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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
1 o  X8 ^! y; H1 b0 d( X" u6 U
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
- g! F% W/ K! D) r( s: r' @* U
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

. D2 I# ?! N  N6 ]
——正式开始——
0 N/ ]8 O2 n( L* b! ^
1. 折线图
- Y) l/ {( D4 m2 c& g5 n
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

; q/ s" Y0 y2 u' Q
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
+ m6 p5 a5 Z# f( n5 [6 x
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
+ T: }# x9 _) p8 z5 W7 Y# m
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

& g% ]$ `; v& o) M! @! s" G
+ f- _1 a; f. {4 R& Z
# ^( L/ _7 w$ q# c
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

" Y" ]3 K, F6 k% ^

6 U3 k& d. {7 O+ [6 A9 A

. p* M/ z: ?1 X8 r( m8 z
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

8 P) H/ O1 @' s

, T' Y+ |9 O7 ~6 c1 w/ i; D
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
: A: g, _, C: X/ t. u$ _; }( t( P

6 @2 E( D8 b% B  R# s8 l. o

( N& F* E9 r% P+ r
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

4 Y! ^9 h1 l3 H$ p
0 q" q+ h* O1 ?0 Q' Z# ^' L( Y

1 A1 X! m( |7 @0 v2 ]
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
7 a( M- B- B6 k8 e0 X; b2 G( k

6 X9 w- J) D- k/ i7 r
" H$ w" T9 w( K+ D$ e1 {- v$ Z7 O
  在Data栏中输入数据
2 ]/ W' c# V' v" R

3 _/ ^0 o" A1 m* A

. y  n' Z& g: i4 O  I4 t' Y8 C3 K, M3 c
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

; ^3 t1 k& I' S

$ O' Y3 P8 R$ @- _1 _  ~
5 _- r: W; l8 b% j
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
! I+ A2 O! I3 Z, ?
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
# D4 |; b  C9 C' x9 J" X0 e( e: A
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

% S) z& {! m- I/ ^
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
- T% T! b$ K- u( N
: M. {! f) Q/ j; x  {4 [" {
# p7 y- M, p- d0 I9 ~3 }. \, N
在data栏中粘贴数据,如下图
( @! ~/ I4 E- ?) a2 w9 G- z

0 G3 l, Y  Z  A; B) Q
& ^, Q; U& D) _9 t9 \( |& {
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

( U/ L2 x  M) M" w# n9 F" ~+ I, v' ^

3 e7 Y( J6 B6 c2 _
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

5 v+ W, F1 `  m# a! Q" c4 W# \
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
) G/ B. G6 e/ ]; p/ N( h
1 E) g5 ]6 y2 s- c, H& b% m) ?( H

8 l' `) R5 u% t6 T/ h" j5 Z4 W
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
( @) A7 D: a& X. f
% m3 y! A2 c9 ~* H4 }7 f" k" h

1 k8 W" J( @6 H" v
  将数据粘贴进去
* C$ f, ?8 S, N" h% N" f
- N. F; k4 l5 i+ C1 Y

1 P& m( b; Z' Q9 q) E. |
  软件即时生成的图如下图所示:

/ x1 {" N, h/ f' i  E' k6 v

1 i: P# X$ a9 m1 R  S

4 u7 u* V4 x* M2 v( A- }
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

  }" n/ k" y8 X- w+ k5 o" p  }
2. 柱状图
5 v- t3 T9 w% {; u3 y. W
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

! k; a! h, \4 L) e% i( h
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

7 w: j2 I# w$ _6 j+ R+ z, F
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

5 r: _8 P/ i6 U' s3 y+ m) f/ V
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

$ e4 J- w0 q! K% G$ i8 g. t

3 G( n$ x$ g; J3 ]
0 n2 ^+ o) n# s+ k
在Data分栏中输入以下数据
, V/ G2 n# Q/ r0 x; {
5 R+ O0 @8 A3 [3 ~& F& z, P
$ s/ y' |7 @. {# I. R0 r
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

3 J" Y. x2 J( I8 M# D

: G. V  A- ~$ {1 \* D- E7 K
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

# J; H% j) \% {
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
* r2 I; n6 K2 \7 }
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

$ R& D( l% r. Y6 ], T% d0 h4 L

9 h+ ~; v6 G' E$ J

0 {5 o1 ^6 ?0 g0 L
  在Data分栏中输入以下数据

# S% o1 Z6 l& E$ h

4 F- O9 P# _3 }+ Q
) m5 Y* W9 j1 O$ L
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
$ z* x; ]) a, r5 e
9 [. v+ n& E2 F- Z$ l! f# {
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
6 t& X) T5 u: K$ r4 N/ i5 x1 g
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
( D  o; d% y+ n
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

$ S+ Q1 ?- |7 l2 n' u( q- P
9 w& l# T. n; u" s: F+ g0 [

/ w1 Z7 v9 u  S9 {! W5 L- @
  软件及时生成柱状图,如下图
4 R2 o7 g7 \  y

( y8 g" O  Y- m4 p' d$ U
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
" k3 G- y" y/ m7 L1 U
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
2 G) t9 \* G1 T# I4 [+ B  ~9 ]
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
) M; c1 A+ [* F2 G
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
8 @$ P7 v4 ^& `1 P
  ?5 D; w0 ^/ E4 ~* V6 E' q

1 Z( v" P# m+ T( @  v
在data栏中输入数据

  k3 B5 S' S+ g: \8 n: K: ]: `* p; k, i
, d& r; P& Y# t- _: k+ @, T
2 B6 B) j- v( _  h: J2 ^
软件即时生成的图如下图

6 x/ |; s/ Q7 J% s
% s  V/ j% B: q

, N! N! r3 p" z) M  D, _
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

+ W2 M# }% V' `: n5 t
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
1 f/ C# W1 Z" L1 m8 d! |& a! a/ Z
3. 组合和导出图片
: K! P# ]. {8 G8 t7 e
点击layout栏,出现下图所示界面

2 A5 M9 ?: H& R

8 \6 B& B* J5 M: Y9 k& M# C
7 s* I' m! E/ q+ L0 p

, B( v0 h3 j, H9 z( ~. ~
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

' [7 ^5 a$ _+ R$ o" H, K2 W: Y
$ t" |. V2 Y1 b! ]& S. }: W8 u+ V& {

. P/ _/ Z1 ]' @1 v$ U) ~" ^+ |
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
' P; D) W( w! q& ~- A
) c, j8 _5 M- x& X- a7 D; x
( {* B6 {# k# M7 a5 d% @- `
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
$ I# ^; A7 v& y9 g) V  k
0 Q9 @( ~* V; W% U0 k6 r
! l' x& O9 K& g9 Z* i5 M
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

6 J2 m1 ~1 ~: i. f1 c: ~2 k  d

' i. g# S1 }2 _, k, }) C

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!8 _6 O. F+ P6 {: v9 F. F% y

8 R' K7 s% U& d7 U4 @7 A) r
0 K; \! A$ _, I5 d. u比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12$ n- r- K- J* n5 f- N' W3 Q- s
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
% E# b7 v" G  i# Q
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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