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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术

4 A. D  |. q5 O( p( e
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
4 w- @/ ^9 k7 K3 j1 l
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

0 D: y5 f/ \2 j8 H% i* |
——正式开始——
, a6 d0 U7 x% r% S
1. 折线图
& t; ^- W7 A* |" V* G) _. Q
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
7 h1 I7 l1 e7 F$ Y$ \' U
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
4 T( z6 a6 o" m% w% L
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

4 P& G: `6 _2 |  j% h: \6 ^2 P
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
1 P4 L) O% Z! M7 L: M

# F# ~6 ^5 d# l/ _& \# v0 H: O
' G& g) U: v& y
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
, j3 H* I8 ?( x5 V+ |1 `* b

! k. p6 J, Q2 J" q& `8 B0 v2 c/ n& I

7 M- ~1 x2 P7 k* e- `0 k! X9 w# y, |
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

0 y+ ?1 W" b0 X
7 ~3 ?. P4 t/ k, x; M/ j$ h
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

6 |* ^/ I! E0 D# H1 i3 E1 H

' t& m7 \; ^$ n# L- {# M
% E) G' h. v7 x% d4 y$ L
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
; \1 h; ]+ ]7 k! g9 T# s
# j7 G( R" G4 O0 f8 M( r

) ^) m" W) N) L5 B& r+ |
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
$ P/ o8 {2 b6 H

6 E7 @8 e+ \0 j: G! t
& l/ w1 C& l- _3 \( E
  在Data栏中输入数据

  ?. x( V8 z  D4 {3 M5 P/ w1 l
* S/ s. P8 v* Q* a
% s4 ]0 |+ [5 K  B# z" i
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
6 G4 v, O% _! l

0 r' L. ~- ?+ R1 T9 ?. E& s6 s0 s) x* ^

3 a( C$ l. U+ S+ z( X9 ]" _; i
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

3 ^; ~! y9 ~  \8 R/ d/ X3 O! D
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
% S: ~4 i2 ?" F8 ]7 \8 s
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
3 [/ m; W% F% t* R) R
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
; R+ g+ E4 F, t# h
1 V1 B& X1 W5 ]) V5 @" u
- n# h% a& v! S" x# ?
在data栏中粘贴数据,如下图
+ v( o" ]. j7 B

- ]& O  k) B8 w. a) Z

( B% X: G, N( x( o
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

& t0 d- }. E6 a+ r) E' W

; k3 @& ~# R  E
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
& b4 p; Z& V/ G" n! D3 u3 y
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
9 K3 ^8 I) d5 r( C7 `( I6 l

5 H/ ]% B; h: p' w* C

- l3 P! O" J) X7 ^9 D2 j
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
  b5 h, P: T, l# a& v. v) R4 X
$ ^3 X; c% X+ h, X: ?

; ?2 w, m* L7 c/ W( l. P1 @
  将数据粘贴进去

4 ~4 E! \" t1 s. g. ^

; A2 w8 U8 B; P6 l0 |: W
. O7 a( a# s- b
  软件即时生成的图如下图所示:
! i- f% F6 p9 r1 r6 o8 B

4 \7 m: B1 b" K! C
- M; @/ W; ~1 o0 D1 [( q
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
' K' m4 J, Q5 ~/ |! v
2. 柱状图
3 d" C& L5 M% b: m+ n- P
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

. g. K- J! p% `" w5 s! J, F
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
, u+ W- f* `- D
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

( C; b+ t: C' ^1 d) n; f
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
; H1 O2 t6 l/ s( f  w# z- t( g# r
2 Y" t3 n. j/ G& F- g

! }; R; p9 s! X- {* R0 E2 E
在Data分栏中输入以下数据
5 \  n6 |! `4 w& {5 A9 }/ l% K- }

4 P* \; Y0 h1 x- b" l& p( A- M6 w" g
# I8 k  y# A5 U" b
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

$ ~8 T/ ?7 A+ c4 e) j" A

9 v0 M* F, `* B- _, I
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
7 R$ Y6 W# l/ @# T. q7 \
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

) j9 _3 U  H8 ^) g' J/ _  e7 q5 H" h
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

( F6 {+ @" ]4 ?" g
& a) }# g! r: @6 ~7 y/ U+ R
$ P7 }" _2 w9 J2 b/ i
  在Data分栏中输入以下数据
! t4 }2 a( f; i* _0 F1 }" q& T- H
7 f2 N* L" v' z! v

" ?( Y7 u0 T! z% c/ R3 Z
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

7 ^7 n( _! J+ k" r  v$ a

# l% m4 a/ C5 g2 o% o
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

& s; n* f: B: h$ q
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
* |5 I/ Q$ {4 ]
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

) r4 \; H5 c1 h; \
% ^& b' T0 R7 G' ?* z+ P

0 t, J6 `* c: t9 O. ]
  软件及时生成柱状图,如下图

) w. w9 T( L7 X/ w  R% o' x7 l2 [, |+ w

" {- @1 q6 N. Z; t+ e# M
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
8 m" ]! `* ], e: H* V' Q7 o
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
3 l! r" T+ n5 ]: B( J: Z) N
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
; [! ~4 p. n7 E7 i
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

# m7 v3 m2 g& Z* d2 ?1 ?8 v3 A

6 d5 Y1 q4 m2 \& T0 n" D! Q% \0 m
0 O9 [0 \  U/ m. l
在data栏中输入数据

0 W0 O% b5 t4 J0 K/ s3 p

7 W) j9 O- M' c/ S
9 s& s) W5 I. i& v7 T0 Z# I$ F
软件即时生成的图如下图

% d/ M" f# [  ?$ X- G2 [

2 P1 x+ @4 V' j7 ~! R

3 D; s6 v7 _. A, z3 L
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
! v1 G: e% o1 o' s! D, Q, j  U* a3 J
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
* ^6 Q' Y' f; I6 ~# u5 [9 i
3. 组合和导出图片
1 S; I* i+ R/ H: F- b
点击layout栏,出现下图所示界面

0 i1 S. F' i  v3 c5 o

' x: C% u) m) k0 |- k

# c6 E7 p1 V+ n4 H' Z7 E
. ?3 I* p' T: ^7 v
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
; P. q0 x& C' g/ A1 G
: q* @4 y9 p1 ]: L) b
; u/ |- Q3 i- |/ p5 u9 Q; i
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

& f( Q8 S5 z6 u/ m
0 r4 d' U0 u7 U* g2 X* Y5 C" s( d

+ h4 _/ y/ x+ d( O8 k  b( y1 V
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
" D1 U" U3 R! @( \+ A

% z- g: Q* ]% u

6 m8 B* T, s) e  q3 t% |% v$ }8 A8 s
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
3 O" g% q0 |4 W- Y7 c
) M) R' f8 o* M4 V2 W/ S

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!7 u5 C& B4 Z9 e6 b
. i. b4 {$ E8 w4 |( t/ r, K! q& Y& r$ B0 R

) [8 Y7 I- m& e! n# I1 y比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:128 H* |9 K3 D/ @
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

+ I" s' _0 C+ i/ ?4 v刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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