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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
0 @7 h9 R5 u* {
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
- Q# F  \" l6 e& b1 S9 e0 P
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

& ?  V. n- ~8 l7 v+ y% u
——正式开始——

  }& X* A3 K- a& X
1. 折线图
+ \) e5 }8 @; q' N3 O5 f: n
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
2 \( S4 P' i4 w& F4 \1 X% A0 T
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
+ |$ ^( C& p7 q! d/ v
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
8 n* x6 F+ [: d) m4 N* Y9 T) d
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

* V$ d1 w; ~* S* l6 H  U% t# }

& {1 [; n( {. n5 g7 `) c% z
! w+ A0 u2 w! j! [' f  j
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

, w- F% X* Z1 ^; i5 o$ B- R
; _) |. Q7 k6 T& Z/ m6 r

9 o7 R6 r" u9 y1 W
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

! S: F5 c  e& L9 O' w

, y4 v% F/ P3 J' J
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
7 U4 @! f; S- @% Z
  U& f9 F: @9 p
9 s. j  t6 Y1 U4 [# I
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

. [# I3 g8 d0 K! K9 C

6 S- b. l2 \" ?6 Q, v4 s

( N9 o& l! _: z9 u" c  F
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

6 H# j1 w& G) P; J
9 s7 ]& I  f' A( |# M* Y; H

7 ^8 G7 y* x8 ?
  在Data栏中输入数据
% L8 f1 W3 A$ O" E8 f0 e- a

7 f! m. u  G6 Q! N! \; U
2 u  }* f! C5 C
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

, I+ r9 ]  |. V& Q# p) G' b
0 _- ^( O  g0 K( f( I  j

$ D, Q7 W2 `2 f/ l
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
3 J1 v8 V0 r- r3 H
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
: u' |1 z) {( h! r% `
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

, }5 G- g; G" B; z5 i. x7 F
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
' l' z8 c- n, Y0 f5 ^3 C

2 b& K5 z; ?$ _( v- {# F

: W$ j" H) U2 M" Z* i( X7 ~
在data栏中粘贴数据,如下图
' C2 Z. e- F* d! E" [7 E/ A' S

7 w7 \, Y9 e/ z, Z. z
; R% a+ Q5 D2 Y  l# Q9 V( M
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

4 Q, u' q# t$ p/ s5 W

3 a, Y8 v+ [; ?1 |/ W9 E
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
& L8 Q* p' J/ ^' k
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
" l; L" P) O% f, D. s) K/ _) ^. a

( K! s% h- D; ~  D* i
/ O: ]2 q0 `. p4 N! v( E
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
' W! d9 R) m* C8 t* ?; v* z1 N. p
, y4 Q& T" K: R
3 Y+ W' m$ W' n; d8 `% ~8 B6 O
  将数据粘贴进去

/ ^* q' e6 l7 Q6 w

+ c2 Q! t+ Z1 H6 e. R: y9 |
- ]/ c: ]! G( m7 |3 U$ H6 k( A+ j
  软件即时生成的图如下图所示:
8 }: T7 K* L" R* p, @6 u

3 j- z( m: m, w6 U

6 F! t5 t1 I3 [! L& q4 q
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

& |  N* F: O$ n; \
2. 柱状图

( E2 k% A6 u1 {) S4 c
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
5 s- ~# Q  Q/ |7 m3 }7 O/ e
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

2 o9 W2 n. |4 _% V+ @
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

2 w2 c& S8 A  W2 e. n6 ?' h
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

; U0 p. d- ~! B( f/ h: w

8 g2 v5 L& j1 ?' O6 S+ t
" i; t( p0 R: O) G2 y4 T- k
在Data分栏中输入以下数据

! L1 ]4 g- R0 _' M& F

3 Q2 I+ i- b$ W" Q& Z4 {& U
! f* ?( T8 w- I8 z5 `; T  {
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

* j0 ]6 `+ l* m( x8 M/ x

& g$ G/ Z6 V( o. ?! A# o  W
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
2 f# l7 X+ q) F3 W8 r% {
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
0 o2 N2 n( f4 P* C& A& y0 ?
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
7 |; G+ r$ w. u0 W& l* _

( I! p$ P( D( ^% n

  E/ w; b3 J9 q) c8 y$ W5 U9 L6 F
  在Data分栏中输入以下数据

. p3 Q. o7 K4 S/ Q. d

8 ~8 ~( i5 C* a/ k  _
# P. G' d% q$ F) N/ {0 C
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

2 K2 o1 E5 ?/ Q: r& _

$ E" A( P2 _1 ^/ i/ {$ o
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

5 T* i. X- [* ?. R2 u- \2 W; ~
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

+ f- o( a7 j) @1 S1 O0 `5 {6 N
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
) l8 F! I9 v5 Z( h* m2 |. A0 ?. ^
, l  K* G' b8 C5 }$ A1 S! h
1 m% I6 f8 U+ r/ C% Z; W
  软件及时生成柱状图,如下图
) b0 F4 u+ c# d3 _; h0 }7 @
. a2 X7 D+ f/ D
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

7 m5 `' O! C4 f- s& t
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
- `4 o3 D, b, f& Z$ A# L% Z- T
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
: q7 R% ~7 H+ @
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

9 `. J$ |) \0 x9 ~4 O6 X& ?5 D( f
# `  p9 i4 ^5 ^
" s+ w- N! Z4 ^4 l9 Z
在data栏中输入数据

/ E0 A5 B' ?3 F, m( f
: s* n  S" E# b9 L# q) f$ e

) F' g0 R/ z8 Q6 z0 {
软件即时生成的图如下图

+ q% J( J( ~3 r- t6 Z- I+ S* i+ F5 ^

$ P, e7 k) p" x9 v/ N8 F  y+ a% X

9 [6 z' g- {& j
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
# V# i8 c' f! y( D
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
* N$ j! _0 [, ^8 d% d
3. 组合和导出图片

! M. ?' r+ x5 M; v6 G
点击layout栏,出现下图所示界面

2 x5 R1 Z9 h, Z  e8 N. u- e0 d. c

' @7 Z& A6 c& P: B
' R8 Z4 j! E# Y& P2 \6 j1 W

* L2 L4 {% }! s4 G
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

8 i9 `" R) `( g( s6 [
6 N2 _$ Q3 ~$ {/ F+ n* w: }

2 W7 @) k7 _: ^' f- X+ f3 B
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

4 e: P5 \1 G1 a5 v' f. F  g
, u8 J+ U' e/ `
- i; v4 w$ B  z4 z8 p
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
, v5 H9 {) N: D* S) H

0 I. i- }/ ?1 W4 F! o
% p; s6 N' b" r) \! }* ]1 n" [  L( N" t
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

5 l7 p& {! {; I  W
7 m1 K, D6 j: X9 U, p" h

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论坛元老

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

174

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论坛元老

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549
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
. |3 g4 Q, t: s% M  r6 F
" M* L6 \" w$ y& `  P, p2 N4 u, @( V1 P3 U+ P& n. @: j2 [6 ~
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
" ]: s. S# l, g4 X/ b' Q( O5 ^, s满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

- g3 s5 G3 _  A; [刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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