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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

+ k7 s# E" p: H, m5 h" M2 d4 V
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
- ]  v; m% S' Y9 q8 j
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
7 `& R& x- D' V
——正式开始——

. N& M3 I- p# ^
1. 折线图

2 R2 ]3 C1 T5 R% a& e
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
$ G5 Z. ^8 _6 `1 M5 m
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
0 V8 T: l6 C$ p% x
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

- o+ V- F. T9 y8 I
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

: c; m* P& \' _, v$ p, D$ h

7 \. t7 X: Z3 O7 b+ k
- c0 l) Z/ ^3 h9 B3 z
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

/ o' M/ o: \" B+ ^! ~
9 f+ m$ T+ b' O0 A/ l; L" S

% \+ l5 {; h/ p) y! `: ]
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

/ h( J4 c% J2 z8 O% p5 |( Q
3 c+ e. [8 @) N8 S, \6 R
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
3 d; y# }! p4 K  [

1 B9 H5 Y( N- f- k- }  S) O
4 ~' i- f" X* |: U
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

( {' K  ~" y( S: M( W1 n  c

6 W1 n% [: P6 o& g1 y
2 Z) D$ U4 m( T( ^; y6 ^
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

" P, |/ Z" y) p
/ ]* @3 q/ Y9 y% N8 E
) T# P6 c) O5 Z  x: |( K9 M
  在Data栏中输入数据
7 [9 [1 N* D- W- i0 b' R; }" H

! [- b1 l% w  x! h
$ l5 K# p* w  e; W9 J
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

1 S2 Z( Z; w$ Q/ l/ s# o

: Z1 O2 w& F# S5 [
! n( }8 ]4 i# _
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

9 S5 i3 X  n* X$ |7 h
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
2 J- Z2 |' y- U& F7 n2 Z
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

3 P) I+ d) d* f0 s1 M" x
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

6 W% x! B) S' x3 U! H
% y4 r1 Q$ ?6 n
1 Z0 G3 c) P( \
在data栏中粘贴数据,如下图

. g, Q& Y: p" ^# u$ k
# ^. F% [5 H- t# I

* v; ~  A% P$ c' I
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
/ J; z3 @+ `  ]6 z0 J

4 t+ k, m) I8 x8 D
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
, P3 e  N" j0 g' j+ i
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

% M% h: E' t! e+ O

7 f! R2 D, ?! X+ Q* `; K" F

/ T; [2 K! P- o
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
4 S4 v0 A( S, j3 F+ K- A2 \
4 ?* \% e: ~9 s+ I2 W. V

6 c5 J. h* _9 O$ w6 ^
  将数据粘贴进去

% {% e, L5 X! c" u  O$ O! r
. g$ W3 @8 _, `- Z! H
- v9 w- ?! s' W) @  {- F2 ]: W
  软件即时生成的图如下图所示:
) s& x% h% k: k# F2 I  j; i

) O2 F3 a- R" U( O6 E
* b. I% _. w* p, F6 Z
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

6 \& E! C$ d. n$ v
2. 柱状图

# K. ^' f" Y+ K/ @% g; b* _
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

- I6 z4 t6 a) [5 n9 P
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

1 V+ c7 U/ r- \+ c1 e
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

! I& q% n0 K3 m0 W+ r1 Y# p: X
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

+ g2 _, L- a: K5 v% K8 b+ j( ]
# E& \1 Q" D. e: E0 S
+ Q" ?. M8 ^$ v1 r. h  u6 H$ q
在Data分栏中输入以下数据

1 x7 i/ g# D1 q! m5 R9 `

- n5 C# I- r- j9 U$ e

% {3 [1 X5 j# A0 Y  A" M7 N
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

& ?+ J" i& ~) S% G5 ?% Y% b$ {. X3 s
# |- s$ _5 ?, q* m1 T
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

6 Z: s$ x" m' w( O6 u* L( o
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

' |' [. T, @+ }# G
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
  u2 E/ N) C+ ], a  T* q
+ F* K& w7 j: ^- w) s9 h/ M" j) |1 S
6 j  y7 s* j5 j9 m9 t- N4 L5 m
  在Data分栏中输入以下数据

0 a& {! Q5 `0 b5 `

( y1 C* d9 s3 x6 R' R
) E1 ~0 i9 @# y% n& N) q; i
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

- z, I( f3 G6 [9 t

8 C2 R7 a  |& f' i
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
* o8 A' O: v4 R- u$ i: a* \
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

. }; z9 ?+ [# n+ C! {
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

" p# C# E! N) m1 S  @8 V6 ^

# l& ]1 P4 ^/ X% o

5 Q5 k0 z, j( v
  软件及时生成柱状图,如下图
# A( \2 }! {3 ?( C  ^* w! l

9 }4 c2 k. l0 T9 c
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

% c5 Y: j# ?5 ~$ f( U0 n- i3 k; w
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

3 o' v3 m# O3 O8 B7 D( _2 i
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
* A: I! u  Z( H+ w
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

" f8 X! T8 K: [# ?' d2 v

* g& X! L' w5 ?: v! W

) }$ O6 [4 ~* C# H
在data栏中输入数据
  N2 Q+ A" I$ h7 Q5 a
& T- X3 S2 i6 t& J

* q6 Z2 }2 }  l) |
软件即时生成的图如下图

5 @$ z" q. [) y1 |$ D

  N# s' {+ c0 S" y* d

5 x# S7 ^7 z0 N' `" h/ m# S% V
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

' y2 I* T. W/ R4 `* N3 w' M
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
% d% j0 H' P2 F! q1 l
3. 组合和导出图片

  g6 O( S3 m  I. u! x  b
点击layout栏,出现下图所示界面
9 \& w+ W7 a( o6 |* K8 e
+ F0 s6 W( I; M. x# q3 ]

# T/ y4 A2 W5 L. S2 m8 v
) p- I8 k2 Y/ f6 X& A8 Q: i3 x
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
$ W2 z  K; g* a% D  O+ ^

2 h+ ?# @: C* R
' ^8 C, s- S+ I! _; X% S. s
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

  T- B; J3 T8 R/ C# D% A

5 o) I" S, I2 c
, k; q$ q: g, n1 |0 D5 n1 q
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
: P3 N" w/ r( P" V
* t0 v2 n$ U! X2 ^4 W- f

4 w3 W" X" ?# _, z5 O& C1 b% M
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
; n/ Z. Z5 i6 d/ ^' J
) v, |4 ?5 L# n! ^  I9 Z# V1 G3 i

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
! R5 u7 z( ?8 ^% k3 R) g
8 Y8 a* F" f. _; M) r
5 k# k( G0 G- o# H比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
( l8 {" s3 P* l+ k$ `$ q( \满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
! T0 q, g# N8 i# B. I2 j& R. \5 ^
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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