找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 3363|回复: 4

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
. q2 u8 C6 D9 }
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
! V+ |3 G$ ^1 o4 X& j
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

% q  A4 |: f3 Z. v/ j* F
——正式开始——

4 b! Y1 m' ^: F8 i
1. 折线图

6 n6 }$ ]1 `: y! [, k' U5 y! O
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
5 W! V% r# c9 a+ t8 c* G
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

) |8 I. I  Y2 W) y8 i# Y
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
- }& H* V0 n3 T4 d. ]. k4 F
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

3 X6 T7 V& Z$ ^  b1 P) Y7 S$ b
, y* \( W4 {  p" L8 t6 R! B
: [' c* m) v1 b8 G  H. R* [
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
) g9 M1 s7 G- [9 _! V
  l# d9 z4 R6 \7 ?
0 J" g4 x' y  F( O, P; n; j4 ]
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
. q+ L  S# j/ z1 E2 l* d

4 v* m$ R. A* M; R
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
6 v9 _+ t: V  W* ^
$ z8 q6 h7 a5 K* x

+ d5 m7 T' j0 n0 W# H; P1 [, g7 y
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

& T! k! B9 L* d3 m) M( F* b
. X3 b& U( [3 k- P, |" k  a
% W0 d9 d( j" ?% w5 M
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

. S! F4 Z8 Y' r% q4 A/ W

! J  I% V) c) d6 E

. B2 I& s5 B' \1 i. [
  在Data栏中输入数据
5 W" s2 Q- y; I  z
+ q, _/ Q+ H# w
/ |  e: i( z5 y4 Y
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
' p6 T6 g& x6 b- x/ ], m# K
/ y6 ?' `+ V2 j. f: n5 I2 p

( g& x7 D- y2 e7 R9 K8 L
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

: ]1 [8 _9 `2 r. u  |" R
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

5 i) v5 l) B1 G0 |  y' S( V, V0 }
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

! f( Y; R/ T) j$ o! h+ G
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
1 }$ S+ o( E6 _% v

( L* }& k0 l" m! e5 O9 {+ F" D

& x6 p) q- |  m+ T+ R* X/ t
在data栏中粘贴数据,如下图

* Y9 [' f, w5 _2 ?9 W

3 w4 x( ^8 @/ [2 v" w: |/ h

, ]  }+ U6 j) t4 k
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
, h7 g  g# R( L) k( e4 }( @

% E  q* d+ r$ B" [1 y* g
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
; T, g% q) ]2 U  k
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
2 `* [* `3 X) w( ?) U+ Z! d6 U( G

0 I4 e/ D4 f% d# @
: y# |/ Q" i9 c8 P# z' F1 F3 W, W
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

4 C" [% _3 I' B8 I3 ]
: j4 {% ?, s- ]: O, \& P3 e
; o! F% _" M+ e$ X
  将数据粘贴进去
% I% z% q$ T' t3 K5 _6 A/ y

8 q& A9 \1 D6 f! |0 o

9 ?/ g' d  K( q
  软件即时生成的图如下图所示:
- v# G  o. \' {
1 |) Y4 r/ x* F* s- v/ ]' [
3 p8 ]8 h/ W& R& u* H
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

9 w5 q9 _1 z, D0 Z
2. 柱状图

4 {$ G; g0 T9 ?2 _
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

4 M% T5 @' {/ [
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
0 z% T% C) h6 f0 m* P
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

8 V' O( K  |& R3 k
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

. E' z9 i( q1 R% W8 W

) _# T  N* t% r* b, X$ `7 x2 |

& I- K, k5 P' A
在Data分栏中输入以下数据

( y" ]$ H, X  L4 H

* O2 b6 G, ^6 ~2 g
8 a1 T/ L, `( Y
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

6 x3 m6 r; N( f4 A8 ^/ s4 w

. U) N3 s  L+ k, a4 E, \
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

/ {0 I' b0 w4 j4 v+ p8 O  z( I
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

1 {/ v' O6 v( F0 t
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

# ]% _! A' [/ a, p9 Q/ n$ t! |

4 R. D2 |" C! Y, r& I5 j$ J- c" X
0 o- Z: r' ?: f; H/ x1 u. k
  在Data分栏中输入以下数据

2 p* M* J" \1 y. N1 ]: p. A( I
/ [+ }* N) ?5 Y$ U

; v  Q5 w8 L4 G! U# O
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
' {6 u  N' Z/ r. B8 @* Z# y' o/ F
9 a3 G3 X. Q; o6 p% o. ]
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

2 d" i6 y+ f- [: y: F
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

% E% Z& B- p4 w1 k3 _2 Q
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
/ ]% d" f! x/ g, z6 w
" n! ]4 S2 F1 l  v9 J) [
2 w! e& v9 t# |/ _' I0 Y* M
  软件及时生成柱状图,如下图

7 j( j( ^$ }9 n# Y

9 a2 l7 c3 ^1 U$ N! Z
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

$ P8 @4 e, M; S# h; c5 y
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
' E& R- e% y: B8 V& _* [
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
* G4 C9 z: C1 \+ _! }! z
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
4 v7 C, D! T( O( k6 J

# ?/ ^2 @: I) u( R" W8 q1 s
) N9 v& }- w' S, A2 p, v& b7 t
在data栏中输入数据
, ]" r/ B8 @& e. i3 g6 R: \" O3 U: C

/ k6 I# k0 T$ k1 T- X+ q4 ]0 y
7 V5 _4 M; p% o" K$ d$ H" n
软件即时生成的图如下图
6 I5 B% M' y$ f8 P
0 Y6 k' e. A7 x( J8 d

& z+ M* Z% ^; n# D) \- e% x
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

, c7 B2 a8 h1 l, H
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

( N) R3 T7 h9 ~
3. 组合和导出图片

5 q2 C" l+ q7 U
点击layout栏,出现下图所示界面
# O( z$ ~4 c& ~* p9 r% |& B6 p' T/ m

8 G, R0 X; D- f* r$ L+ l7 @( ~

7 W; F8 @9 _6 [

, {& {  s9 K9 j- F
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
* f; K/ e" D$ O- C

; U* x/ X& `' ?8 x

4 Q. M$ e% S0 N7 q
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

. P2 b# A% R) i
; u" s$ p! o7 @$ C% Q$ ~
  l) d5 S" T2 [$ X! z4 O" I1 d
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
9 b6 k8 Q" z$ w

  q) [5 i& z7 H3 `
9 u7 Y: @) j" I" z+ L$ l
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

9 @( t" e1 ?+ W5 c
* P) V9 G( |6 N/ O9 C+ K- L

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

回帖

549

学分

1万

金币

论坛元老

积分
549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
7 o! ]/ o+ c( ~" I8 q& i9 G, U4 r$ `# q

9 d( e$ x& t% G' s/ S, m比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

54

回帖

62

学分

528

金币

论坛元老

积分
62
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
. ?, b# [: |& b# v. ]7 D满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

! V1 ^: k" H! x2 D刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

回帖

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

积分
3
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|小黑屋|中国病毒学论坛 |网站地图

GMT+8, 2026-1-22 01:37 , Processed in 0.067529 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表