  |6 Q; a8 y7 X2 T
点击layout栏,出现下图所示界面
9 M  r* `; M2 X9 ?: J6 q5 @
/ c. m# z" {  N5 n3 W/ |

* e8 [( K2 ], |& b2 m

" H+ s0 F, e/ s" [! ?4 {& h* ~( s
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

: _; {5 M) F3 e1 L: J+ j) ], |& q

) P0 j" w3 Y( o( G) u9 a  ^' [
4 j) c  C2 J# J; x' l
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
! w3 P0 A) \- c( U3 ]" }
! z3 U7 {. c& t- l
" D7 _0 v1 f) G" X
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

( ?3 t9 b! @" I/ p3 o0 A

8 v' M, E. y' O% b
- u  M# ?6 F! J0 z4 b
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

& G% A2 M% k9 D8 P6 G3 g0 w7 e

/ S- Z9 J- K5 Y! e+ v! s0 ?) V

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
% M) M" V0 F/ V' @' [& n  ~4 g, ]' V/ n4 _

5 N- T% Z/ K4 z比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12. R! N8 o: _3 T8 A' C# l* I
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
0 c7 L. {$ v# f/ R
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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