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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
* H6 [( A) [& y" @$ d& w
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

% z5 ?) ?3 J0 f
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

: F1 w+ M7 d& ?) j8 p: M
——正式开始——

4 z4 M! l, K7 N. z
1. 折线图

( z3 r2 N% ], o) _
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
  D* T9 d$ {# v5 y+ v0 u) M% j
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
6 [4 I; t0 A7 `
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

+ n5 ~0 }: g+ P7 d0 l* r8 O% R% i
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
4 T& o) |1 y) N! r+ u

6 f* t& ^4 \) J1 U
% Q$ W+ e) C* O0 K6 ~3 G  a
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

% V- }" M, k0 S3 p7 O' h0 ]# \

( _6 u0 m' o# F" T8 B: S
% n! J8 r) W- y; r# |- a
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
1 v8 g0 k+ E2 A& C

/ B" e9 r  B: [2 o3 G
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
. S# }; a6 S# Q+ Z& s
$ f& J1 e( s" M8 ^1 L& Y! L6 u6 F" G

2 c3 Q4 n& r, G; D2 R/ L
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
6 c1 {, [. K: M: m( y! _% x
" I" ^9 l6 M- T) R

$ ^& b, e3 u8 U, P2 d' \6 L8 y
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

4 ~7 ?, r. M2 V* l" F! R7 N

) X: W3 ^9 N+ ^0 l& L' u
0 S: s" r3 M- l- }# n
  在Data栏中输入数据
* }  ?% k+ ~& O% i+ g

. N( Y$ ^4 a- g: c

: b8 |$ \8 M- o; O- R7 R3 k
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
" k; h% v  S; I$ v& D' t6 p* @0 ^" c

" M" m. V: \, i6 K* S
/ R3 J; b6 C# z; a0 K, B  d* f: _
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

; {3 T! E4 C3 }& f7 j
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

  \; B* ~) b5 a" a5 q3 E  L8 M
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

1 Y4 w0 {3 z. [6 v- h, b
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

6 L4 n; E6 p0 R/ X. }- @
: E" ^4 }4 h) J8 T: H8 I" J
" `5 B2 `2 |) {0 A: |" u
在data栏中粘贴数据,如下图

7 V9 A3 v9 c3 t

% x/ _) V& L0 B4 O" Y+ I. ~6 w' a
5 c( }! F6 D* ?* h  _
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
6 W5 G7 B5 j- g4 L5 S2 d* H$ J8 v
4 z* W; P/ {+ V& n3 b
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
1 K% \1 n% P2 t4 e
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

, t( r( t+ v- _2 ~

/ I  ~0 d; Z5 t( l7 A  U) S+ Y
6 N, Y$ y, s" p% b
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

$ S0 F! A" \: r0 m5 z
9 q) N/ f5 s6 _! u0 X1 J# h

" i4 x7 [, O( m- w$ z0 R5 B5 p( @2 _( ]
  将数据粘贴进去
5 H" b# d, k2 O- d! p

! z" C7 j; ?; C4 E% W4 S: a9 O

3 w* f$ a6 X7 e
  软件即时生成的图如下图所示:
3 f* Z$ S' \  l' ~  Y5 u
+ j+ D+ V; i3 s+ N8 c+ {, p5 x
* ^4 m! f. J: H; n, S/ l' U4 M
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
) \' \8 i& p/ A1 O( `
2. 柱状图
0 Q  q# z) o, {, r
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
: _  |& M( |# j4 D) S
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

* R5 P% ~8 m) ^" a/ K
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
3 H0 G! Q) x4 F# o
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
9 u9 J+ j. b* |) e# v+ c
- [; a! H( S+ Y
- d& `8 O- X% }' d  @1 R$ H
在Data分栏中输入以下数据
) a) q5 i+ r! X, m& M8 I. h4 N# s# h

1 r( i, \- z1 ?- W0 O
+ u* Q! m9 J; B, v) C
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

4 l6 b6 [! v& a) L

; g  o  o* F$ z* z" H* K
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
% @+ t3 B* q8 t: `0 \' y" g% h# w) l
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
3 X0 o/ z) Q" Z& u6 T" i
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

4 Z5 q6 Q4 S5 Q* G3 m, F

) h, ^, c' A. j1 P# [
6 \6 n9 H& C. f' _1 u
  在Data分栏中输入以下数据

) H" j0 f; i: m/ D  t
) X1 _5 q1 A/ d; o5 K/ a& j

. }- U1 a. P% O2 S& c% q
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

, Z: [# T3 t; Q8 i$ d* h

9 y7 j3 |4 }: J# T' _2 J* v
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

* Z- p- ~9 t! u
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

, r$ R5 a3 e. Y" m/ ^
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
' g$ R( R0 D* I3 S  h

; O$ a# S7 C7 a0 e4 t
/ d0 v% D- F' j9 ?3 M! w$ ?5 _7 x/ W6 {
  软件及时生成柱状图,如下图
3 T4 ?- d  d& `& o& w

% v# O9 [" H5 m8 |( h. G$ Z5 O
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
) R, A' J8 f. E% z1 b
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

& H; e$ R/ k# j. J
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

7 K  D, a- J/ Y7 W* [
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
* V9 w% o" z! C4 q1 V$ v8 Q

' N: y( i5 ^" H
3 f  _+ m: T! z% [2 `. F
在data栏中输入数据
9 c) V) o% W2 W2 k) o

- E, r( \% B* @- I# b

- E# o8 s- i+ h" o% `  S, H
软件即时生成的图如下图
1 D3 t: H9 R5 P/ c- D9 ]
. U9 W$ y5 W3 q; ^5 ~

" m' t$ a+ y5 ^7 g6 v. O
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

1 |4 Y7 ~# W( t& e. |; a
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

2 G) m8 Y# _$ a7 K
3. 组合和导出图片

3 O9 }+ ^+ F/ A' J9 [& Y
点击layout栏,出现下图所示界面
. B3 X& h1 v& Z0 Q( c
6 P5 A$ [8 C7 g, M- j; {' Q' Q
: E* Z" R3 |: }, K: L5 p! g
3 R( \3 q1 @/ N% S9 n+ f
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

4 R* o5 }6 X( P

+ _+ r& B: ^2 A2 N/ e8 K
2 @( p  S4 z' N5 e( Q! a4 e
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

1 S  c# ^* S; ^* V

0 t5 @) t# ]$ s$ C6 g8 z
1 S" M& N4 p: ^( N2 S
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

$ n, D! g! u8 |3 S
& `1 L- O+ o( L# n7 g

" H9 B( k1 l3 c* J: a' y2 A
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

( }7 ]* U8 `5 c% P7 D

' J9 v2 {: X. U+ i

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!" `$ X' M: ]7 V8 V" g. i* n5 m" B
, A+ T" l0 K0 T
7 H) M) B9 g1 E& E! [! ?
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12" Y7 u# F# Y; R4 L9 A
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

) J, `$ x/ x3 T" x5 m刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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