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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

2 Z2 o" a1 Y& q
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
; H' r* L% j' ?! w3 E! d% G
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
* L4 q9 F. d' r4 q0 h# A0 d
——正式开始——

# ^; i0 t% E0 Y' U7 t
1. 折线图
7 p) E+ t: T  @' O; U
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
8 d# O; s9 L5 G
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
( e" f  d+ a$ y- [0 G3 _4 H0 w/ P9 A
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
7 H6 l: ]9 G5 f9 q3 J# G
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
% Q" b3 c8 Z0 h* H0 E/ g
( p, t8 b$ i( V3 m7 y, T

$ b; `7 y) ~* B
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
8 H8 O7 K5 ]0 l) ~
$ s4 H2 }1 D; g2 u
  q3 Z+ q" Y0 a" e) J; B6 u1 Z9 ^7 u
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

/ J: @  ^& h1 e$ G) ^- O8 ]1 r
& y# C% \5 U( s' T/ @' W$ B$ @
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

& @7 L# P( p( x1 k. W! g

! k' n, I2 P3 l3 l- q
# s* Z, x" u' `# C9 i
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

; T4 j! N) n2 k) a( }

% G7 T- L; m) t$ [, @  L
/ P' |; m: [8 E, q
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

& s, Z& r- y7 ~! v/ _! p9 Z
/ e( ~2 g+ H  U7 q, v5 r# p
0 S- n% v7 E1 ], l* Q) q6 I
  在Data栏中输入数据

7 t0 B- f2 h9 q( h) J- ?

5 h  r1 i+ C" m2 _; [& f+ c
( x0 @7 {4 U) o9 `
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
/ B$ `, U6 N" C2 \
: |2 U8 Z* A( R- a

# ?' r5 Q. h& i
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
% @6 T! i4 j& e6 T
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

; J/ g6 \0 l( L* o
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
8 U; ]+ W) a8 B# p
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

0 q/ e. H  M3 }; e" z7 o

9 A* `6 H) Z( d- ^8 X3 X2 w
# ?& \# I$ M) X6 M
在data栏中粘贴数据,如下图
1 E5 _; ]& U# F8 ]! L4 r
( `9 p" }: p' `) V, j: D. k5 ^

0 D+ ^/ X4 m" j* S+ R* L
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
7 H, m2 c+ o1 |+ o$ E
- i  _) S) O( ]
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
4 l0 J7 s7 B+ |0 ]* a; N
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

  L5 b3 P7 n2 g% ]' y: y
& I. e9 a8 v. E8 L4 D
5 k9 I8 ]4 L3 j9 V4 x: u7 c
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

: F6 b7 G" y) B5 ]- K2 n

7 \; e7 B9 S) d- f% m9 ?6 A/ }4 w& Z* @

" \: @+ A) ?6 i: h: }1 C8 G5 Z# ?
  将数据粘贴进去
& L/ p, h5 {( ]3 F9 ]1 v& ]
( s$ V1 l  h( k6 b  z9 f
  M9 _- U3 `& R" [5 i* N8 M
  软件即时生成的图如下图所示:
% q  B/ D) i5 F; h- S7 J

5 p: X. H: N; D& E8 f3 n
: R8 p- }4 |5 ]4 H! `/ k
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
& x0 Q( d! Y4 W1 T# F  ~" s
2. 柱状图

# |) i! ]7 N' r2 f( l
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

( X( G# M8 P. S0 D/ [2 Q
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
9 _3 {. r7 _7 ?) S- u4 q& W
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

5 R( w$ _2 O  `+ u  v; d
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

+ t4 ~0 w0 G2 _0 ^
/ i" r+ u' D* y" F, z  u

& T% q" o8 M7 C
在Data分栏中输入以下数据
: x& e, X2 k9 l0 z

6 b( K  F  B) z( e: y
; N) n1 l4 x6 F
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

1 W& S2 h: `: O# v

5 X6 E, L' w" J: h8 G6 S4 ?. x0 d
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
( T7 w. V" Y/ G0 Z3 [4 G8 a
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
9 T+ y( j' B& f4 x/ ]
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

4 `$ [1 ^7 o7 x0 q

; ~0 E. {( n$ g5 ^, D' o: B
" x, S, C$ W5 b. T
  在Data分栏中输入以下数据

& x# w3 B5 T8 W8 L: }  t* O5 p

) O" |; ]/ U9 ]1 d/ U+ t. U) D) ~. f
: i! I9 e5 ^  t& [0 Q  y
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
- [. c" i  F: H9 t# z, A2 ^$ x
& n. E5 ?% r- g# w. f; C
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
& b3 ^4 |" k: F) A5 a
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
8 y/ j/ U0 [( Y8 q& I
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

- X& w. c& [1 W& F) b6 l. n- Y- Q
8 }; k- _0 _& ^3 g& T1 R& F* D, i

4 u9 [; a1 B$ r' Y" Z" `/ k
  软件及时生成柱状图,如下图

4 h* }# q3 \# C: C# [( |
* |; N5 Y% b' w6 t/ d/ d9 p$ X4 h/ I
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

; q5 b- t( S' h, r
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

) f' r# F9 d7 P4 u' E
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
) X! |( [  l. Y+ C  ~/ q! d4 c
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
, y) e0 ^/ k% H1 f8 G" {

* h% V2 }  ~$ P, s- P  }
- g6 c: R% U3 ?) e' {
在data栏中输入数据

+ R% i# @, u1 p2 u
: C8 z8 _  L# ^' e3 L

) B+ @/ \8 I5 d5 `" j* D) [, d
软件即时生成的图如下图
3 K$ t. G* w* U% k

4 W; D7 W/ x% @( @! s

1 c/ z0 V% h9 J! {4 W
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
: f6 y2 I9 u, Z
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

, c9 }7 E* ]6 S
3. 组合和导出图片

; T# @+ l& X# s5 i. V
点击layout栏,出现下图所示界面
! O- z% b& U9 m  p
1 Y( S# z+ B4 i( Z  i& ~
1 X3 C: f- j  U. Q8 ^/ j

& u, _6 b) @  S2 V0 L
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

. c0 v6 R( X2 j, f9 L: A
& [! D2 X2 C: [/ ?( ]2 u+ n5 L/ |5 u

2 e0 l+ J" K" Q4 V$ P6 }% Q
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

* m1 ^6 \! a" X% v2 M5 j' u" y1 c1 t0 q
8 _+ E) Y: h3 b2 G

( r4 J- I( r' f/ @
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

# p, i! x, w& d/ M- l2 |# v* k/ R' R

( Z3 b, S) J0 L  v1 u& R
( ~# B9 P: O" _2 i) @$ p
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

1 g1 K) K% q' u- s) `9 I
1 ^' b" A$ b6 _2 b4 z

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!9 x  x) S( d2 X/ s1 k% B& K7 F

* A( Z$ l& B  [/ P' t% Z: N6 T. Q& A' A1 x- z4 B5 Y( f0 _( m" O
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
  ^" c# b) h  i8 I1 w: l) L满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
1 H" ]% P/ G/ W8 z% k
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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